More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2475 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013526  Tter_2475  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 
340 aa  678    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000232076  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2210  transcriptional regulator, LacI family  36.28 
 
 
342 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  38.46 
 
 
337 aa  190  4e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2385  transcriptional regulator, LacI family  37.94 
 
 
346 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.171577  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  38.56 
 
 
348 aa  181  2e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23440  transcriptional regulator, LacI family  39.53 
 
 
350 aa  181  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.769589  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13150  transcriptional regulator, LacI family  32.92 
 
 
344 aa  179  9e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01670  transcriptional regulator  39.62 
 
 
348 aa  173  3.9999999999999995e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  36.8 
 
 
368 aa  172  6.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  32.45 
 
 
341 aa  171  1e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2790  LacI family transcription regulator  36.8 
 
 
348 aa  171  1e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2046  LacI family transcription regulator  38.21 
 
 
344 aa  172  1e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  38.64 
 
 
333 aa  172  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0171477 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03819  DNA-binding transcriptional dual regulator  35.81 
 
 
341 aa  171  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4051  transcriptional regulator, LacI family  35.81 
 
 
341 aa  171  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4084  DNA-binding transcriptional regulator CytR  35.81 
 
 
341 aa  171  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4416  DNA-binding transcriptional regulator CytR  35.81 
 
 
343 aa  171  2e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.506908  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4166  DNA-binding transcriptional regulator CytR  35.81 
 
 
343 aa  171  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03768  hypothetical protein  35.81 
 
 
341 aa  171  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4376  DNA-binding transcriptional regulator CytR  35.81 
 
 
341 aa  171  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.76111 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4470  DNA-binding transcriptional regulator CytR  35.81 
 
 
341 aa  171  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3973  transcriptional repressor RbsR  38.73 
 
 
338 aa  170  3e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000131921  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2074  transcriptional regulator, LacI family  31.32 
 
 
338 aa  170  3e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.1 
 
 
330 aa  169  7e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.14 
 
 
339 aa  168  1e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2304  transcriptional regulator, LacI family  36.65 
 
 
347 aa  168  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0352  transcriptional regulator, LacI family  37.1 
 
 
347 aa  168  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00162695  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  37.81 
 
 
331 aa  167  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  34.32 
 
 
342 aa  167  2e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5391  DNA-binding transcriptional regulator CytR  35.5 
 
 
330 aa  166  4e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.504328  normal  0.696689 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0961  transcriptional regulator, LacI family  38.61 
 
 
359 aa  166  5e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1128  transcriptional regulator, LacI family  35.81 
 
 
361 aa  166  5e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0418  alanine racemase  33.72 
 
 
338 aa  166  5.9999999999999996e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.923997  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04200  transcriptional regulator, LacI family  33.92 
 
 
341 aa  165  9e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11530  transcriptional regulator, LacI family  36.13 
 
 
331 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00809623 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0549  Alanine racemase  38.44 
 
 
340 aa  165  1.0000000000000001e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  33.33 
 
 
335 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  37.68 
 
 
347 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2403  transcriptional regulator, LacI family  37.5 
 
 
379 aa  164  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00011763  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  39.68 
 
 
346 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0520  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.81 
 
 
338 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  hitchhiker  0.0000174135 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3676  LacI family transcription regulator  38.94 
 
 
323 aa  163  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.259551 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  37.39 
 
 
339 aa  164  3e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1032  transcriptional regulator, LacI family  34.78 
 
 
376 aa  163  3e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4233  transcriptional repressor RbsR  36.55 
 
 
328 aa  163  3e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00129115  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  37.28 
 
 
353 aa  164  3e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  39.37 
 
 
346 aa  163  3e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.3 
 
 
336 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0402  transcriptional regulator, LacI family  34.07 
 
 
339 aa  163  4.0000000000000004e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000159796  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4797  LacI family transcription regulator  36.52 
 
 
336 aa  162  5.0000000000000005e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.184791  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09530  transcriptional regulator, LacI family  32.54 
 
 
340 aa  162  5.0000000000000005e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00123183  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4896  transcriptional repressor RbsR  34.8 
 
 
333 aa  162  6e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000156613  hitchhiker  0.000000782419 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4170  transcriptional repressor RbsR  36.29 
 
 
341 aa  162  8.000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000181496  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  36.61 
 
 
349 aa  162  9e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2245  LacI family transcription regulator  35.45 
 
 
338 aa  161  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.115687  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5512  transcriptional regulator, LacI family  32.75 
 
 
340 aa  161  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0234887 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1824  transcriptional regulator, LacI family  38.17 
 
 
347 aa  161  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.021809  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23020  transcriptional regulator, LacI family  31.86 
 
 
336 aa  160  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000406909  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2686  transcriptional regulator, LacI family  35.1 
 
 
340 aa  160  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0695  transcriptional regulator, LacI family  32.44 
 
 
330 aa  161  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0821691  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0907  LacI family transcription regulator  36.52 
 
 
341 aa  161  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1983  HTH-type transcriptional repressor PurR (purine nucleotide synthesis repressor)  32.85 
 
 
333 aa  160  3e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0663  transcriptional regulator, LacI family  31.97 
 
 
338 aa  160  4e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4811  catabolite control protein A  34.81 
 
 
332 aa  160  4e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06943  hypothetical protein  34.88 
 
 
334 aa  160  4e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4813  catabolite control protein A  34.51 
 
 
332 aa  159  6e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4410  catabolite control protein A  34.51 
 
 
332 aa  159  7e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4795  catabolite control protein A  34.51 
 
 
332 aa  159  7e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  32.28 
 
 
342 aa  159  8e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1248  transcriptional regulator, LacI family  33.33 
 
 
334 aa  159  8e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0782052 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0509  transcriptional regulator, LacI family  33.86 
 
 
335 aa  159  9e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000000057395  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0186  transcriptional regulator, LacI family  36.76 
 
 
330 aa  159  9e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.319705  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4575  catabolite control protein A  34.51 
 
 
332 aa  158  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4427  catabolite control protein A  34.51 
 
 
332 aa  158  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4929  catabolite control protein A  34.51 
 
 
332 aa  158  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4790  catabolite control protein A  34.51 
 
 
332 aa  158  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.08 
 
 
333 aa  159  1e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  34.08 
 
 
333 aa  158  1e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2261  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.34 
 
 
348 aa  157  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.276208 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4506  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  34.51 
 
 
332 aa  157  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2904  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  38.61 
 
 
339 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  34.4 
 
 
332 aa  157  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2456  LacI family transcription regulator  37.25 
 
 
352 aa  158  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0413  transcriptional regulator, LacI family  35.12 
 
 
358 aa  157  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3939  LacI family transcription regulator  33.82 
 
 
354 aa  156  4e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1243  LacI family transcription regulator  38.61 
 
 
339 aa  157  4e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  31.78 
 
 
355 aa  156  5.0000000000000005e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2856  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.05 
 
 
339 aa  156  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.669064  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1691  transcriptional regulator, LacI family  37.39 
 
 
341 aa  156  6e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0314799  normal  0.084893 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0449  catabolite control protein A  34.22 
 
 
332 aa  156  6e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  31.12 
 
 
333 aa  155  6e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0345  transcriptional regulator for D-ribose, periplasmic binding protein, LacI family protein  32.36 
 
 
334 aa  155  7e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6831  LacI family transcription regulator  36.76 
 
 
337 aa  155  7e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2320  LacI family transcriptional regulator  35.44 
 
 
340 aa  155  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.316441  normal  0.202359 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1685  transcriptional regulator, LacI family  34.32 
 
 
337 aa  155  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0477  transcriptional regulator, LacI family  34.96 
 
 
352 aa  155  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1481  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.14 
 
 
348 aa  155  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1744  transcriptional regulator, LacI family  32.4 
 
 
336 aa  155  1e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0777  LacI transcriptional regulator  34.12 
 
 
337 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.185303 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3000  transcriptional regulator, LacI family  29.89 
 
 
346 aa  154  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0114429  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>