More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2732 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2732  lac repressor  100 
 
 		 357 aa  720    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.02392  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1262  lac repressor  69.66 
 
 		 357 aa  480  1e-134  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000349798  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1363  lac repressor  65.27 
 
 		 358 aa  474  1e-133  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.269161  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1769  lac repressor  64.99 
 
 		 358 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.044739  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0418  lac repressor  56.5 
 
 		 360 aa  385  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000822114  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00299  lac repressor  56.21 
 
 		 360 aa  383  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000126874  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10002  Lactose operon repressor  56.21 
 
 		 360 aa  383  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000792391  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3261  transcriptional regulator, LacI family  55.74 
 
 		 363 aa  383  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000862656  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3280  lac repressor  55.74 
 
 		 363 aa  383  1e-105  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000820962  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00703  hypothetical protein  56.21 
 
 		 360 aa  383  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000122917  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00303  hypothetical protein  56.21 
 
 		 360 aa  383  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000170376  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0409  lac repressor  55.46 
 
 		 363 aa  382  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  3.9973e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0369  lac repressor  55.74 
 
 		 363 aa  383  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000375664  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0376  lac repressor  55.93 
 
 		 360 aa  380  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000396722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0927  lac repressor  55.87 
 
 		 355 aa  373  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0196781  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1283  lac repressor  46.22 
 
 		 357 aa  309  4e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0922  lac repressor  45.07 
 
 		 357 aa  298  7e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0976  lac repressor  45.07 
 
 		 357 aa  297  2e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3358  lac repressor  45.07 
 
 		 357 aa  297  2e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2013  lac repressor  39.61 
 
 		 356 aa  248  8e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.735803 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0371  transcriptional regulator, LacI family  41.69 
 
 		 339 aa  248  1e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.802173 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0219  LacI family transcription regulator  40.92 
 
 		 351 aa  232  8.000000000000001e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2892  transcriptional regulator, LacI family  39.39 
 
 		 340 aa  231  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.207309  normal  0.956989 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6224  HTH-type transcriptional repressor PurR  39.7 
 
 		 348 aa  219  6e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.348111 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0870  LacI family transcription regulator  38.58 
 
 		 328 aa  219  7.999999999999999e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06900  transcriptional regulator, LacI family  37.92 
 
 		 339 aa  210  2e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4716  transcriptional regulator, LacI family  41.78 
 
 		 346 aa  210  3e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4680  LacI family transcription regulator  38.39 
 
 		 336 aa  209  6e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0406203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0241  transcriptional regulator, LacI family  38.19 
 
 		 348 aa  204  1e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.268594  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0495  transcriptional regulator, LacI family  38.69 
 
 		 335 aa  203  3e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.448967  normal  0.778992 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4997  transcriptional regulator, LacI family  40.84 
 
 		 372 aa  203  4e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.385337 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0379  LacI family transcription regulator  40.91 
 
 		 342 aa  202  5e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.676966  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3275  transcriptional regulator, LacI family  39.34 
 
 		 333 aa  202  6e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.183529  hitchhiker  0.00604574 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29490  transcriptional regulator  37.99 
 
 		 340 aa  199  7.999999999999999e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3665  LacI family transcription regulator  34.91 
 
 		 343 aa  195  8.000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1860  transcriptional regulator, LacI family  37.2 
 
 		 338 aa  193  4e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2947  regulatory protein LacI  38.96 
 
 		 359 aa  193  5e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.407921  normal  0.301474 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04300  transcriptional regulator, LacI family  37.8 
 
 		 352 aa  192  9e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1918  LacI family transcription regulator  36.92 
 
 		 368 aa  190  4e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.04786  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11590  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 362 aa  188  1e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.042152 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1925  LacI family transcription regulator  36.34 
 
 		 358 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.149363  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  35.14 
 
 		 355 aa  184  3e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06590  transcriptional regulator, LacI family  36.22 
 
 		 359 aa  183  3e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0210  LacI family transcription regulator  32.52 
 
 		 353 aa  183  4.0000000000000006e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000188149  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4084  HTH-type transcriptional repressor PurR  35.42 
 
 		 346 aa  183  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.932111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4705  transcriptional regulator, LacI family  36.18 
 
 		 359 aa  183  5.0000000000000004e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.102612  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  38.55 
 
 		 353 aa  182  8.000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3042  transcriptional regulator, LacI family  36.36 
 
 		 359 aa  182  1e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  37.98 
 
 		 349 aa  181  2e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0100  transcriptional regulator, LacI family  37.72 
 
 		 348 aa  180  2.9999999999999997e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0658146  normal  0.053402 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  38.37 
 
 		 368 aa  180  4e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2577  transcriptional regulator, LacI family  36.75 
 
 		 346 aa  179  4.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.215831  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2370  ribose operon repressor  37.57 
 
 		 338 aa  179  7e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  36.42 
 
 		 346 aa  178  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  35.69 
 
 		 337 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  33.54 
 
 		 331 aa  176  4e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  34.74 
 
 		 386 aa  176  5e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0006  ribose operon repressor  32.32 
 
 		 334 aa  176  5e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.038565  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4592  LacI family transcription regulator  34.86 
 
 		 327 aa  176  6e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0748  transcriptional regulator, LacI family  35.19 
 
 		 346 aa  176  7e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0494571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0512  LacI family transcription regulator  36.2 
 
 		 336 aa  176  7e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  35.55 
 
 		 346 aa  176  8e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  36.36 
 
 		 347 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1525  LacI family transcription regulator  35.57 
 
 		 343 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  31.53 
 
 		 341 aa  175  9.999999999999999e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4748  LacI family transcription regulator  35.28 
 
 		 343 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1506  LacI family transcription regulator  35.57 
 
 		 343 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1129  LacI family transcription regulator  34.99 
 
 		 343 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1609  LacI family transcription regulator  34.99 
 
 		 343 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0684889  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1586  LacI family transcription regulator  34.99 
 
 		 343 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122412  normal  0.650271 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.94 
 
 		 336 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1628  LacI family transcription regulator  35.59 
 
 		 343 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0632  LacI family transcription regulator  31.45 
 
 		 344 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04250  transcriptional regulator, LacI family  33.04 
 
 		 337 aa  173  2.9999999999999996e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.335349  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2154  LacI transcriptional regulator  38.26 
 
 		 338 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0306626  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1128  transcriptional regulator, LacI family  33.04 
 
 		 361 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4233  transcriptional repressor RbsR  32.72 
 
 		 328 aa  172  7.999999999999999e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00129115  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1234  LacI family transcription regulator  34.97 
 
 		 343 aa  171  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50127  normal  0.134178 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2250  DNA-binding transcriptional regulator CytR  34.63 
 
 		 335 aa  171  1e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1922  LacI family transcription regulator  35.42 
 
 		 339 aa  171  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.704174  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4639  transcriptional regulator, LacI family  36.33 
 
 		 357 aa  171  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.496087  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04200  transcriptional regulator, LacI family  33.04 
 
 		 341 aa  170  3e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2022  ribose operon repressor RbsR  35.91 
 
 		 343 aa  170  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.662423  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2472  ribose operon repressor RbsR  36.09 
 
 		 343 aa  170  4e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1857  ribose operon repressor RbsR  35.91 
 
 		 343 aa  170  4e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1870  ribose operon repressor RbsR  35.91 
 
 		 343 aa  170  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.585666  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2281  transcriptional regulator, LacI family  33.33 
 
 		 334 aa  169  5e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  33.93 
 
 		 339 aa  169  6e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  32.64 
 
 		 335 aa  169  6e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  37.06 
 
 		 340 aa  169  7e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0400  transcriptional regulator, LacI family  35.67 
 
 		 346 aa  169  7e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  33.33 
 
 		 342 aa  168  1e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3383  LacI family transcription regulator  35.26 
 
 		 342 aa  168  1e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3623  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.64 
 
 		 335 aa  169  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.487296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0777  LacI transcriptional regulator  36.66 
 
 		 337 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.185303 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39300  ribose operon repressor RbsR  35.63 
 
 		 337 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00488223  normal  0.347554 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3173  transcriptional regulator, LacI family  37.95 
 
 		 342 aa  167  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.579609 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000337  ribose operon repressor  30.27 
 
 		 340 aa  166  5e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4170  transcriptional repressor RbsR  33.12 
 
 		 341 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000181496  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1754  transcriptional regulator, LacI family  37.65 
 
 		 344 aa  166  5.9999999999999996e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000321603 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>