More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3030 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_3030  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 342 aa  670    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13170  transcriptional regulator  55.59 
 
 		 359 aa  323  2e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.362617  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0938  LacI family transcription regulator  48.66 
 
 		 340 aa  287  2e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0104625  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1510  LacI family transcription regulator  47.32 
 
 		 348 aa  272  5.000000000000001e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014462 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1895  LacI family transcriptional regulator  45.97 
 
 		 339 aa  268  8.999999999999999e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.371942 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1732  transcriptional regulator, LacI family  47.75 
 
 		 340 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521835  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3304  LacI family transcription regulator  45.78 
 
 		 335 aa  266  2.9999999999999995e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.547709 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1561  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  44.94 
 
 		 348 aa  260  2e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.63047 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6278  transcriptional regulator, LacI family  46.25 
 
 		 338 aa  259  4e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1789  transcriptional regulator, LacI family  46.88 
 
 		 343 aa  258  9e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3984  LacI family transcription regulator  46.08 
 
 		 339 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.125023  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0838  LacI family transcriptional regulator  45.32 
 
 		 331 aa  253  3e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.620074  normal  0.213955 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0809  transcriptional regulator, LacI family  44.81 
 
 		 344 aa  247  2e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.119427 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0134  LacI family transcription regulator  43.98 
 
 		 343 aa  247  2e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0325  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  45.15 
 
 		 335 aa  246  4e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5463  LacI family transcription regulator  47.67 
 
 		 344 aa  246  6e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.316293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5334  transcriptional regulator, LacI family  46.67 
 
 		 339 aa  246  6e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.431046 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2402  transcriptional regulator, LacI family  43.98 
 
 		 346 aa  243  3e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00787022 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2841  transcriptional regulator, LacI family  47.43 
 
 		 345 aa  243  3.9999999999999997e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.595775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0389  LacI family transcription regulator  46.06 
 
 		 335 aa  243  3.9999999999999997e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0127409 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4021  transcriptional regulator, LacI family  45.65 
 
 		 350 aa  242  7e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.613602  normal  0.127498 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3721  transcriptional regulator  42.06 
 
 		 350 aa  236  5.0000000000000005e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.940328  normal  0.590974 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  43.41 
 
 		 473 aa  233  3e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1878  transcriptional regulator, LacI family  43.73 
 
 		 351 aa  231  1e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0941149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08380  transcriptional regulator  43.12 
 
 		 351 aa  231  2e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.689367  normal  0.241125 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4568  transcriptional regulator, LacI family  44.05 
 
 		 357 aa  225  7e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1685  transcriptional regulator, LacI family  42.04 
 
 		 337 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3394  transcriptional regulator  41.99 
 
 		 361 aa  216  5e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.330741 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2155  transcriptional regulator, LacI family  41.14 
 
 		 338 aa  214  9.999999999999999e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.677334  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0403  transcriptional regulator, LacI family  44.78 
 
 		 350 aa  214  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5673  transcriptional regulator, LacI family  44.44 
 
 		 343 aa  209  5e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.227027  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3491  transcriptional regulator, LacI family  40.94 
 
 		 349 aa  205  8e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.201292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7169  transcriptional repressor RbsR  41.99 
 
 		 331 aa  204  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0351473 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0297  LacI family transcription regulator  37.16 
 
 		 340 aa  204  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6684  transcriptional regulator, LacI family  43.67 
 
 		 338 aa  202  5e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.594008 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3965  Alanine racemase  40.42 
 
 		 338 aa  199  5e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.578436 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03890  transcriptional regulator, LacI family  36.86 
 
 		 337 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.229438 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3075  transcriptional regulator, LacI family  41.09 
 
 		 338 aa  191  2e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.494184  normal  0.554684 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1193  transcriptional regulator, LacI family  42.64 
 
 		 335 aa  191  2e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0624061  normal  0.122686 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0944  transcriptional regulator, LacI family  43.41 
 
 		 334 aa  189  7e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.694443 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04030  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 351 aa  186  5e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0911  transcriptional regulator, LacI family  39.64 
 
 		 332 aa  185  1.0000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.43 
 
 		 336 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348221  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  31.55 
 
 		 341 aa  182  7e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2615  transcriptional regulator, LacI family  42.99 
 
 		 337 aa  182  1e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0861  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  42.55 
 
 		 292 aa  181  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.19022 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1333  transcriptional regulator, LacI family  35.73 
 
 		 347 aa  177  2e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00834702  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  32.84 
 
 		 333 aa  176  3e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  35.45 
 
 		 353 aa  176  6e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1725  transcriptional regulator, LacI family  32.42 
 
 		 338 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.94 
 
 		 336 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1515  transcriptional regulator, LacI family  35.12 
 
 		 339 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0663  transcriptional regulator, LacI family  31.61 
 
 		 338 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  30.06 
 
 		 342 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16200  transcriptional regulator, LacI family  34.34 
 
 		 336 aa  173  3.9999999999999995e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00346268  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  35.29 
 
 		 331 aa  172  5e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0582  alanine racemase  32.13 
 
 		 337 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0283  LacI family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 342 aa  172  6.999999999999999e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.881799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14260  transcriptional regulator  38.18 
 
 		 330 aa  172  6.999999999999999e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.419378  normal  0.681325 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0699  transcriptional regulator, LacI family  33.82 
 
 		 341 aa  172  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0402  transcriptional regulator, LacI family  31.85 
 
 		 339 aa  171  1e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000159796  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  36.47 
 
 		 353 aa  172  1e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0307  transcriptional regulator, LacI family  34.82 
 
 		 337 aa  171  2e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.211089  normal  0.109292 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04075  galactose operon repressor  33.93 
 
 		 333 aa  169  8e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1887  LacI family transcription regulator  37.86 
 
 		 344 aa  168  1e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.587669  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01891  putative sugar-binding protein  34.02 
 
 		 343 aa  167  2e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0103851  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2273  LacI family transcription regulator  35.71 
 
 		 333 aa  167  2e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0311079  hitchhiker  0.000018406 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  34.21 
 
 		 337 aa  167  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4233  transcriptional repressor RbsR  34.73 
 
 		 328 aa  167  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00129115  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  35.09 
 
 		 332 aa  168  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0376  transcriptional regulator, LacI family  35.09 
 
 		 358 aa  167  2.9999999999999998e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  33.63 
 
 		 348 aa  166  5e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19800  transcriptional regulator, LacI family  31.83 
 
 		 336 aa  166  5.9999999999999996e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1710  LacI family transcription regulator  38.89 
 
 		 344 aa  166  8e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1790  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.76 
 
 		 337 aa  165  9e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00351385  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  34.39 
 
 		 347 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0768  LacI family transcription regulator  36.94 
 
 		 332 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0915061  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06943  hypothetical protein  32.48 
 
 		 334 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04200  transcriptional regulator, LacI family  29.33 
 
 		 341 aa  163  3e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  32.04 
 
 		 386 aa  163  3e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  34.75 
 
 		 346 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6650  transcriptional regulator, LacI family  35.84 
 
 		 364 aa  162  6e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.17574 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1744  transcriptional regulator, LacI family  31.76 
 
 		 336 aa  162  6e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  34.46 
 
 		 346 aa  162  8.000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  34.23 
 
 		 329 aa  162  9e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0566  transcriptional regulator, LacI family  31.45 
 
 		 328 aa  161  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2870  transcriptional regulator, LacI family  34.82 
 
 		 342 aa  161  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  35.31 
 
 		 339 aa  160  2e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1314  transcriptional regulator, LacI family protein  33.33 
 
 		 352 aa  160  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2711  alanine racemase  31.04 
 
 		 342 aa  161  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000872573  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3623  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.28 
 
 		 335 aa  160  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.487296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0512  LacI family transcription regulator  36.26 
 
 		 336 aa  160  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4680  LacI family transcription regulator  37.57 
 
 		 336 aa  159  6e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0406203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1506  LacI family transcription regulator  31.85 
 
 		 343 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3973  transcriptional repressor RbsR  34.91 
 
 		 338 aa  158  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000131921  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.21 
 
 		 330 aa  158  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1525  LacI family transcription regulator  31.85 
 
 		 343 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420738  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3179  transcriptional regulator, LacI family  35.61 
 
 		 355 aa  157  2e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.588941  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3751  maltose operon transcriptional repressor  30.45 
 
 		 343 aa  158  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4226  maltose operon transcriptional repressor  30.45 
 
 		 343 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>