More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_0927 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009436  Ent638_0927  lac repressor  100 
 
 		 355 aa  718    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0196781  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2732  lac repressor  55.87 
 
 		 357 aa  373  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.02392  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00299  lac repressor  54.29 
 
 		 360 aa  365  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000126874  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10002  Lactose operon repressor  54.29 
 
 		 360 aa  365  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000792391  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0418  lac repressor  54.57 
 
 		 360 aa  365  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000822114  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00703  hypothetical protein  54.29 
 
 		 360 aa  365  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000122917  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00303  hypothetical protein  54.29 
 
 		 360 aa  365  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000170376  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0376  lac repressor  54.29 
 
 		 360 aa  364  1e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000396722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0369  lac repressor  54 
 
 		 363 aa  363  3e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000375664  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3261  transcriptional regulator, LacI family  54 
 
 		 363 aa  363  4e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000862656  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3280  lac repressor  54 
 
 		 363 aa  363  4e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000820962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0409  lac repressor  53.71 
 
 		 363 aa  362  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  3.9973e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1363  lac repressor  52.38 
 
 		 358 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.269161  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1769  lac repressor  51.54 
 
 		 358 aa  360  3e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.044739  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1262  lac repressor  51.29 
 
 		 357 aa  330  2e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000349798  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0922  lac repressor  44.1 
 
 		 357 aa  290  4e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3358  lac repressor  44.1 
 
 		 357 aa  289  7e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0976  lac repressor  44.1 
 
 		 357 aa  289  7e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1283  lac repressor  43.98 
 
 		 357 aa  287  2e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2013  lac repressor  40.23 
 
 		 356 aa  252  6e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.735803 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3275  transcriptional regulator, LacI family  42.9 
 
 		 333 aa  218  2e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.183529  hitchhiker  0.00604574 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0495  transcriptional regulator, LacI family  40.18 
 
 		 335 aa  214  2.9999999999999995e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.448967  normal  0.778992 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0870  LacI family transcription regulator  39.57 
 
 		 328 aa  212  7.999999999999999e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4680  LacI family transcription regulator  38.79 
 
 		 336 aa  205  8e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0406203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1918  LacI family transcription regulator  39.09 
 
 		 368 aa  204  1e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.04786  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0371  transcriptional regulator, LacI family  39.02 
 
 		 339 aa  204  2e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.802173 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0241  transcriptional regulator, LacI family  37.16 
 
 		 348 aa  202  6e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.268594  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6224  HTH-type transcriptional repressor PurR  38.48 
 
 		 348 aa  197  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.348111 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4997  transcriptional regulator, LacI family  40.74 
 
 		 372 aa  196  7e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.385337 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2892  transcriptional regulator, LacI family  36.7 
 
 		 340 aa  192  6e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.207309  normal  0.956989 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3042  transcriptional regulator, LacI family  39.09 
 
 		 359 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4716  transcriptional regulator, LacI family  38.32 
 
 		 346 aa  190  4e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0219  LacI family transcription regulator  38.74 
 
 		 351 aa  189  5e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3665  LacI family transcription regulator  35.31 
 
 		 343 aa  187  3e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1860  transcriptional regulator, LacI family  37.88 
 
 		 338 aa  186  4e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11590  transcriptional regulator  35.4 
 
 		 362 aa  186  6e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.042152 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06900  transcriptional regulator, LacI family  36.78 
 
 		 339 aa  186  7e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29490  transcriptional regulator  37.58 
 
 		 340 aa  182  7e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1925  LacI family transcription regulator  36.86 
 
 		 358 aa  181  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.149363  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2947  regulatory protein LacI  38.6 
 
 		 359 aa  181  2e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.407921  normal  0.301474 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4084  HTH-type transcriptional repressor PurR  36.16 
 
 		 346 aa  179  9e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.932111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  31.33 
 
 		 341 aa  177  2e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  34.54 
 
 		 340 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1128  transcriptional regulator, LacI family  34.52 
 
 		 361 aa  177  3e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06590  transcriptional regulator, LacI family  34.81 
 
 		 359 aa  177  3e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3623  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.13 
 
 		 335 aa  177  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.487296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4705  transcriptional regulator, LacI family  36.01 
 
 		 359 aa  176  5e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.102612  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0748  transcriptional regulator, LacI family  38.34 
 
 		 346 aa  176  6e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0494571  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  35.16 
 
 		 347 aa  175  9e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  35.74 
 
 		 340 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  34.21 
 
 		 340 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  35.08 
 
 		 346 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2577  transcriptional regulator, LacI family  36.14 
 
 		 346 aa  172  5.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.215831  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2281  transcriptional regulator, LacI family  34.95 
 
 		 334 aa  172  7.999999999999999e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4639  transcriptional regulator, LacI family  36.28 
 
 		 357 aa  172  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.496087  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  34.75 
 
 		 346 aa  171  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0379  LacI family transcription regulator  37.13 
 
 		 342 aa  171  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.676966  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0512  LacI family transcription regulator  33.64 
 
 		 336 aa  171  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2154  LacI transcriptional regulator  37.17 
 
 		 338 aa  170  3e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0306626  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  37.09 
 
 		 353 aa  170  3e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0559  transcriptional regulator, LacI family  35.05 
 
 		 337 aa  170  4e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2370  ribose operon repressor  35.86 
 
 		 338 aa  169  7e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  33.55 
 
 		 340 aa  169  8e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  35.26 
 
 		 353 aa  168  1e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0274  alanine racemase  35.03 
 
 		 340 aa  168  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  34.55 
 
 		 332 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0283  LacI family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 342 aa  167  2.9999999999999998e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.881799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  33.84 
 
 		 368 aa  167  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04300  transcriptional regulator, LacI family  37.88 
 
 		 352 aa  166  5e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0006  ribose operon repressor  31.19 
 
 		 334 aa  166  5.9999999999999996e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.038565  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0100  transcriptional regulator, LacI family  34.64 
 
 		 348 aa  165  9e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0658146  normal  0.053402 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1870  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.63 
 
 		 337 aa  165  9e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.796705  normal  0.714887 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4592  LacI family transcription regulator  33.98 
 
 		 327 aa  165  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0400  transcriptional regulator, LacI family  37.54 
 
 		 346 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  33.33 
 
 		 331 aa  164  3e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4170  transcriptional repressor RbsR  33.44 
 
 		 341 aa  164  3e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000181496  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003941  transcriptional regulator LacI family protein  32.48 
 
 		 334 aa  164  3e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1922  LacI family transcription regulator  33.73 
 
 		 339 aa  162  6e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.704174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0197  LacI family transcription regulator  35.42 
 
 		 340 aa  162  8.000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000337  ribose operon repressor  32.01 
 
 		 340 aa  162  9e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2686  transcriptional regulator, LacI family  33.33 
 
 		 340 aa  162  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6160  transcriptional regulator, LacI family  33.43 
 
 		 340 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00050807 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06141  hypothetical protein  31.4 
 
 		 336 aa  162  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7472  transcriptional regulator LacI family  34.23 
 
 		 339 aa  160  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0768  LacI family transcription regulator  34.56 
 
 		 332 aa  161  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0915061  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1032  DNA-binding transcriptional repressor PurR  31.68 
 
 		 333 aa  161  2e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.872659  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1525  LacI family transcription regulator  33.44 
 
 		 343 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4122  transcriptional repressor RbsR  33.44 
 
 		 330 aa  160  3e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.305602  normal  0.0911869 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1506  LacI family transcription regulator  33.44 
 
 		 343 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04250  transcriptional regulator, LacI family  30.65 
 
 		 337 aa  160  3e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.335349  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5190  transcriptional repressor RbsR  33.44 
 
 		 330 aa  160  3e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00327915  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03639  DNA-binding transcriptional repressor of ribose metabolism  33.44 
 
 		 330 aa  160  4e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00237415  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2472  ribose operon repressor RbsR  33.77 
 
 		 343 aa  160  4e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03584  hypothetical protein  33.44 
 
 		 330 aa  160  4e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00148852  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4233  transcriptional repressor RbsR  33.11 
 
 		 328 aa  160  4e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00129115  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5512  transcriptional regulator, LacI family  32.32 
 
 		 340 aa  159  5e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0234887 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4896  transcriptional repressor RbsR  31.23 
 
 		 333 aa  160  5e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000156613  hitchhiker  0.000000782419 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2022  ribose operon repressor RbsR  33.77 
 
 		 343 aa  159  6e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.662423  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1857  ribose operon repressor RbsR  33.77 
 
 		 343 aa  159  6e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4165  transcriptional repressor RbsR  33.12 
 
 		 330 aa  159  6e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0172446  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>