More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1887 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1887  LacI family transcription regulator  100 
 
 		 344 aa  696    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.587669  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0597  LacI family transcription regulator  69.3 
 
 		 344 aa  479  1e-134  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.10797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2196  LacI family transcription regulator  59.05 
 
 		 340 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0908748  hitchhiker  0.000488625 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2252  LacI family transcription regulator  59.76 
 
 		 346 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.305473 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1655  LacI family transcription regulator  59.47 
 
 		 366 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.677065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2002  transcriptional regulator, LacI family  59.17 
 
 		 348 aa  395  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000460258 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2356  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  59.17 
 
 		 348 aa  395  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2244  LacI family transcription regulator  58.58 
 
 		 351 aa  394  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2461  LacI family transcription regulator  59.17 
 
 		 351 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0661891  normal  0.518687 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1870  LacI family transcription regulator  57.69 
 
 		 342 aa  393  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075643 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2345  alanine racemase  59.17 
 
 		 351 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0974  putative sugar-binding protein  56.25 
 
 		 340 aa  388  1e-107  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1769  LacI family transcription regulator  58.58 
 
 		 346 aa  390  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1847  LacI family transcription regulator  58.58 
 
 		 346 aa  390  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1772  transcriptional regulator, LacI family protein  58.41 
 
 		 345 aa  387  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.297999  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1820  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  57.4 
 
 		 345 aa  380  1e-104  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1032  transcriptional regulator, LacI family  58.51 
 
 		 376 aa  375  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0591  LacI family transcription regulator  55.36 
 
 		 344 aa  374  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0167634 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2185  LacI family transcription regulator  56.38 
 
 		 339 aa  367  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01891  putative sugar-binding protein  52.98 
 
 		 343 aa  363  3e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0103851  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1320  LacI family transcription regulator  42.04 
 
 		 342 aa  253  4.0000000000000004e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.593334  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0392  LacI family transcription regulator  42.04 
 
 		 330 aa  231  2e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0318668 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02412  transcriptional regulator  41.95 
 
 		 343 aa  229  6e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3504  transcriptional regulator, LacI family protein  37.13 
 
 		 340 aa  218  2e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0875897  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0978  LacI family transcription regulator  36.92 
 
 		 339 aa  214  1.9999999999999998e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1435  LacI family transcription regulator  36.75 
 
 		 339 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0140184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2090  LacI family transcription regulator  42.99 
 
 		 338 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3960  LacI family transcription regulator  40.52 
 
 		 340 aa  212  5.999999999999999e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.292064 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2960  transcriptional regulator, LacI family  37.95 
 
 		 337 aa  210  3e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.430193 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3237  LacI family transcription regulator  41.14 
 
 		 343 aa  208  1e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1823  LacI family transcription regulator  36.95 
 
 		 341 aa  207  2e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.288921  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0226  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  38.99 
 
 		 355 aa  204  2e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.586057  normal  0.327461 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3227  LacI family transcription regulator  39.09 
 
 		 362 aa  191  1e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0967  LacI family transcription regulator  36.03 
 
 		 352 aa  187  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.934127 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1880  LacI family transcription regulator  35.17 
 
 		 344 aa  187  3e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.606893  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4088  LacI family transcription regulator  37.94 
 
 		 337 aa  181  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2737  LacI family transcription regulator  36.81 
 
 		 337 aa  180  4e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.771788 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0303  LacI family transcription regulator  36.69 
 
 		 335 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.139649 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1732  transcriptional regulator, LacI family  36.65 
 
 		 340 aa  168  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521835  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6278  transcriptional regulator, LacI family  36.95 
 
 		 338 aa  167  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3984  LacI family transcription regulator  36.93 
 
 		 339 aa  162  8.000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.125023  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0768  LacI family transcription regulator  36.2 
 
 		 332 aa  161  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0915061  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0838  LacI family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 331 aa  159  7e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.620074  normal  0.213955 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0134  LacI family transcription regulator  37.5 
 
 		 343 aa  156  6e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1187  LacI family regulatory protein  35.29 
 
 		 384 aa  155  8e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.34285  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0297  LacI family transcription regulator  33.63 
 
 		 340 aa  154  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2822  LacI family transcription regulator  36 
 
 		 352 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531617  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3030  transcriptional regulator, LacI family  37.57 
 
 		 342 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.33 
 
 		 336 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348221  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  30.35 
 
 		 341 aa  152  8.999999999999999e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  32.35 
 
 		 333 aa  152  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0006  ribose operon repressor  31.96 
 
 		 334 aa  151  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.038565  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3179  transcriptional regulator, LacI family  33.89 
 
 		 355 aa  150  2e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.588941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  35.26 
 
 		 339 aa  150  3e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2402  transcriptional regulator, LacI family  35.17 
 
 		 346 aa  150  3e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00787022 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1895  LacI family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 339 aa  150  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.371942 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  34.23 
 
 		 333 aa  150  4e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  36.36 
 
 		 353 aa  150  4e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.23 
 
 		 333 aa  150  4e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08380  transcriptional regulator  37.22 
 
 		 351 aa  149  6e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.689367  normal  0.241125 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04200  transcriptional regulator, LacI family  33.33 
 
 		 341 aa  149  9e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0938  LacI family transcription regulator  32.65 
 
 		 340 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0104625  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6720  transcriptional regulator, LacI family  33.15 
 
 		 374 aa  148  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.396206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.74 
 
 		 330 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2594  transcriptional regulator, LacI family  35.67 
 
 		 339 aa  148  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4368  transcriptional regulator, LacI family  36.02 
 
 		 347 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.0119453 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2788  transcriptional regulator, LacI family  33.71 
 
 		 339 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  32.95 
 
 		 348 aa  146  4.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2245  LacI family transcription regulator  34.91 
 
 		 338 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.115687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04250  transcriptional regulator, LacI family  32.65 
 
 		 337 aa  146  5e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.335349  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1128  transcriptional regulator, LacI family  32.4 
 
 		 361 aa  145  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  34.02 
 
 		 353 aa  145  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13170  transcriptional regulator  36.52 
 
 		 359 aa  145  1e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.362617  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0418  alanine racemase  31.96 
 
 		 338 aa  145  1e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.923997  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0413  transcriptional regulator, LacI family  32.25 
 
 		 358 aa  144  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4896  transcriptional repressor RbsR  32.06 
 
 		 333 aa  144  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000156613  hitchhiker  0.000000782419 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5463  LacI family transcription regulator  34.99 
 
 		 344 aa  144  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.316293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1725  transcriptional regulator, LacI family  33.23 
 
 		 338 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  30.27 
 
 		 331 aa  144  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4021  transcriptional regulator, LacI family  35.45 
 
 		 350 aa  143  3e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.613602  normal  0.127498 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0389  LacI family transcription regulator  34.12 
 
 		 335 aa  143  4e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0127409 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0325  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.82 
 
 		 335 aa  143  4e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  34.31 
 
 		 337 aa  143  5e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  32.74 
 
 		 332 aa  143  5e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3970  LacI family transcription regulator  35.33 
 
 		 348 aa  143  5e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.149546 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0275  transcriptional regulator, LacI family  33.93 
 
 		 339 aa  143  6e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.555598 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6650  transcriptional regulator, LacI family  33.98 
 
 		 364 aa  142  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.17574 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0809  transcriptional regulator, LacI family  34.8 
 
 		 344 aa  141  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.119427 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4438  transcriptional regulator, LacI family  35.59 
 
 		 342 aa  141  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0401839 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0673  transcriptional regulator, LacI family  32.37 
 
 		 382 aa  141  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.208846  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03890  transcriptional regulator, LacI family  34.47 
 
 		 337 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.229438 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  33.53 
 
 		 347 aa  140  3e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  31.21 
 
 		 349 aa  140  3e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7169  transcriptional repressor RbsR  35.19 
 
 		 331 aa  140  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0351473 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2798  LacI family transcription regulator  35.36 
 
 		 346 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614982 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0524  alanine racemase  35.69 
 
 		 339 aa  140  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2170  LacI family transcription regulator  31.44 
 
 		 366 aa  139  7e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.626121  normal  0.28501 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2155  transcriptional regulator, LacI family  35.28 
 
 		 338 aa  139  7e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.677334  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  30.51 
 
 		 386 aa  139  7e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2475  transcriptional regulator, LacI family  34.82 
 
 		 340 aa  139  8.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000232076  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>