More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0967 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0967  LacI family transcription regulator  100 
 
 		 352 aa  707    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.934127 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1880  LacI family transcription regulator  49.7 
 
 		 344 aa  315  6e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.606893  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02412  transcriptional regulator  42.47 
 
 		 343 aa  250  2e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0226  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  43.2 
 
 		 355 aa  240  2e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.586057  normal  0.327461 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0392  LacI family transcription regulator  40.18 
 
 		 330 aa  239  4e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0318668 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0978  LacI family transcription regulator  38.41 
 
 		 339 aa  239  6.999999999999999e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2960  transcriptional regulator, LacI family  39.94 
 
 		 337 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.430193 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3960  LacI family transcription regulator  36.36 
 
 		 340 aa  228  1e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.292064 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1435  LacI family transcription regulator  36.53 
 
 		 339 aa  224  2e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0140184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3237  LacI family transcription regulator  39.94 
 
 		 343 aa  221  9.999999999999999e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1823  LacI family transcription regulator  36.47 
 
 		 341 aa  208  1e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.288921  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3504  transcriptional regulator, LacI family protein  35.87 
 
 		 340 aa  208  1e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0875897  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4088  LacI family transcription regulator  39.02 
 
 		 337 aa  206  5e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0591  LacI family transcription regulator  35.92 
 
 		 344 aa  198  1.0000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0167634 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2737  LacI family transcription regulator  37.54 
 
 		 337 aa  198  1.0000000000000001e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.771788 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1887  LacI family transcription regulator  36.03 
 
 		 344 aa  187  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.587669  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1870  LacI family transcription regulator  34.22 
 
 		 342 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075643 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1847  LacI family transcription regulator  34.5 
 
 		 346 aa  177  2e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2244  LacI family transcription regulator  34.21 
 
 		 351 aa  177  3e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1769  LacI family transcription regulator  34.5 
 
 		 346 aa  177  3e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2196  LacI family transcription regulator  32.73 
 
 		 340 aa  177  3e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0908748  hitchhiker  0.000488625 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1655  LacI family transcription regulator  35.09 
 
 		 366 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.677065  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0974  putative sugar-binding protein  31.53 
 
 		 340 aa  174  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1772  transcriptional regulator, LacI family protein  32.56 
 
 		 345 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.297999  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2252  LacI family transcription regulator  33.63 
 
 		 346 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.305473 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2002  transcriptional regulator, LacI family  33.04 
 
 		 348 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000460258 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2356  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.04 
 
 		 348 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0303  LacI family transcription regulator  36.53 
 
 		 335 aa  172  5.999999999999999e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.139649 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2345  alanine racemase  32.75 
 
 		 351 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2461  LacI family transcription regulator  32.75 
 
 		 351 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0661891  normal  0.518687 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1032  transcriptional regulator, LacI family  35.35 
 
 		 376 aa  171  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01891  putative sugar-binding protein  31.23 
 
 		 343 aa  167  2.9999999999999998e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0103851  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1820  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.36 
 
 		 345 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0597  LacI family transcription regulator  33.43 
 
 		 344 aa  162  1e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.10797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2904  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.6 
 
 		 339 aa  153  5e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2402  transcriptional regulator, LacI family  34.82 
 
 		 346 aa  152  8.999999999999999e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00787022 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1878  transcriptional regulator, LacI family  34.08 
 
 		 351 aa  152  8.999999999999999e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0941149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2472  ribose operon repressor RbsR  33.53 
 
 		 343 aa  150  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08380  transcriptional regulator  36.51 
 
 		 351 aa  150  3e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.689367  normal  0.241125 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2185  LacI family transcription regulator  31.02 
 
 		 339 aa  150  4e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3245  transcriptional regulator, LacI family  29.82 
 
 		 344 aa  149  6e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13170  transcriptional regulator  34.38 
 
 		 359 aa  149  7e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.362617  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  32.34 
 
 		 340 aa  149  7e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  31.94 
 
 		 340 aa  149  9e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2022  ribose operon repressor RbsR  33.24 
 
 		 343 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.662423  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1857  ribose operon repressor RbsR  33.24 
 
 		 343 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1870  ribose operon repressor RbsR  33.24 
 
 		 343 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.585666  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1243  LacI family transcription regulator  34.02 
 
 		 339 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0911  transcriptional regulator, LacI family  32.04 
 
 		 332 aa  148  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1883  LacI family transcription regulator  31.45 
 
 		 351 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0216034  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3432  transcriptional regulator, LacI family  29.43 
 
 		 336 aa  147  3e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000329456  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0275  transcriptional regulator, LacI family  35.28 
 
 		 339 aa  147  3e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.555598 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2680  alanine racemase  33.72 
 
 		 338 aa  147  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.769144  normal  0.967228 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0402  transcriptional regulator, LacI family  29.61 
 
 		 339 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000159796  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1628  LacI family transcription regulator  32.56 
 
 		 343 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  31.66 
 
 		 348 aa  146  5e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1789  transcriptional regulator, LacI family  32.94 
 
 		 343 aa  146  7.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1586  LacI family transcription regulator  32.75 
 
 		 343 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122412  normal  0.650271 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1129  LacI family transcription regulator  32.75 
 
 		 343 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1609  LacI family transcription regulator  32.75 
 
 		 343 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0684889  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1640  LacI family transcription regulator  28.3 
 
 		 332 aa  145  8.000000000000001e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  32.05 
 
 		 340 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4748  LacI family transcription regulator  32.55 
 
 		 343 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1506  LacI family transcription regulator  32.47 
 
 		 343 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1780  sucrose operon repressor  31.83 
 
 		 330 aa  144  2e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000248781 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1525  LacI family transcription regulator  32.47 
 
 		 343 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  31.14 
 
 		 340 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4896  transcriptional repressor RbsR  30.06 
 
 		 333 aa  142  8e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000156613  hitchhiker  0.000000782419 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3965  Alanine racemase  34.85 
 
 		 338 aa  142  9e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.578436 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04200  transcriptional regulator, LacI family  29.05 
 
 		 341 aa  142  9e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  31.64 
 
 		 333 aa  141  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  30.09 
 
 		 331 aa  142  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.4 
 
 		 336 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348221  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13150  transcriptional regulator, LacI family  29.19 
 
 		 344 aa  139  6e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1120  regulatory protein, LacI  28.65 
 
 		 324 aa  139  6e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  32.59 
 
 		 337 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  29.34 
 
 		 347 aa  139  8.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3227  LacI family transcription regulator  30.83 
 
 		 362 aa  138  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2841  transcriptional regulator, LacI family  35.42 
 
 		 345 aa  138  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.595775  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4233  transcriptional repressor RbsR  29.2 
 
 		 328 aa  139  1e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00129115  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3049  transcriptional regulator, LacI family  29.55 
 
 		 336 aa  138  1e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.490257  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  30.95 
 
 		 329 aa  137  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0134  LacI family transcription regulator  33.97 
 
 		 343 aa  137  2e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2870  transcriptional regulator, LacI family  30.18 
 
 		 342 aa  137  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2170  LacI family transcription regulator  30.77 
 
 		 366 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.626121  normal  0.28501 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2155  transcriptional regulator, LacI family  32.54 
 
 		 338 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.677334  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04250  transcriptional regulator, LacI family  29.02 
 
 		 337 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.335349  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  30.75 
 
 		 386 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0352  transcriptional regulator, LacI family  33.77 
 
 		 347 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00162695  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06943  hypothetical protein  29.73 
 
 		 334 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3721  transcriptional regulator  30.12 
 
 		 350 aa  136  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.940328  normal  0.590974 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0838  LacI family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 331 aa  136  5e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.620074  normal  0.213955 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  31.32 
 
 		 346 aa  136  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1876  LacI family transcription regulator  30.03 
 
 		 345 aa  135  8e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  31.43 
 
 		 346 aa  135  9e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28330  transcriptional regulator  32.77 
 
 		 382 aa  135  9.999999999999999e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  30.79 
 
 		 353 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2142  transcriptional regulator, LacI family  32.5 
 
 		 341 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1725  transcriptional regulator, LacI family  31.44 
 
 		 338 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4116  alanine racemase  30.97 
 
 		 334 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>