More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2737 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2737  LacI family transcription regulator  100 
 
 
337 aa  687    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.771788 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4088  LacI family transcription regulator  72.11 
 
 
337 aa  509  1e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3960  LacI family transcription regulator  41.67 
 
 
340 aa  245  6.999999999999999e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.292064 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0392  LacI family transcription regulator  39.22 
 
 
330 aa  229  7e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0318668 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0226  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  38.11 
 
 
355 aa  219  7e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.586057  normal  0.327461 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1820  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  37.28 
 
 
345 aa  210  2e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02412  transcriptional regulator  39.64 
 
 
343 aa  209  8e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1772  transcriptional regulator, LacI family protein  36 
 
 
345 aa  207  1e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.297999  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1435  LacI family transcription regulator  34.93 
 
 
339 aa  207  3e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0140184  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1655  LacI family transcription regulator  36.84 
 
 
366 aa  204  2e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.677065  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0591  LacI family transcription regulator  35.17 
 
 
344 aa  203  4e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0167634 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2244  LacI family transcription regulator  36.31 
 
 
351 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2252  LacI family transcription regulator  36.92 
 
 
346 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.305473 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01891  putative sugar-binding protein  36.15 
 
 
343 aa  201  1.9999999999999998e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0103851  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1032  transcriptional regulator, LacI family  37.06 
 
 
376 aa  200  1.9999999999999998e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2356  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.38 
 
 
348 aa  200  3e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2002  transcriptional regulator, LacI family  35.38 
 
 
348 aa  200  3e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000460258 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0974  putative sugar-binding protein  33.92 
 
 
340 aa  199  3.9999999999999996e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0967  LacI family transcription regulator  37.54 
 
 
352 aa  198  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.934127 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2461  LacI family transcription regulator  35.09 
 
 
351 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0661891  normal  0.518687 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1847  LacI family transcription regulator  36.44 
 
 
346 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2345  alanine racemase  35.09 
 
 
351 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2196  LacI family transcription regulator  34.88 
 
 
340 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0908748  hitchhiker  0.000488625 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1769  LacI family transcription regulator  36.44 
 
 
346 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0978  LacI family transcription regulator  34.32 
 
 
339 aa  196  6e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3237  LacI family transcription regulator  36.28 
 
 
343 aa  195  8.000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1870  LacI family transcription regulator  34.8 
 
 
342 aa  193  3e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00075643 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1823  LacI family transcription regulator  34.37 
 
 
341 aa  187  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.288921  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3504  transcriptional regulator, LacI family protein  32.62 
 
 
340 aa  186  7e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0875897  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2960  transcriptional regulator, LacI family  33.73 
 
 
337 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.430193 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2185  LacI family transcription regulator  34.48 
 
 
339 aa  182  7e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0597  LacI family transcription regulator  35.59 
 
 
344 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.10797  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1887  LacI family transcription regulator  36.81 
 
 
344 aa  180  4e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.587669  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0418  alanine racemase  34.22 
 
 
338 aa  177  2e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.923997  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1880  LacI family transcription regulator  34.12 
 
 
344 aa  170  3e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.606893  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0809  transcriptional regulator, LacI family  35.1 
 
 
344 aa  169  8e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.119427 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  32.33 
 
 
333 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  31.46 
 
 
333 aa  159  7e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.46 
 
 
333 aa  159  7e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0832  LacI family transcription regulator  30.29 
 
 
346 aa  150  4e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2170  LacI family transcription regulator  32.95 
 
 
366 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.626121  normal  0.28501 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1685  transcriptional regulator, LacI family  31.94 
 
 
337 aa  147  3e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  30.47 
 
 
341 aa  146  6e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1725  transcriptional regulator, LacI family  31.23 
 
 
338 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  33.14 
 
 
339 aa  143  4e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0938  LacI family transcription regulator  32.54 
 
 
340 aa  143  5e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0104625  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1515  transcriptional regulator, LacI family  31.27 
 
 
339 aa  142  9e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1895  LacI family transcriptional regulator  34.22 
 
 
339 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.371942 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2863  putative catabolite control protein A  29.67 
 
 
332 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.41 
 
 
337 aa  140  3e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2548  catabolite control protein A, putative  29.38 
 
 
332 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0297  LacI family transcription regulator  30.03 
 
 
340 aa  139  4.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2870  transcriptional regulator, LacI family  31.16 
 
 
342 aa  139  7e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1320  LacI family transcription regulator  30.3 
 
 
342 aa  139  7.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.593334  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4116  alanine racemase  34.38 
 
 
334 aa  139  7.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0303  LacI family transcription regulator  33.33 
 
 
335 aa  138  1e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.139649 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4539  transcriptional regulator, LacI family  32.66 
 
 
350 aa  137  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.166389  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6831  LacI family transcription regulator  34.64 
 
 
337 aa  138  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  30.93 
 
 
329 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2090  LacI family transcription regulator  32.84 
 
 
338 aa  136  4e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04250  transcriptional regulator, LacI family  30.38 
 
 
337 aa  137  4e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.335349  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0366  transcriptional regulator, LacI family  35.88 
 
 
344 aa  136  4e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1883  LacI family transcription regulator  29.48 
 
 
351 aa  136  5e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0216034  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0699  transcriptional regulator, LacI family  29.08 
 
 
341 aa  136  5e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1789  transcriptional regulator, LacI family  33.76 
 
 
343 aa  136  6.0000000000000005e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1214  transcriptional regulator, LacI family  32.66 
 
 
333 aa  135  8e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000107104  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  27.49 
 
 
335 aa  135  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.71 
 
 
336 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3179  transcriptional regulator, LacI family  32.11 
 
 
355 aa  134  3e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.588941  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3245  transcriptional regulator, LacI family  29.52 
 
 
344 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3049  transcriptional regulator, LacI family  30.46 
 
 
336 aa  133  5e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.490257  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0121  LacI family transcription regulator  30.29 
 
 
335 aa  132  6e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0425024  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6650  transcriptional regulator, LacI family  32.66 
 
 
364 aa  132  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.17574 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2659  transcriptional regulator, LacI family  33.82 
 
 
339 aa  132  6e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.34431  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  30.75 
 
 
337 aa  132  9e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2320  LacI family transcriptional regulator  32.55 
 
 
340 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.316441  normal  0.202359 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2606  transcriptional regulator  26.53 
 
 
348 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2467  LacI family transcription regulator  31.76 
 
 
336 aa  131  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3304  LacI family transcription regulator  32.38 
 
 
335 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.547709 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4568  transcriptional regulator, LacI family  33.04 
 
 
357 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2711  alanine racemase  27.94 
 
 
342 aa  130  3e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000872573  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03100  transcriptional regulator, LacI family  33.81 
 
 
345 aa  130  3e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0219145  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00410  transcriptional regulator, LacI family  27.33 
 
 
337 aa  130  4.0000000000000003e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19800  transcriptional regulator, LacI family  28.01 
 
 
336 aa  130  4.0000000000000003e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1790  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.97 
 
 
337 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00351385  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1769  LacI family transcription regulator  32.01 
 
 
339 aa  130  4.0000000000000003e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.36 
 
 
336 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348221  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0686  LacI family transcription regulator  30.61 
 
 
334 aa  129  5.0000000000000004e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3030  transcriptional regulator, LacI family  33.14 
 
 
342 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.36 
 
 
330 aa  129  6e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2402  transcriptional regulator, LacI family  33.73 
 
 
346 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00787022 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4101  DNA-binding transcriptional regulator CytR  30.88 
 
 
342 aa  128  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.38 
 
 
339 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0279  transcriptional regulator, LacI family  30.32 
 
 
351 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1550  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.43 
 
 
328 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000390905  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0115  DNA-binding transcriptional regulator CytR  30.88 
 
 
342 aa  128  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0134  LacI family transcription regulator  32.1 
 
 
343 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1561  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.95 
 
 
348 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.63047 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  30.21 
 
 
368 aa  127  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2281  transcriptional regulator, LacI family  32.25 
 
 
334 aa  127  3e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>