More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2090 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2090  LacI family transcription regulator  100 
 
 		 338 aa  676    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1320  LacI family transcription regulator  50.45 
 
 		 342 aa  308  1.0000000000000001e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.593334  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1032  transcriptional regulator, LacI family  45.27 
 
 		 376 aa  245  6e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1847  LacI family transcription regulator  41.19 
 
 		 346 aa  241  1e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1769  LacI family transcription regulator  41.19 
 
 		 346 aa  241  2e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1870  LacI family transcription regulator  42.17 
 
 		 342 aa  240  2e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075643 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1772  transcriptional regulator, LacI family protein  41.34 
 
 		 345 aa  238  2e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.297999  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2244  LacI family transcription regulator  40.6 
 
 		 351 aa  236  4e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2196  LacI family transcription regulator  39.88 
 
 		 340 aa  235  7e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0908748  hitchhiker  0.000488625 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2345  alanine racemase  40 
 
 		 351 aa  232  5e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2461  LacI family transcription regulator  40 
 
 		 351 aa  232  5e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0661891  normal  0.518687 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2356  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  40 
 
 		 348 aa  232  7.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2002  transcriptional regulator, LacI family  40 
 
 		 348 aa  231  9e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000460258 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1887  LacI family transcription regulator  42.99 
 
 		 344 aa  231  9e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.587669  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2252  LacI family transcription regulator  40.6 
 
 		 346 aa  231  1e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.305473 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1655  LacI family transcription regulator  41.34 
 
 		 366 aa  231  1e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.677065  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0974  putative sugar-binding protein  39.88 
 
 		 340 aa  231  2e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2185  LacI family transcription regulator  39.82 
 
 		 339 aa  231  2e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0597  LacI family transcription regulator  42.17 
 
 		 344 aa  230  3e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.10797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01891  putative sugar-binding protein  41.85 
 
 		 343 aa  230  3e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0103851  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1820  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  41.53 
 
 		 345 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0591  LacI family transcription regulator  38.01 
 
 		 344 aa  220  1.9999999999999999e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0167634 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2960  transcriptional regulator, LacI family  35.14 
 
 		 337 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.430193 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02412  transcriptional regulator  35.31 
 
 		 343 aa  163  4.0000000000000004e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3237  LacI family transcription regulator  37.13 
 
 		 343 aa  158  1e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0392  LacI family transcription regulator  36.34 
 
 		 330 aa  156  4e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0318668 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3304  LacI family transcription regulator  35.92 
 
 		 335 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.547709 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0226  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.99 
 
 		 355 aa  154  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.586057  normal  0.327461 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1895  LacI family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 339 aa  152  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.371942 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4691  transcriptional regulator, LacI family  34.82 
 
 		 340 aa  150  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0374666  normal  0.162999 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2737  LacI family transcription regulator  33.13 
 
 		 337 aa  149  5e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.771788 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04030  transcriptional regulator  36.47 
 
 		 351 aa  147  3e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4088  LacI family transcription regulator  32.52 
 
 		 337 aa  146  5e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3960  LacI family transcription regulator  33.33 
 
 		 340 aa  146  6e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.292064 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0303  LacI family transcription regulator  35.58 
 
 		 335 aa  145  8.000000000000001e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.139649 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3504  transcriptional regulator, LacI family protein  32.68 
 
 		 340 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0875897  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1823  LacI family transcription regulator  31.07 
 
 		 341 aa  143  4e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.288921  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1732  transcriptional regulator, LacI family  34.08 
 
 		 340 aa  140  3e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521835  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0978  LacI family transcription regulator  31.94 
 
 		 339 aa  139  4.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3227  LacI family transcription regulator  34.86 
 
 		 362 aa  139  6e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1435  LacI family transcription regulator  31.85 
 
 		 339 aa  139  6e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0140184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1876  LacI family transcription regulator  28.28 
 
 		 345 aa  139  7.999999999999999e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0838  LacI family transcriptional regulator  34.7 
 
 		 331 aa  139  8.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.620074  normal  0.213955 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  31.46 
 
 		 333 aa  137  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0418  alanine racemase  29.77 
 
 		 338 aa  138  2e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.923997  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3721  transcriptional regulator  35.53 
 
 		 350 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.940328  normal  0.590974 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3312  LacI family transcription regulator  29.34 
 
 		 336 aa  134  3e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0938  LacI family transcription regulator  33.13 
 
 		 340 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0104625  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1883  LacI family transcription regulator  27.22 
 
 		 351 aa  133  3.9999999999999996e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0216034  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0454  LacI family transcription regulator  33.63 
 
 		 339 aa  132  6e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2281  transcriptional regulator, LacI family  31.63 
 
 		 334 aa  131  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  30.41 
 
 		 333 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.41 
 
 		 333 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0967  LacI family transcription regulator  33.13 
 
 		 352 aa  131  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.934127 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.24 
 
 		 336 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348221  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5463  LacI family transcription regulator  34.41 
 
 		 344 aa  129  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.316293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4368  transcriptional regulator, LacI family  35.03 
 
 		 347 aa  129  7.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.0119453 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1561  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.81 
 
 		 348 aa  129  8.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.63047 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4283  LacI family transcription regulator  31.85 
 
 		 341 aa  129  8.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3394  transcriptional regulator  31.49 
 
 		 361 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.330741 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6278  transcriptional regulator, LacI family  35.02 
 
 		 338 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0892  LacI family transcription regulator  29.07 
 
 		 346 aa  128  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00803151  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  30.59 
 
 		 368 aa  127  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0177  transcriptional regulator, LacI family  26.79 
 
 		 343 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1789  transcriptional regulator, LacI family  33.43 
 
 		 343 aa  128  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1317  transcriptional regulator, LacI family  34.27 
 
 		 359 aa  127  3e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.914568 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0582  alanine racemase  29.41 
 
 		 337 aa  127  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1510  LacI family transcription regulator  32.66 
 
 		 348 aa  126  5e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014462 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1333  transcriptional regulator, LacI family  31.75 
 
 		 347 aa  126  6e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00834702  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1187  LacI family regulatory protein  34.52 
 
 		 384 aa  126  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.34285  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  30.77 
 
 		 348 aa  126  6e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  32.25 
 
 		 339 aa  126  6e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0565  LacI family transcription regulator  32.87 
 
 		 339 aa  125  7e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.344337 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1107  LacI family transcription regulator  35.4 
 
 		 345 aa  125  8.000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.151967 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  29.9 
 
 		 355 aa  125  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3529  transcriptional regulator, LacI family  34.58 
 
 		 333 aa  125  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3030  transcriptional regulator, LacI family  34.01 
 
 		 342 aa  125  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2822  LacI family transcription regulator  33.87 
 
 		 352 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531617  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2155  transcriptional regulator, LacI family  32.31 
 
 		 338 aa  124  2e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.677334  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.03 
 
 		 336 aa  124  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36400  transcriptional regulator  35.05 
 
 		 346 aa  124  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2250  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.69 
 
 		 335 aa  124  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4797  LacI family transcription regulator  33.04 
 
 		 336 aa  124  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.184791  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4116  alanine racemase  32.57 
 
 		 334 aa  123  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23020  transcriptional regulator, LacI family  27.38 
 
 		 336 aa  123  4e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000406909  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08380  transcriptional regulator  36.63 
 
 		 351 aa  123  5e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.689367  normal  0.241125 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0402  transcriptional regulator, LacI family  30.35 
 
 		 339 aa  123  5e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000159796  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5038  transcriptional regulator LacI family  32.01 
 
 		 337 aa  122  6e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0911  transcriptional regulator, LacI family  34.01 
 
 		 332 aa  122  8e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1685  transcriptional regulator, LacI family  32.48 
 
 		 337 aa  122  8e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2799  transcriptional regulator, LacI family  34.73 
 
 		 340 aa  122  9e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0942  LacI family transcription regulator  35.15 
 
 		 340 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3383  LacI family transcription regulator  33.33 
 
 		 344 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0237122 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0134  LacI family transcription regulator  33.33 
 
 		 343 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0325  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.04 
 
 		 335 aa  121  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0426  transcriptional regulator, LacI family  31.38 
 
 		 381 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0415  LacI family transcription regulator  33.04 
 
 		 335 aa  121  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.280412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1878  transcriptional regulator, LacI family  35 
 
 		 351 aa  121  1.9999999999999998e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0941149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  32.19 
 
 		 473 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0279  transcriptional regulator, LacI family  32.05 
 
 		 351 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>