More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_2252 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2244  LacI family transcription regulator  94.49 
 
 		 351 aa  665    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2461  LacI family transcription regulator  91.88 
 
 		 351 aa  650    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0661891  normal  0.518687 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2002  transcriptional regulator, LacI family  91.3 
 
 		 348 aa  645    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000460258 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1769  LacI family transcription regulator  94.51 
 
 		 346 aa  664    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1847  LacI family transcription regulator  94.8 
 
 		 346 aa  665    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2252  LacI family transcription regulator  100 
 
 		 346 aa  712    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.305473 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2356  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  91.3 
 
 		 348 aa  645    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2345  alanine racemase  91.88 
 
 		 351 aa  650    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2196  LacI family transcription regulator  85 
 
 		 340 aa  594  1e-169  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0908748  hitchhiker  0.000488625 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1820  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  84.66 
 
 		 345 aa  595  1e-169  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1655  LacI family transcription regulator  84.16 
 
 		 366 aa  594  1e-169  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.677065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1772  transcriptional regulator, LacI family protein  82.89 
 
 		 345 aa  586  1e-166  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.297999  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1870  LacI family transcription regulator  79.06 
 
 		 342 aa  553  1e-156  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075643 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0974  putative sugar-binding protein  68.44 
 
 		 340 aa  475  1e-133  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2185  LacI family transcription regulator  66.08 
 
 		 339 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0591  LacI family transcription regulator  59.52 
 
 		 344 aa  420  1e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0167634 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01891  putative sugar-binding protein  61 
 
 		 343 aa  415  9.999999999999999e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0103851  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1032  transcriptional regulator, LacI family  63.77 
 
 		 376 aa  410  1e-113  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1887  LacI family transcription regulator  59.76 
 
 		 344 aa  399  9.999999999999999e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.587669  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0597  LacI family transcription regulator  57.23 
 
 		 344 aa  395  1e-109  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.10797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3960  LacI family transcription regulator  44.05 
 
 		 340 aa  253  2.0000000000000002e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.292064 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2960  transcriptional regulator, LacI family  44.41 
 
 		 337 aa  250  2e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.430193 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1435  LacI family transcription regulator  39.22 
 
 		 339 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0140184  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0978  LacI family transcription regulator  39.82 
 
 		 339 aa  238  1e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1320  LacI family transcription regulator  38.3 
 
 		 342 aa  238  2e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.593334  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1823  LacI family transcription regulator  40.48 
 
 		 341 aa  237  3e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.288921  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3504  transcriptional regulator, LacI family protein  39.47 
 
 		 340 aa  230  3e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0875897  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0392  LacI family transcription regulator  40.66 
 
 		 330 aa  230  3e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0318668 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02412  transcriptional regulator  39.46 
 
 		 343 aa  225  8e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2090  LacI family transcription regulator  40.6 
 
 		 338 aa  214  9.999999999999999e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0226  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  39.22 
 
 		 355 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.586057  normal  0.327461 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4088  LacI family transcription regulator  36.13 
 
 		 337 aa  210  4e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3237  LacI family transcription regulator  39.22 
 
 		 343 aa  209  4e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  38.46 
 
 		 333 aa  204  2e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2737  LacI family transcription regulator  36.92 
 
 		 337 aa  200  1.9999999999999998e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.771788 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0303  LacI family transcription regulator  35.71 
 
 		 335 aa  192  8e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.139649 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1880  LacI family transcription regulator  32.33 
 
 		 344 aa  181  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.606893  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  33.92 
 
 		 332 aa  175  9e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0967  LacI family transcription regulator  33.63 
 
 		 352 aa  174  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.934127 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  35.81 
 
 		 333 aa  172  9e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.81 
 
 		 333 aa  172  9e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6278  transcriptional regulator, LacI family  34.43 
 
 		 338 aa  169  9e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0418  alanine racemase  33.91 
 
 		 338 aa  165  8e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.923997  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1214  transcriptional regulator, LacI family  33.62 
 
 		 333 aa  164  3e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000107104  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2822  LacI family transcription regulator  35.61 
 
 		 352 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531617  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0415  LacI family transcription regulator  33.33 
 
 		 335 aa  162  5.0000000000000005e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.280412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1187  LacI family regulatory protein  35.33 
 
 		 384 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.34285  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.93 
 
 		 336 aa  160  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348221  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2788  transcriptional regulator, LacI family  34.69 
 
 		 339 aa  159  5e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3179  transcriptional regulator, LacI family  33.05 
 
 		 355 aa  159  6e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.588941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  34.23 
 
 		 333 aa  159  7e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  33.23 
 
 		 348 aa  158  1e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  31.41 
 
 		 341 aa  158  1e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2699  transcriptional regulator, LacI family  31.78 
 
 		 339 aa  157  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2170  LacI family transcription regulator  32.29 
 
 		 366 aa  158  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.626121  normal  0.28501 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04250  transcriptional regulator, LacI family  31.34 
 
 		 337 aa  157  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.335349  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06936  hypothetical protein  33.92 
 
 		 340 aa  157  3e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04200  transcriptional regulator, LacI family  32.27 
 
 		 341 aa  157  3e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3227  LacI family transcription regulator  32.76 
 
 		 362 aa  155  8e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2870  transcriptional regulator, LacI family  31.95 
 
 		 342 aa  155  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00440  transcriptional regulator, LacI family  32.59 
 
 		 338 aa  154  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0402  transcriptional regulator, LacI family  33.83 
 
 		 339 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000159796  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1685  transcriptional regulator, LacI family  30.36 
 
 		 337 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0832  LacI family transcription regulator  32.67 
 
 		 346 aa  154  2.9999999999999998e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  35.48 
 
 		 337 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0768  LacI family transcription regulator  31.75 
 
 		 332 aa  152  7e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0915061  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1631  LacI family transcription regulator  32.86 
 
 		 381 aa  152  7e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.213128  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4539  transcriptional regulator, LacI family  31.49 
 
 		 350 aa  151  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.166389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27370  transcriptional regulator, LacI family  32.45 
 
 		 339 aa  150  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0316556  normal  0.625648 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0582  alanine racemase  30.27 
 
 		 337 aa  151  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0279  transcriptional regulator, LacI family  31.03 
 
 		 351 aa  149  9e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0283  LacI family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 342 aa  149  1.0000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.881799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1128  transcriptional regulator, LacI family  32 
 
 		 361 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  31.78 
 
 		 347 aa  147  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1895  LacI family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 339 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.371942 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19800  transcriptional regulator, LacI family  31.16 
 
 		 336 aa  147  3e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2594  transcriptional regulator, LacI family  31.07 
 
 		 339 aa  147  3e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  31.2 
 
 		 355 aa  147  3e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0938  LacI family transcription regulator  31.04 
 
 		 340 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0104625  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1561  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.36 
 
 		 348 aa  146  5e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.63047 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1515  transcriptional regulator, LacI family  31.07 
 
 		 339 aa  146  6e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1732  transcriptional regulator, LacI family  32.36 
 
 		 340 aa  146  6e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521835  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23020  transcriptional regulator, LacI family  31.87 
 
 		 336 aa  146  6e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000406909  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20880  transcriptional regulator, LacI family  31.29 
 
 		 343 aa  145  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09530  transcriptional regulator, LacI family  31.62 
 
 		 340 aa  144  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00123183  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.78 
 
 		 339 aa  144  3e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.75 
 
 		 336 aa  144  3e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0838  LacI family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 331 aa  144  3e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.620074  normal  0.213955 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0911  transcriptional regulator, LacI family  33.24 
 
 		 332 aa  144  3e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1528  transcriptional regulator, LacI family  32.08 
 
 		 356 aa  143  4e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.126847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3049  transcriptional regulator, LacI family  30.17 
 
 		 336 aa  143  5e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.490257  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2475  transcriptional regulator, LacI family  33.24 
 
 		 340 aa  142  7e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000232076  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2281  transcriptional regulator, LacI family  30.81 
 
 		 334 aa  142  9.999999999999999e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1883  LacI family transcription regulator  28.45 
 
 		 351 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0216034  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2456  LacI family transcription regulator  31.49 
 
 		 352 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3030  transcriptional regulator, LacI family  32.35 
 
 		 342 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.04 
 
 		 330 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2250  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.45 
 
 		 335 aa  141  1.9999999999999998e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  28.91 
 
 		 331 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5761  transcriptional regulator, LacI family  32.65 
 
 		 363 aa  140  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.230872  normal  0.079116 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>