More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_36400 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_36400  transcriptional regulator  100 
 
 		 346 aa  671    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3720  transcriptional regulator, LacI family  43.12 
 
 		 335 aa  206  5e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3918  LacI family transcription regulator  41.08 
 
 		 341 aa  189  5e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1332  regulatory protein LacI  43.13 
 
 		 315 aa  183  3e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.114826 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0558  transcriptional regulator, LacI family  43.69 
 
 		 326 aa  176  8e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0418  alanine racemase  30.74 
 
 		 338 aa  168  1e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.923997  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19260  transcriptional regulator  40.97 
 
 		 327 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.203799  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  31.37 
 
 		 333 aa  154  2e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.37 
 
 		 333 aa  154  2e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  30 
 
 		 355 aa  153  5e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4573  LacI family transcription regulator  37.89 
 
 		 326 aa  152  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0936264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  33.11 
 
 		 332 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  33.33 
 
 		 333 aa  145  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  27.74 
 
 		 335 aa  145  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2385  transcriptional regulator, LacI family  34.71 
 
 		 346 aa  142  8e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.171577  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03100  transcriptional regulator, LacI family  37.05 
 
 		 345 aa  142  9e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0219145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2245  LacI family transcription regulator  35.67 
 
 		 338 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.115687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0961  transcriptional regulator, LacI family  34.72 
 
 		 359 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2273  LacI family transcription regulator  34.18 
 
 		 333 aa  140  3e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0311079  hitchhiker  0.000018406 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1871  transcriptional regulator, LacI family  38.22 
 
 		 333 aa  140  3.9999999999999997e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3676  LacI family transcription regulator  34.63 
 
 		 323 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.259551 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  33.68 
 
 		 329 aa  139  6e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23020  transcriptional regulator, LacI family  29.57 
 
 		 336 aa  139  7.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000406909  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4427  catabolite control protein A  29.77 
 
 		 332 aa  138  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0832  LacI family transcription regulator  29.15 
 
 		 346 aa  138  1e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0408  transcriptional regulator, LacI family  35.76 
 
 		 335 aa  138  1e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1598  LacI family transcription regulator  28.23 
 
 		 333 aa  138  1e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0971431  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4790  catabolite control protein A  29.64 
 
 		 332 aa  138  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0362  transcriptional regulator, LacI family  31.73 
 
 		 337 aa  137  2e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0385  transcriptional regulator, LacI family  35.62 
 
 		 334 aa  137  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4896  transcriptional repressor RbsR  35.76 
 
 		 333 aa  137  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000156613  hitchhiker  0.000000782419 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0008  transcriptional regulator, LacI family  31.01 
 
 		 337 aa  137  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0734  transcriptional regulator, LacI family  31.23 
 
 		 336 aa  138  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4410  catabolite control protein A  29.45 
 
 		 332 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01040  transcriptional regulator  34.08 
 
 		 336 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4795  catabolite control protein A  29.45 
 
 		 332 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4506  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  29.45 
 
 		 332 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4813  catabolite control protein A  29.77 
 
 		 332 aa  137  4e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4575  catabolite control protein A  29.45 
 
 		 332 aa  136  4e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4929  catabolite control protein A  29.45 
 
 		 332 aa  136  4e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  26.84 
 
 		 333 aa  137  4e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2699  transcriptional regulator, LacI family  34.47 
 
 		 339 aa  136  5e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0449  catabolite control protein A  29.32 
 
 		 332 aa  136  5e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0007  transcriptional regulator, LacI family  31.83 
 
 		 337 aa  135  8e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4278  transcriptional repressor RbsR  33.11 
 
 		 332 aa  135  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.134192  normal  0.933942 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2281  transcriptional regulator, LacI family  31.58 
 
 		 334 aa  135  9e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1736  transcriptional regulator, LacI family  31.49 
 
 		 333 aa  135  9.999999999999999e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000004003  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3973  transcriptional repressor RbsR  34.07 
 
 		 338 aa  135  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000131921  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4321  transcriptional regulator, LacI family  35.53 
 
 		 348 aa  135  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.794794  hitchhiker  0.00774423 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.62 
 
 		 336 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5484  LacI family transcription regulator  33.7 
 
 		 345 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238485 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4539  transcriptional regulator, LacI family  34.47 
 
 		 350 aa  135  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.166389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3342  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  29.32 
 
 		 332 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4098  transcriptional repressor RbsR  32.79 
 
 		 332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.396512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  32.89 
 
 		 348 aa  134  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4811  catabolite control protein A  29.32 
 
 		 332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1725  transcriptional regulator, LacI family  31.06 
 
 		 338 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2354  LacI family transcription regulator  34.16 
 
 		 344 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0756754  normal  0.112701 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0591  LacI family transcription regulator  28.62 
 
 		 344 aa  134  3e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0167634 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4219  transcriptional repressor RbsR  32.79 
 
 		 332 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.817954  normal  0.878921 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.01 
 
 		 330 aa  134  3e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  35.17 
 
 		 347 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  34.5 
 
 		 346 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1655  LacI family transcription regulator  30.86 
 
 		 366 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.677065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4169  transcriptional repressor RbsR  32.79 
 
 		 332 aa  133  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.451515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4113  transcriptional repressor RbsR  32.79 
 
 		 332 aa  132  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.493547  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0698  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  31.94 
 
 		 330 aa  132  6e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1234  LacI family transcription regulator  31.36 
 
 		 343 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50127  normal  0.134178 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0728  transcriptional regulator, LacI family  31.06 
 
 		 337 aa  132  7.999999999999999e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.3979  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4368  transcriptional regulator, LacI family  37 
 
 		 347 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.0119453 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  35.19 
 
 		 349 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4929  LacI family transcription regulator  33.06 
 
 		 346 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.33528  normal  0.200034 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3896  transcriptional regulator, LacI family  35.2 
 
 		 341 aa  132  1.0000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.469202 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  34.19 
 
 		 346 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3061  transcriptional regulator, LacI family  31 
 
 		 326 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  29.03 
 
 		 332 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2733  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  30.84 
 
 		 331 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0892  transcriptional regulator, LacI family  33.43 
 
 		 348 aa  131  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.774645  normal  0.081922 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  28.52 
 
 		 342 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  33.12 
 
 		 331 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1916  LacI family transcription regulator  31.91 
 
 		 335 aa  131  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0426  transcriptional regulator, LacI family  31.78 
 
 		 381 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  30.39 
 
 		 342 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4270  transcriptional repressor RbsR  33.11 
 
 		 330 aa  130  3e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000205239  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1193  transcriptional regulator, LacI family  29.57 
 
 		 326 aa  130  3e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.502548  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3243  HTH-type transcriptional regulator AscG  31.12 
 
 		 340 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000054765 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3283  LacI family transcription regulator  30.07 
 
 		 338 aa  130  3e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8999  transcriptional regulator  32.77 
 
 		 361 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.450526  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2370  ribose operon repressor  34.83 
 
 		 338 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2386  LacI family transcription regulator  30.56 
 
 		 336 aa  130  4.0000000000000003e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.737452  normal  0.472555 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1078  transcriptional regulator, LacI family  34.03 
 
 		 334 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00527595 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4122  transcriptional repressor RbsR  33.11 
 
 		 330 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.305602  normal  0.0911869 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5190  transcriptional repressor RbsR  33.11 
 
 		 330 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00327915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0228  LacI family transcription regulator  35.41 
 
 		 334 aa  130  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003941  transcriptional regulator LacI family protein  31.6 
 
 		 334 aa  130  4.0000000000000003e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3331  regulatory protein LacI  34.03 
 
 		 334 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3344  HTH-type transcriptional regulator AscG  31.12 
 
 		 339 aa  129  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.718161  normal  0.0271899 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11680  transcriptional regulator  33.01 
 
 		 336 aa  129  6e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0006  ribose operon repressor  31.27 
 
 		 334 aa  129  6e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.038565  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3616  LacI family transcription regulator  31.58 
 
 		 345 aa  129  6e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.427646 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>