More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0241 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0241  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 348 aa  683    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.268594  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0748  transcriptional regulator, LacI family  53.31 
 
 		 346 aa  310  2.9999999999999997e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0494571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2892  transcriptional regulator, LacI family  49.7 
 
 		 340 aa  306  5.0000000000000004e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.207309  normal  0.956989 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0371  transcriptional regulator, LacI family  50.61 
 
 		 339 aa  300  2e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.802173 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0219  LacI family transcription regulator  50.92 
 
 		 351 aa  295  6e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6224  HTH-type transcriptional repressor PurR  49.56 
 
 		 348 aa  295  9e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.348111 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0870  LacI family transcription regulator  47.85 
 
 		 328 aa  290  2e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4680  LacI family transcription regulator  50.74 
 
 		 336 aa  288  1e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0406203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4997  transcriptional regulator, LacI family  52.33 
 
 		 372 aa  284  2.0000000000000002e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.385337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4084  HTH-type transcriptional repressor PurR  49.39 
 
 		 346 aa  283  2.0000000000000002e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.932111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2947  regulatory protein LacI  48.52 
 
 		 359 aa  276  5e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.407921  normal  0.301474 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3275  transcriptional regulator, LacI family  48.65 
 
 		 333 aa  272  8.000000000000001e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.183529  hitchhiker  0.00604574 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1860  transcriptional regulator, LacI family  49.1 
 
 		 338 aa  268  1e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11590  transcriptional regulator  47.72 
 
 		 362 aa  265  8e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.042152 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06900  transcriptional regulator, LacI family  48.04 
 
 		 339 aa  262  4.999999999999999e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06590  transcriptional regulator, LacI family  45.06 
 
 		 359 aa  259  4e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2577  transcriptional regulator, LacI family  46.4 
 
 		 346 aa  257  2e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.215831  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1925  LacI family transcription regulator  45.24 
 
 		 358 aa  254  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.149363  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4705  transcriptional regulator, LacI family  47.92 
 
 		 359 aa  252  6e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.102612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0379  LacI family transcription regulator  48.49 
 
 		 342 aa  250  2e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.676966  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4716  transcriptional regulator, LacI family  45.25 
 
 		 346 aa  249  4e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04300  transcriptional regulator, LacI family  45.45 
 
 		 352 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0495  transcriptional regulator, LacI family  39.76 
 
 		 335 aa  238  1e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.448967  normal  0.778992 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3042  transcriptional regulator, LacI family  44.55 
 
 		 359 aa  236  4e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0100  transcriptional regulator, LacI family  42.11 
 
 		 348 aa  233  4.0000000000000004e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0658146  normal  0.053402 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1918  LacI family transcription regulator  40.06 
 
 		 368 aa  230  3e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.04786  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0276  transcriptional regulator, LacI family  42.86 
 
 		 342 aa  228  1e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0400  transcriptional regulator, LacI family  44.41 
 
 		 346 aa  218  7.999999999999999e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29490  transcriptional regulator  41.79 
 
 		 340 aa  207  3e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1262  lac repressor  37.78 
 
 		 357 aa  204  1e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000349798  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2732  lac repressor  38.19 
 
 		 357 aa  204  1e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.02392  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0916  transcriptional regulator, LacI family  43.07 
 
 		 345 aa  203  3e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.684035  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0927  lac repressor  37.16 
 
 		 355 aa  202  6e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0196781  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1363  lac repressor  38.02 
 
 		 358 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.269161  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1769  lac repressor  37.82 
 
 		 358 aa  196  3e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.044739  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3665  LacI family transcription regulator  37.17 
 
 		 343 aa  196  7e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2013  lac repressor  36.78 
 
 		 356 aa  195  1e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.735803 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3358  lac repressor  32.93 
 
 		 357 aa  187  3e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2911  transcriptional regulator, LacI family  41.02 
 
 		 342 aa  187  3e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0976  lac repressor  32.93 
 
 		 357 aa  187  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0922  lac repressor  32.63 
 
 		 357 aa  185  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2480  transcriptional regulator, LacI family  43.89 
 
 		 341 aa  184  2.0000000000000003e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.725797  normal  0.877473 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0283  LacI family transcriptional regulator  38.51 
 
 		 342 aa  184  2.0000000000000003e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.881799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01060  transcriptional regulator  38.05 
 
 		 340 aa  182  5.0000000000000004e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0887305  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0930  LacI family response repressor  35.87 
 
 		 328 aa  182  6e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.562853  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1283  lac repressor  34.13 
 
 		 357 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  38.76 
 
 		 353 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  36.58 
 
 		 340 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2858  LacI family transcription regulator  35.05 
 
 		 343 aa  178  1e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.640321  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  37.5 
 
 		 339 aa  177  2e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3179  transcriptional regulator, LacI family  39.59 
 
 		 355 aa  177  3e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.588941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0559  transcriptional regulator, LacI family  36.8 
 
 		 337 aa  176  6e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  36.28 
 
 		 340 aa  176  6e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.67 
 
 		 336 aa  176  7e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2467  LacI family transcription regulator  35.63 
 
 		 336 aa  176  7e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  35.95 
 
 		 332 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  35.4 
 
 		 340 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2273  LacI family transcription regulator  37.69 
 
 		 333 aa  174  1.9999999999999998e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0311079  hitchhiker  0.000018406 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1550  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.56 
 
 		 328 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000390905  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03609  transcriptional regulator LacI family  37.21 
 
 		 350 aa  174  2.9999999999999996e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.34339  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1600  LacI family transcription regulator  35.24 
 
 		 328 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  36.1 
 
 		 353 aa  172  5.999999999999999e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4233  transcriptional repressor RbsR  34.04 
 
 		 328 aa  172  6.999999999999999e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00129115  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  34.64 
 
 		 331 aa  172  6.999999999999999e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  32.49 
 
 		 347 aa  171  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06943  hypothetical protein  36.45 
 
 		 334 aa  171  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00299  lac repressor  33.23 
 
 		 360 aa  171  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000126874  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10002  Lactose operon repressor  33.23 
 
 		 360 aa  171  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000792391  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3261  transcriptional regulator, LacI family  33.23 
 
 		 363 aa  171  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000862656  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  35.52 
 
 		 348 aa  171  2e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00703  hypothetical protein  33.23 
 
 		 360 aa  171  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000122917  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  37.76 
 
 		 333 aa  171  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3280  lac repressor  33.23 
 
 		 363 aa  171  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000820962  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00303  hypothetical protein  33.23 
 
 		 360 aa  171  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000170376  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  33.53 
 
 		 342 aa  171  2e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0409  lac repressor  32.93 
 
 		 363 aa  171  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  3.9973e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4278  transcriptional repressor RbsR  36.61 
 
 		 332 aa  170  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.134192  normal  0.933942 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0418  lac repressor  32.93 
 
 		 360 aa  169  6e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000822114  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  37.94 
 
 		 346 aa  169  6e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0369  lac repressor  32.93 
 
 		 363 aa  169  8e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000375664  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4113  transcriptional repressor RbsR  36.58 
 
 		 332 aa  169  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.493547  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4098  transcriptional repressor RbsR  36.31 
 
 		 332 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.396512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0376  lac repressor  33.43 
 
 		 360 aa  168  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000396722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2830  transcriptional regulator, LacI family  37.36 
 
 		 344 aa  168  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  37.46 
 
 		 346 aa  168  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4219  transcriptional repressor RbsR  36.31 
 
 		 332 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.817954  normal  0.878921 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04075  galactose operon repressor  33.84 
 
 		 333 aa  168  1e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  34.12 
 
 		 342 aa  168  1e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4169  transcriptional repressor RbsR  36.28 
 
 		 332 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.451515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1559  alanine racemase  32.69 
 
 		 333 aa  168  1e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000066632  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0817  transcriptional regulator, LacI family  36.8 
 
 		 342 aa  167  2e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.533751  normal  0.134467 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15580  transcriptional regulator, LacI family  30.95 
 
 		 336 aa  167  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0402  transcriptional regulator, LacI family  30.03 
 
 		 339 aa  168  2e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000159796  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0768  LacI family transcription regulator  37.28 
 
 		 332 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0915061  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  30.77 
 
 		 335 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  35.57 
 
 		 340 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3227  LacI family transcription regulator  37.65 
 
 		 362 aa  166  4e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0006  ribose operon repressor  33.73 
 
 		 334 aa  166  5e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.038565  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  35.38 
 
 		 368 aa  166  5.9999999999999996e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0297  LacI family transcription regulator  35.76 
 
 		 340 aa  165  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>