More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1032 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1032  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 376 aa  769    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0974  putative sugar-binding protein  59.94 
 
 		 340 aa  423  1e-117  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1655  LacI family transcription regulator  61.69 
 
 		 366 aa  422  1e-117  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.677065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1769  LacI family transcription regulator  64.09 
 
 		 346 aa  419  1e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1847  LacI family transcription regulator  64.39 
 
 		 346 aa  420  1e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2196  LacI family transcription regulator  63.28 
 
 		 340 aa  418  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0908748  hitchhiker  0.000488625 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1870  LacI family transcription regulator  64.67 
 
 		 342 aa  418  1e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075643 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2244  LacI family transcription regulator  62.76 
 
 		 351 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1820  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  64.07 
 
 		 345 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1772  transcriptional regulator, LacI family protein  63.77 
 
 		 345 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.297999  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2461  LacI family transcription regulator  62.61 
 
 		 351 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0661891  normal  0.518687 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2345  alanine racemase  62.61 
 
 		 351 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2356  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  62.61 
 
 		 348 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2002  transcriptional regulator, LacI family  62.61 
 
 		 348 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000460258 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01891  putative sugar-binding protein  59.05 
 
 		 343 aa  408  1e-113  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0103851  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2252  LacI family transcription regulator  63.77 
 
 		 346 aa  410  1e-113  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.305473 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2185  LacI family transcription regulator  61.54 
 
 		 339 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0597  LacI family transcription regulator  61.01 
 
 		 344 aa  399  9.999999999999999e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.10797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0591  LacI family transcription regulator  56.76 
 
 		 344 aa  378  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0167634 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1887  LacI family transcription regulator  58.51 
 
 		 344 aa  375  1e-103  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.587669  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2960  transcriptional regulator, LacI family  41.11 
 
 		 337 aa  239  9e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.430193 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1435  LacI family transcription regulator  37.18 
 
 		 339 aa  236  7e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0140184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02412  transcriptional regulator  42.06 
 
 		 343 aa  233  5e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0978  LacI family transcription regulator  38.37 
 
 		 339 aa  228  2e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1320  LacI family transcription regulator  38.99 
 
 		 342 aa  224  2e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.593334  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2090  LacI family transcription regulator  45.27 
 
 		 338 aa  223  3e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3237  LacI family transcription regulator  42.77 
 
 		 343 aa  223  4e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3504  transcriptional regulator, LacI family protein  35.57 
 
 		 340 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0875897  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3960  LacI family transcription regulator  39.16 
 
 		 340 aa  218  1e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.292064 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4088  LacI family transcription regulator  38.01 
 
 		 337 aa  216  2.9999999999999998e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1823  LacI family transcription regulator  35.57 
 
 		 341 aa  210  3e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.288921  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0392  LacI family transcription regulator  40 
 
 		 330 aa  208  1e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0318668 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2737  LacI family transcription regulator  37.06 
 
 		 337 aa  200  3e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.771788 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0226  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  38.55 
 
 		 355 aa  195  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.586057  normal  0.327461 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0303  LacI family transcription regulator  36.98 
 
 		 335 aa  177  2e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.139649 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0967  LacI family transcription regulator  35.35 
 
 		 352 aa  171  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.934127 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3227  LacI family transcription regulator  35.75 
 
 		 362 aa  166  5e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0418  alanine racemase  32.66 
 
 		 338 aa  164  3e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.923997  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2475  transcriptional regulator, LacI family  34.78 
 
 		 340 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000232076  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1880  LacI family transcription regulator  34.34 
 
 		 344 aa  162  1e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.606893  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  31.66 
 
 		 333 aa  161  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0413  transcriptional regulator, LacI family  33.14 
 
 		 358 aa  154  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23020  transcriptional regulator, LacI family  32.11 
 
 		 336 aa  153  5e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000406909  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2503  transcriptional regulator, LacI family  36.21 
 
 		 337 aa  153  5e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0402  transcriptional regulator, LacI family  31.29 
 
 		 339 aa  153  5e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000159796  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2594  transcriptional regulator, LacI family  34.02 
 
 		 339 aa  152  7e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  36.47 
 
 		 337 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2281  transcriptional regulator, LacI family  32.86 
 
 		 334 aa  152  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5463  LacI family transcription regulator  35.91 
 
 		 344 aa  150  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.316293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0275  transcriptional regulator, LacI family  35.29 
 
 		 339 aa  151  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.555598 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.88 
 
 		 336 aa  150  4e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348221  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1187  LacI family regulatory protein  34.48 
 
 		 384 aa  150  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.34285  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2822  LacI family transcription regulator  34.4 
 
 		 352 aa  149  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531617  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0911  transcriptional regulator, LacI family  32.94 
 
 		 332 aa  149  6e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3049  transcriptional regulator, LacI family  30.17 
 
 		 336 aa  149  8e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.490257  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0892  LacI family transcription regulator  32.29 
 
 		 346 aa  148  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00803151  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1883  LacI family transcription regulator  29.34 
 
 		 351 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0216034  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.9 
 
 		 333 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1214  transcriptional regulator, LacI family  34.11 
 
 		 333 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000107104  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6278  transcriptional regulator, LacI family  36.23 
 
 		 338 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  31.9 
 
 		 333 aa  147  3e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3030  transcriptional regulator, LacI family  36.55 
 
 		 342 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1685  transcriptional regulator, LacI family  33.72 
 
 		 337 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04200  transcriptional regulator, LacI family  30.81 
 
 		 341 aa  145  8.000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6720  transcriptional regulator, LacI family  33.97 
 
 		 374 aa  145  9e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.396206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2686  transcriptional regulator, LacI family  34.99 
 
 		 340 aa  145  9e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0663  transcriptional regulator, LacI family  30.06 
 
 		 338 aa  145  1e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04250  transcriptional regulator, LacI family  30.32 
 
 		 337 aa  144  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.335349  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20880  transcriptional regulator, LacI family  29.86 
 
 		 343 aa  143  4e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  33.04 
 
 		 348 aa  142  6e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0582  alanine racemase  30.47 
 
 		 337 aa  142  6e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2788  transcriptional regulator, LacI family  34.97 
 
 		 339 aa  142  7e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  32.37 
 
 		 349 aa  142  8e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  33.04 
 
 		 332 aa  142  8e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  30.41 
 
 		 386 aa  142  9e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  31.5 
 
 		 368 aa  142  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2799  transcriptional regulator, LacI family  35.01 
 
 		 340 aa  142  9.999999999999999e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4539  transcriptional regulator, LacI family  33.14 
 
 		 350 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.166389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0279  transcriptional regulator, LacI family  35.6 
 
 		 351 aa  140  3e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0832  LacI family transcription regulator  30.34 
 
 		 346 aa  140  3e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3654  LacI family transcription regulator  32.27 
 
 		 354 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  30.41 
 
 		 329 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0809  transcriptional regulator, LacI family  32.74 
 
 		 344 aa  140  4.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.119427 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  33.55 
 
 		 333 aa  139  6e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1398  ribose operon repressor RbsR  30.65 
 
 		 334 aa  139  7e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1640  LacI family transcription regulator  29.15 
 
 		 332 aa  139  7.999999999999999e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4333  transcriptional regulator, LacI family  35.03 
 
 		 340 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.706731 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  31.94 
 
 		 355 aa  139  8.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4113  transcriptional repressor RbsR  30.99 
 
 		 332 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.493547  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0352  transcriptional regulator, LacI family  28.53 
 
 		 339 aa  139  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4169  transcriptional repressor RbsR  30.5 
 
 		 332 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.451515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0007  transcriptional regulator, LacI family  31.09 
 
 		 337 aa  138  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0283  LacI family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 342 aa  138  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.881799  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3179  transcriptional regulator, LacI family  33.05 
 
 		 355 aa  138  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.588941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2686  transcriptional regulator, LacI family  31.52 
 
 		 340 aa  138  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.241666  normal  0.163804 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0870  LacI family transcription regulator  34.81 
 
 		 328 aa  137  2e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.15 
 
 		 336 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0624  LacI family transcription regulator  30.81 
 
 		 348 aa  137  4e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.393739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2870  transcriptional regulator, LacI family  32.66 
 
 		 342 aa  137  4e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1732  transcriptional regulator, LacI family  33.43 
 
 		 340 aa  137  4e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521835  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>