More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2911 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_2911  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 342 aa  670    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2480  transcriptional regulator, LacI family  46.56 
 
 		 341 aa  235  9e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.725797  normal  0.877473 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6224  HTH-type transcriptional repressor PurR  40.88 
 
 		 348 aa  215  7e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.348111 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0572  LacI family response repressor  41.08 
 
 		 338 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.379149  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4705  transcriptional regulator, LacI family  42.62 
 
 		 359 aa  207  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.102612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2892  transcriptional regulator, LacI family  40.18 
 
 		 340 aa  206  6e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.207309  normal  0.956989 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0371  transcriptional regulator, LacI family  39.58 
 
 		 339 aa  206  6e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.802173 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04300  transcriptional regulator, LacI family  41.96 
 
 		 352 aa  204  2e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0100  transcriptional regulator, LacI family  41.49 
 
 		 348 aa  203  3e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0658146  normal  0.053402 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0870  LacI family transcription regulator  39.26 
 
 		 328 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1860  transcriptional regulator, LacI family  42.34 
 
 		 338 aa  201  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4084  HTH-type transcriptional repressor PurR  39.64 
 
 		 346 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.932111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4680  LacI family transcription regulator  40 
 
 		 336 aa  199  5e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0406203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0219  LacI family transcription regulator  37.88 
 
 		 351 aa  197  3e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4716  transcriptional regulator, LacI family  40.43 
 
 		 346 aa  196  5.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0241  transcriptional regulator, LacI family  41.02 
 
 		 348 aa  195  8.000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.268594  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4997  transcriptional regulator, LacI family  39.76 
 
 		 372 aa  191  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.385337 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06900  transcriptional regulator, LacI family  38.37 
 
 		 339 aa  187  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0748  transcriptional regulator, LacI family  39.47 
 
 		 346 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0494571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11590  transcriptional regulator  39.94 
 
 		 362 aa  183  4.0000000000000006e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.042152 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2947  regulatory protein LacI  39.41 
 
 		 359 aa  182  8.000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.407921  normal  0.301474 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1918  LacI family transcription regulator  36.28 
 
 		 368 aa  182  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.04786  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06590  transcriptional regulator, LacI family  37.5 
 
 		 359 aa  181  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3042  transcriptional regulator, LacI family  38.76 
 
 		 359 aa  178  1e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0379  LacI family transcription regulator  39.07 
 
 		 342 aa  177  3e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.676966  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3275  transcriptional regulator, LacI family  37.69 
 
 		 333 aa  173  2.9999999999999996e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.183529  hitchhiker  0.00604574 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0916  transcriptional regulator, LacI family  41.54 
 
 		 345 aa  174  2.9999999999999996e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.684035  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2577  transcriptional regulator, LacI family  37.06 
 
 		 346 aa  171  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.215831  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0495  transcriptional regulator, LacI family  33.63 
 
 		 335 aa  164  2.0000000000000002e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.448967  normal  0.778992 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0400  transcriptional regulator, LacI family  35.73 
 
 		 346 aa  159  9e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1769  lac repressor  32.63 
 
 		 358 aa  155  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.044739  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  35 
 
 		 348 aa  154  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0728  transcriptional regulator, LacI family  34 
 
 		 337 aa  153  5e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.3979  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2370  ribose operon repressor  35.19 
 
 		 338 aa  151  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0416  LacI family transcription regulator  35.67 
 
 		 349 aa  150  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.339437  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1363  lac repressor  31.64 
 
 		 358 aa  150  3e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.269161  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1925  LacI family transcription regulator  35.65 
 
 		 358 aa  150  4e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.149363  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2732  lac repressor  31.67 
 
 		 357 aa  149  5e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.02392  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1628  LacI family transcription regulator  32.44 
 
 		 343 aa  149  6e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1506  LacI family transcription regulator  32.14 
 
 		 343 aa  149  7e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1525  LacI family transcription regulator  32.14 
 
 		 343 aa  149  7e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1129  LacI family transcription regulator  32.14 
 
 		 343 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0276  transcriptional regulator, LacI family  33.73 
 
 		 342 aa  148  1.0000000000000001e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1609  LacI family transcription regulator  32.14 
 
 		 343 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0684889  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1586  LacI family transcription regulator  32.14 
 
 		 343 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122412  normal  0.650271 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0415  LacI family transcription regulator  35.63 
 
 		 335 aa  148  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.280412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4748  LacI family transcription regulator  31.94 
 
 		 343 aa  147  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.42 
 
 		 336 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0376  lac repressor  31.98 
 
 		 360 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000396722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1922  LacI family transcription regulator  32.13 
 
 		 339 aa  146  5e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.704174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2154  LacI transcriptional regulator  34.02 
 
 		 338 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0306626  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4642  ribose operon repressor  32.46 
 
 		 323 aa  145  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.317022  unclonable  5.22733e-26 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00299  lac repressor  30.95 
 
 		 360 aa  144  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000126874  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10002  Lactose operon repressor  30.95 
 
 		 360 aa  144  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000792391  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00303  hypothetical protein  30.95 
 
 		 360 aa  144  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000170376  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0631  ribose operon repressor  32.13 
 
 		 323 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0664  ribose operon repressor  32.13 
 
 		 323 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.566043  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2858  LacI family transcription regulator  34.39 
 
 		 343 aa  144  2e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.640321  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00703  hypothetical protein  30.95 
 
 		 360 aa  144  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000122917  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.71 
 
 		 330 aa  144  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0418  lac repressor  31.4 
 
 		 360 aa  144  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000822114  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3261  transcriptional regulator, LacI family  30.95 
 
 		 363 aa  144  3e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000862656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0574  ribose operon repressor  32.13 
 
 		 323 aa  144  3e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0721  ribose operon repressor  32.13 
 
 		 323 aa  144  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.40772e-23 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0793  ribose operon repressor  32.13 
 
 		 323 aa  144  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00165994  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0578  LacI family transcription regulator  31.8 
 
 		 323 aa  144  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3280  lac repressor  30.95 
 
 		 363 aa  144  3e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000820962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0369  lac repressor  30.95 
 
 		 363 aa  143  3e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000375664  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0409  lac repressor  30.66 
 
 		 363 aa  144  3e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  3.9973e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1965  LacI family transcription regulator  32.65 
 
 		 338 aa  143  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.31848  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1855  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  32.65 
 
 		 338 aa  143  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39300  ribose operon repressor RbsR  32.05 
 
 		 337 aa  143  4e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00488223  normal  0.347554 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0559  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.31 
 
 		 323 aa  143  4e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000011059  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0197  LacI family transcription regulator  36.23 
 
 		 340 aa  143  5e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0262  LacI family transcription regulator  33.43 
 
 		 344 aa  142  6e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  32.12 
 
 		 340 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0696  ribose operon repressor  32.13 
 
 		 323 aa  142  7e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0345677  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0283  LacI family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 342 aa  142  8e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.881799  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  31.52 
 
 		 340 aa  142  9e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0575  ribose operon repressor  31.8 
 
 		 323 aa  142  9e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0732  ribose operon repressor  31.8 
 
 		 323 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  31.21 
 
 		 340 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00429  transcriptional repressor, LacI family protein  34.44 
 
 		 334 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20880  transcriptional regulator, LacI family  33.84 
 
 		 343 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2691  LacI family transcription regulator  32.73 
 
 		 335 aa  140  3e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  31.21 
 
 		 340 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01581  transcriptional regulator  29.85 
 
 		 334 aa  140  3.9999999999999997e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2022  ribose operon repressor RbsR  30.95 
 
 		 343 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.662423  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2472  ribose operon repressor RbsR  30.95 
 
 		 343 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0930  LacI family response repressor  33.13 
 
 		 328 aa  139  4.999999999999999e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.562853  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1857  ribose operon repressor RbsR  30.95 
 
 		 343 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1870  ribose operon repressor RbsR  30.95 
 
 		 343 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.585666  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3343  ribose operon repressor RbsR  31.75 
 
 		 337 aa  139  7e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.142594  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  33.23 
 
 		 337 aa  139  8.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3350  LacI family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 364 aa  138  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003941  transcriptional regulator LacI family protein  29.94 
 
 		 334 aa  138  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01060  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 340 aa  139  1e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0887305  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4918  transcriptional regulator, LacI family  36.44 
 
 		 346 aa  138  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3841  transcriptional regulator, LacI family  36.44 
 
 		 346 aa  138  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.455211 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29490  transcriptional regulator  33.53 
 
 		 340 aa  137  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>