More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0303 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0303  LacI family transcription regulator  100 
 
 		 335 aa  667    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.139649 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0978  LacI family transcription regulator  40.12 
 
 		 339 aa  239  5.999999999999999e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1435  LacI family transcription regulator  39.51 
 
 		 339 aa  236  4e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0140184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3504  transcriptional regulator, LacI family protein  35.52 
 
 		 340 aa  218  1e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0875897  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1823  LacI family transcription regulator  34.23 
 
 		 341 aa  207  2e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.288921  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02412  transcriptional regulator  38.3 
 
 		 343 aa  204  2e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1772  transcriptional regulator, LacI family protein  36.73 
 
 		 345 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.297999  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1870  LacI family transcription regulator  36.12 
 
 		 342 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075643 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1655  LacI family transcription regulator  36.44 
 
 		 366 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.677065  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2244  LacI family transcription regulator  35.71 
 
 		 351 aa  194  2e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2461  LacI family transcription regulator  35.42 
 
 		 351 aa  193  4e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0661891  normal  0.518687 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2345  alanine racemase  35.42 
 
 		 351 aa  193  4e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2002  transcriptional regulator, LacI family  35.4 
 
 		 348 aa  192  6e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000460258 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1847  LacI family transcription regulator  35.71 
 
 		 346 aa  192  7e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2356  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.42 
 
 		 348 aa  192  7e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1769  LacI family transcription regulator  35.42 
 
 		 346 aa  192  8e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2252  LacI family transcription regulator  35.71 
 
 		 346 aa  192  1e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.305473 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1820  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.01 
 
 		 345 aa  191  2e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0392  LacI family transcription regulator  36.97 
 
 		 330 aa  189  4e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0318668 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2960  transcriptional regulator, LacI family  35.47 
 
 		 337 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.430193 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2196  LacI family transcription regulator  34.23 
 
 		 340 aa  187  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0908748  hitchhiker  0.000488625 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3237  LacI family transcription regulator  38.3 
 
 		 343 aa  185  8e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3960  LacI family transcription regulator  37.83 
 
 		 340 aa  184  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.292064 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1032  transcriptional regulator, LacI family  36.98 
 
 		 376 aa  178  1e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0226  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.38 
 
 		 355 aa  176  4e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.586057  normal  0.327461 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0597  LacI family transcription regulator  36.5 
 
 		 344 aa  175  9e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.10797  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0974  putative sugar-binding protein  34.63 
 
 		 340 aa  175  9.999999999999999e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1887  LacI family transcription regulator  36.69 
 
 		 344 aa  174  2.9999999999999996e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.587669  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0967  LacI family transcription regulator  36.53 
 
 		 352 aa  172  6.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.934127 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01891  putative sugar-binding protein  34.23 
 
 		 343 aa  172  9e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0103851  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1880  LacI family transcription regulator  34.69 
 
 		 344 aa  171  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.606893  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2185  LacI family transcription regulator  33.92 
 
 		 339 aa  167  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0591  LacI family transcription regulator  34.82 
 
 		 344 aa  165  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0167634 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4088  LacI family transcription regulator  35.06 
 
 		 337 aa  156  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2155  transcriptional regulator, LacI family  34.62 
 
 		 338 aa  150  4e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.677334  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1320  LacI family transcription regulator  33.63 
 
 		 342 aa  145  7.0000000000000006e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.593334  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6278  transcriptional regulator, LacI family  35.59 
 
 		 338 aa  143  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3304  LacI family transcription regulator  33.23 
 
 		 335 aa  140  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.547709 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0809  transcriptional regulator, LacI family  32.85 
 
 		 344 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.119427 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2737  LacI family transcription regulator  33.14 
 
 		 337 aa  138  1e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.771788 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3049  transcriptional regulator, LacI family  30.27 
 
 		 336 aa  138  1e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.490257  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0418  alanine racemase  31.16 
 
 		 338 aa  138  1e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.923997  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1895  LacI family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 339 aa  136  5e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.371942 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3721  transcriptional regulator  31.49 
 
 		 350 aa  135  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.940328  normal  0.590974 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0241  transcriptional regulator, LacI family  34.62 
 
 		 348 aa  135  9e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.268594  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2090  LacI family transcription regulator  35.58 
 
 		 338 aa  135  9e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0911  transcriptional regulator, LacI family  32.94 
 
 		 332 aa  135  9e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0283  LacI family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 342 aa  134  3e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.881799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3491  transcriptional regulator, LacI family  33.33 
 
 		 349 aa  134  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.201292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0134  LacI family transcription regulator  36.42 
 
 		 343 aa  134  3e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04030  transcriptional regulator  33.53 
 
 		 351 aa  132  7.999999999999999e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08380  transcriptional regulator  35.49 
 
 		 351 aa  132  9e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.689367  normal  0.241125 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  35.47 
 
 		 473 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4766  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.58 
 
 		 336 aa  132  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.148883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4021  transcriptional regulator, LacI family  34.56 
 
 		 350 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.613602  normal  0.127498 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3984  LacI family transcription regulator  33.53 
 
 		 339 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.125023  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1732  transcriptional regulator, LacI family  32.65 
 
 		 340 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521835  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  33.23 
 
 		 353 aa  130  5.0000000000000004e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2858  LacI family transcription regulator  33.73 
 
 		 343 aa  130  5.0000000000000004e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.640321  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3030  transcriptional regulator, LacI family  33.83 
 
 		 342 aa  129  9.000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0938  LacI family transcription regulator  33.23 
 
 		 340 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0104625  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0838  LacI family transcriptional regulator  33.23 
 
 		 331 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.620074  normal  0.213955 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3529  transcriptional regulator, LacI family  33.55 
 
 		 333 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  29.41 
 
 		 329 aa  125  7e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3965  Alanine racemase  33.53 
 
 		 338 aa  125  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.578436 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4257  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30 
 
 		 342 aa  124  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0325  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.05 
 
 		 335 aa  123  4e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0177  transcriptional regulator, LacI family  29.34 
 
 		 343 aa  123  4e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  30.42 
 
 		 333 aa  123  5e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2863  putative catabolite control protein A  28.09 
 
 		 332 aa  123  5e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.42 
 
 		 333 aa  123  5e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0566  transcriptional regulator, LacI family  30.67 
 
 		 328 aa  123  5e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2548  catabolite control protein A, putative  27.69 
 
 		 332 aa  122  8e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3394  transcriptional regulator  31.27 
 
 		 361 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.330741 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0352  transcriptional regulator, LacI family  28.75 
 
 		 339 aa  122  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1308  transcriptional regulator, LacI family  26.77 
 
 		 330 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0402  transcriptional regulator, LacI family  28.36 
 
 		 339 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000159796  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  31.85 
 
 		 339 aa  121  1.9999999999999998e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0870  LacI family transcription regulator  31.44 
 
 		 328 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4158  alanine racemase  31.61 
 
 		 416 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1789  transcriptional regulator, LacI family  32.08 
 
 		 343 aa  120  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0832  LacI family transcription regulator  26.9 
 
 		 346 aa  120  3e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  28.92 
 
 		 333 aa  120  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6720  transcriptional regulator, LacI family  33.97 
 
 		 374 aa  120  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.396206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0144  LacI family transcription regulator  33.53 
 
 		 375 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5673  transcriptional regulator, LacI family  33.14 
 
 		 343 aa  120  4.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.227027  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1561  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.88 
 
 		 348 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.63047 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0276  transcriptional regulator, LacI family  33.04 
 
 		 342 aa  119  6e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0752  LacI family transcription regulator  33.54 
 
 		 331 aa  119  7e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.477484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  33.53 
 
 		 337 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0413  transcriptional regulator, LacI family  30.47 
 
 		 358 aa  119  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1193  transcriptional regulator, LacI family  36.2 
 
 		 335 aa  118  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0624061  normal  0.122686 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0389  LacI family transcription regulator  31.66 
 
 		 335 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0127409 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4568  transcriptional regulator, LacI family  32.92 
 
 		 357 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4844  transcriptional regulator, LacI family  26.79 
 
 		 344 aa  117  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0280353  hitchhiker  0.000467686 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15580  transcriptional regulator, LacI family  29.24 
 
 		 336 aa  117  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2841  transcriptional regulator, LacI family  31.45 
 
 		 345 aa  117  3.9999999999999997e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.595775  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1520  transcriptional regulator, LacI family  34.32 
 
 		 338 aa  116  6.9999999999999995e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0658956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4288  LacI family transcription regulator  32.49 
 
 		 334 aa  116  6.9999999999999995e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0105352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.7 
 
 		 336 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348221  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>