More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1262 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_1262  lac repressor  100 
 
 		 357 aa  721    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000349798  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2732  lac repressor  69.66 
 
 		 357 aa  480  1e-134  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.02392  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1363  lac repressor  62.36 
 
 		 358 aa  427  1e-118  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.269161  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1769  lac repressor  62.08 
 
 		 358 aa  424  1e-117  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.044739  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0418  lac repressor  51.7 
 
 		 360 aa  333  2e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000822114  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3261  transcriptional regulator, LacI family  50.99 
 
 		 363 aa  332  5e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000862656  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3280  lac repressor  50.99 
 
 		 363 aa  332  5e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000820962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0369  lac repressor  50.99 
 
 		 363 aa  332  6e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000375664  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00299  lac repressor  51.42 
 
 		 360 aa  332  7.000000000000001e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000126874  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10002  Lactose operon repressor  51.42 
 
 		 360 aa  332  7.000000000000001e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000792391  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00303  hypothetical protein  51.42 
 
 		 360 aa  332  7.000000000000001e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000170376  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00703  hypothetical protein  51.42 
 
 		 360 aa  332  7.000000000000001e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000122917  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0376  lac repressor  51.42 
 
 		 360 aa  332  7.000000000000001e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000396722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0409  lac repressor  50.7 
 
 		 363 aa  332  8e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  3.9973e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0927  lac repressor  51.29 
 
 		 355 aa  330  2e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0196781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0922  lac repressor  45.63 
 
 		 357 aa  308  9e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3358  lac repressor  45.63 
 
 		 357 aa  307  2.0000000000000002e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0976  lac repressor  45.63 
 
 		 357 aa  307  2.0000000000000002e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1283  lac repressor  44.51 
 
 		 357 aa  300  3e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2013  lac repressor  42.34 
 
 		 356 aa  247  2e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.735803 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0371  transcriptional regulator, LacI family  41.85 
 
 		 339 aa  235  7e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.802173 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2892  transcriptional regulator, LacI family  39.51 
 
 		 340 aa  222  9e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.207309  normal  0.956989 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0219  LacI family transcription regulator  40.42 
 
 		 351 aa  222  9.999999999999999e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0870  LacI family transcription regulator  37.65 
 
 		 328 aa  207  2e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3275  transcriptional regulator, LacI family  41.02 
 
 		 333 aa  206  4e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.183529  hitchhiker  0.00604574 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0241  transcriptional regulator, LacI family  37.78 
 
 		 348 aa  204  1e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.268594  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0379  LacI family transcription regulator  39.51 
 
 		 342 aa  200  3e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.676966  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29490  transcriptional regulator  39.7 
 
 		 340 aa  199  6e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06900  transcriptional regulator, LacI family  38.18 
 
 		 339 aa  196  6e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0495  transcriptional regulator, LacI family  36.94 
 
 		 335 aa  195  8.000000000000001e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.448967  normal  0.778992 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6224  HTH-type transcriptional repressor PurR  38.29 
 
 		 348 aa  195  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.348111 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3665  LacI family transcription regulator  35.01 
 
 		 343 aa  194  3e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4084  HTH-type transcriptional repressor PurR  35.65 
 
 		 346 aa  192  6e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.932111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4997  transcriptional regulator, LacI family  39.93 
 
 		 372 aa  192  7e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.385337 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4680  LacI family transcription regulator  36.84 
 
 		 336 aa  191  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0406203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0512  LacI family transcription regulator  36.56 
 
 		 336 aa  189  9e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2947  regulatory protein LacI  40.06 
 
 		 359 aa  188  1e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.407921  normal  0.301474 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4705  transcriptional regulator, LacI family  38.16 
 
 		 359 aa  187  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.102612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11590  transcriptional regulator  34.3 
 
 		 362 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.042152 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1860  transcriptional regulator, LacI family  36.54 
 
 		 338 aa  183  3e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4716  transcriptional regulator, LacI family  37.16 
 
 		 346 aa  182  7e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0276  transcriptional regulator, LacI family  36.06 
 
 		 342 aa  182  9.000000000000001e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  39.21 
 
 		 333 aa  181  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1925  LacI family transcription regulator  35.74 
 
 		 358 aa  181  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.149363  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3623  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.65 
 
 		 335 aa  180  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.487296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  35 
 
 		 335 aa  180  4e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  35.28 
 
 		 355 aa  179  9e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  34.91 
 
 		 386 aa  176  5e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1918  LacI family transcription regulator  33.43 
 
 		 368 aa  176  5e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.04786  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1506  LacI family transcription regulator  37.01 
 
 		 343 aa  176  8e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1525  LacI family transcription regulator  37.01 
 
 		 343 aa  176  8e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420738  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  37.95 
 
 		 353 aa  175  9e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0559  transcriptional regulator, LacI family  34.72 
 
 		 337 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1628  LacI family transcription regulator  36.72 
 
 		 343 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4748  LacI family transcription regulator  36.12 
 
 		 343 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1129  LacI family transcription regulator  36.12 
 
 		 343 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1586  LacI family transcription regulator  36.12 
 
 		 343 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122412  normal  0.650271 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1609  LacI family transcription regulator  36.12 
 
 		 343 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0684889  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  36.47 
 
 		 368 aa  173  2.9999999999999996e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0777  LacI transcriptional regulator  37.35 
 
 		 337 aa  173  5e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.185303 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1234  LacI family transcription regulator  33.43 
 
 		 343 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50127  normal  0.134178 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  37.12 
 
 		 347 aa  171  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  36.91 
 
 		 346 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3383  LacI family transcription regulator  35.51 
 
 		 342 aa  172  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  34.94 
 
 		 332 aa  171  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06590  transcriptional regulator, LacI family  35.62 
 
 		 359 aa  170  4e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  35.91 
 
 		 346 aa  169  6e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3042  transcriptional regulator, LacI family  35.6 
 
 		 359 aa  169  8e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0006  ribose operon repressor  31.58 
 
 		 334 aa  169  8e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.038565  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15580  transcriptional regulator, LacI family  31.83 
 
 		 336 aa  169  9e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0748  transcriptional regulator, LacI family  35.18 
 
 		 346 aa  169  9e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0494571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1754  transcriptional regulator, LacI family  38.29 
 
 		 344 aa  168  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000321603 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2022  ribose operon repressor RbsR  35.42 
 
 		 343 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.662423  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1857  ribose operon repressor RbsR  35.42 
 
 		 343 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1870  ribose operon repressor RbsR  35.42 
 
 		 343 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.585666  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4111  transcriptional repressor RbsR  33.43 
 
 		 333 aa  168  1e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0488485  normal  0.0159443 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23020  transcriptional regulator, LacI family  32.65 
 
 		 336 aa  168  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000406909  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2858  LacI family transcription regulator  36.71 
 
 		 343 aa  167  2e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.640321  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2577  transcriptional regulator, LacI family  36.17 
 
 		 346 aa  168  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.215831  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2154  LacI transcriptional regulator  37.01 
 
 		 338 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0306626  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3173  transcriptional regulator, LacI family  38.29 
 
 		 342 aa  167  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.579609 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.44 
 
 		 336 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  30.5 
 
 		 341 aa  167  4e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04300  transcriptional regulator, LacI family  35.98 
 
 		 352 aa  167  4e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06141  hypothetical protein  30.15 
 
 		 336 aa  166  4e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0100  transcriptional regulator, LacI family  34.76 
 
 		 348 aa  166  5.9999999999999996e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0658146  normal  0.053402 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2472  ribose operon repressor RbsR  35.12 
 
 		 343 aa  166  8e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  33.93 
 
 		 340 aa  166  8e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1685  transcriptional regulator, LacI family  35.1 
 
 		 337 aa  165  9e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  34.97 
 
 		 337 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39300  ribose operon repressor RbsR  34.73 
 
 		 337 aa  164  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00488223  normal  0.347554 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2830  transcriptional regulator, LacI family  35.12 
 
 		 344 aa  163  4.0000000000000004e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1922  LacI family transcription regulator  34.94 
 
 		 339 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.704174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2000  LacI family transcription regulator  33.43 
 
 		 346 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.121919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4270  transcriptional repressor RbsR  33.88 
 
 		 330 aa  163  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000205239  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  34.73 
 
 		 353 aa  162  6e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0402  transcriptional regulator, LacI family  30.21 
 
 		 339 aa  162  6e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000159796  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2260  transcriptional regulator, LacI family  33.43 
 
 		 346 aa  162  6e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.167374  normal  0.588495 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000337  ribose operon repressor  30.75 
 
 		 340 aa  162  7e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2370  ribose operon repressor  34.83 
 
 		 338 aa  161  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>