More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0597 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0597  LacI family transcription regulator  100 
 
 		 344 aa  703    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.10797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1887  LacI family transcription regulator  69.3 
 
 		 344 aa  479  1e-134  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.587669  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2461  LacI family transcription regulator  57.82 
 
 		 351 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0661891  normal  0.518687 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2196  LacI family transcription regulator  58.16 
 
 		 340 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0908748  hitchhiker  0.000488625 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1032  transcriptional regulator, LacI family  61.01 
 
 		 376 aa  399  9.999999999999999e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1655  LacI family transcription regulator  58.41 
 
 		 366 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.677065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2356  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  57.82 
 
 		 348 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2002  transcriptional regulator, LacI family  57.82 
 
 		 348 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000460258 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2345  alanine racemase  57.82 
 
 		 351 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1847  LacI family transcription regulator  57.23 
 
 		 346 aa  394  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1772  transcriptional regulator, LacI family protein  57.44 
 
 		 345 aa  395  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.297999  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2252  LacI family transcription regulator  57.23 
 
 		 346 aa  395  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.305473 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1870  LacI family transcription regulator  58.08 
 
 		 342 aa  396  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075643 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1769  LacI family transcription regulator  57.23 
 
 		 346 aa  394  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2244  LacI family transcription regulator  56.64 
 
 		 351 aa  391  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1820  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  58.93 
 
 		 345 aa  389  1e-107  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0974  putative sugar-binding protein  57.31 
 
 		 340 aa  388  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01891  putative sugar-binding protein  53.89 
 
 		 343 aa  371  1e-102  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0103851  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2185  LacI family transcription regulator  53.73 
 
 		 339 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0591  LacI family transcription regulator  54.79 
 
 		 344 aa  358  7e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0167634 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1320  LacI family transcription regulator  41.25 
 
 		 342 aa  235  8e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.593334  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3960  LacI family transcription regulator  39.18 
 
 		 340 aa  221  1.9999999999999999e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.292064 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0392  LacI family transcription regulator  40.79 
 
 		 330 aa  218  8.999999999999998e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0318668 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2960  transcriptional regulator, LacI family  38.86 
 
 		 337 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.430193 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1435  LacI family transcription regulator  35.44 
 
 		 339 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0140184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3504  transcriptional regulator, LacI family protein  36.09 
 
 		 340 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0875897  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02412  transcriptional regulator  39.36 
 
 		 343 aa  211  1e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2090  LacI family transcription regulator  42.17 
 
 		 338 aa  209  4e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0978  LacI family transcription regulator  36.34 
 
 		 339 aa  209  6e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0226  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  39.47 
 
 		 355 aa  207  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.586057  normal  0.327461 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3237  LacI family transcription regulator  38.97 
 
 		 343 aa  206  6e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1823  LacI family transcription regulator  37.98 
 
 		 341 aa  205  8e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.288921  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4088  LacI family transcription regulator  36.25 
 
 		 337 aa  182  5.0000000000000004e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2737  LacI family transcription regulator  35.59 
 
 		 337 aa  180  2.9999999999999997e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.771788 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0303  LacI family transcription regulator  36.5 
 
 		 335 aa  174  9.999999999999999e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.139649 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1880  LacI family transcription regulator  33.82 
 
 		 344 aa  167  2e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.606893  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6278  transcriptional regulator, LacI family  37.35 
 
 		 338 aa  167  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0967  LacI family transcription regulator  33.43 
 
 		 352 aa  162  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.934127 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.82 
 
 		 336 aa  158  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348221  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3227  LacI family transcription regulator  35.98 
 
 		 362 aa  155  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5463  LacI family transcription regulator  35.5 
 
 		 344 aa  155  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.316293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  35.28 
 
 		 339 aa  153  5e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3179  transcriptional regulator, LacI family  34.97 
 
 		 355 aa  152  5.9999999999999996e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.588941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2472  ribose operon repressor RbsR  35.28 
 
 		 343 aa  152  8e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0938  LacI family transcription regulator  33.82 
 
 		 340 aa  151  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0104625  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2022  ribose operon repressor RbsR  35.28 
 
 		 343 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.662423  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  30.35 
 
 		 341 aa  151  1e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1857  ribose operon repressor RbsR  35.28 
 
 		 343 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1870  ribose operon repressor RbsR  35.28 
 
 		 343 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.585666  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0838  LacI family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 331 aa  152  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.620074  normal  0.213955 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  35.69 
 
 		 353 aa  150  3e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4896  transcriptional repressor RbsR  31.67 
 
 		 333 aa  149  7e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000156613  hitchhiker  0.000000782419 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1506  LacI family transcription regulator  34.11 
 
 		 343 aa  149  7e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1525  LacI family transcription regulator  34.11 
 
 		 343 aa  149  7e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  34.21 
 
 		 332 aa  149  8e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  30.38 
 
 		 333 aa  147  3e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4111  transcriptional repressor RbsR  31.75 
 
 		 333 aa  146  5e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0488485  normal  0.0159443 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  30.68 
 
 		 386 aa  145  8.000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3970  LacI family transcription regulator  36.81 
 
 		 348 aa  145  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.149546 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1561  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.24 
 
 		 348 aa  145  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.63047 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4539  transcriptional regulator, LacI family  34.1 
 
 		 350 aa  145  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.166389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0768  LacI family transcription regulator  33.63 
 
 		 332 aa  144  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0915061  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5190  transcriptional repressor RbsR  31.97 
 
 		 330 aa  144  3e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00327915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4122  transcriptional repressor RbsR  31.97 
 
 		 330 aa  144  3e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.305602  normal  0.0911869 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4270  transcriptional repressor RbsR  31.97 
 
 		 330 aa  144  3e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000205239  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1628  LacI family transcription regulator  33.53 
 
 		 343 aa  143  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04250  transcriptional regulator, LacI family  31.29 
 
 		 337 aa  143  4e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.335349  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0134  LacI family transcription regulator  35.99 
 
 		 343 aa  143  5e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  31.25 
 
 		 368 aa  143  5e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4241  transcriptional repressor RbsR  31.97 
 
 		 330 aa  142  6e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.327464  hitchhiker  0.00680444 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4368  transcriptional regulator, LacI family  35.9 
 
 		 347 aa  142  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.0119453 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4165  transcriptional repressor RbsR  31.66 
 
 		 330 aa  142  6e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0172446  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4748  LacI family transcription regulator  32.94 
 
 		 343 aa  142  9e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3304  LacI family transcription regulator  34.5 
 
 		 335 aa  142  9e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.547709 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1586  LacI family transcription regulator  32.94 
 
 		 343 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122412  normal  0.650271 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  34.52 
 
 		 337 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1129  LacI family transcription regulator  32.94 
 
 		 343 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0186  transcriptional regulator, LacI family  34.6 
 
 		 330 aa  142  9.999999999999999e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.319705  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1609  LacI family transcription regulator  32.94 
 
 		 343 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0684889  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1214  transcriptional regulator, LacI family  34.2 
 
 		 333 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000107104  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0279  transcriptional regulator, LacI family  33.43 
 
 		 351 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0559  transcriptional regulator, LacI family  31.1 
 
 		 337 aa  140  3e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0418  alanine racemase  31.29 
 
 		 338 aa  140  3e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.923997  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3383  LacI family transcription regulator  33.14 
 
 		 342 aa  140  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03639  DNA-binding transcriptional repressor of ribose metabolism  31.66 
 
 		 330 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00237415  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2170  LacI family transcription regulator  31.49 
 
 		 366 aa  139  4.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.626121  normal  0.28501 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1234  LacI family transcription regulator  33.14 
 
 		 343 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50127  normal  0.134178 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  29.88 
 
 		 331 aa  140  4.999999999999999e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3623  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.24 
 
 		 335 aa  139  4.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.487296  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03584  hypothetical protein  31.66 
 
 		 330 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00148852  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1510  LacI family transcription regulator  33.33 
 
 		 348 aa  139  4.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014462 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4278  transcriptional repressor RbsR  31.13 
 
 		 332 aa  139  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.134192  normal  0.933942 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4169  transcriptional repressor RbsR  31.13 
 
 		 332 aa  139  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.451515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4113  transcriptional repressor RbsR  31.13 
 
 		 332 aa  139  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.493547  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3030  transcriptional regulator, LacI family  35.01 
 
 		 342 aa  139  7e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4098  transcriptional repressor RbsR  31.13 
 
 		 332 aa  139  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.396512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3984  LacI family transcription regulator  32.95 
 
 		 339 aa  139  7e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.125023  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2594  transcriptional regulator, LacI family  31.98 
 
 		 339 aa  139  7.999999999999999e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6720  transcriptional regulator, LacI family  33.05 
 
 		 374 aa  138  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.396206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2475  transcriptional regulator, LacI family  34.22 
 
 		 340 aa  138  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000232076  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>