More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0572 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0572  LacI family response repressor  100 
 
 		 338 aa  685    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.379149  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2911  transcriptional regulator, LacI family  41.08 
 
 		 342 aa  206  6e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0748  transcriptional regulator, LacI family  39.38 
 
 		 346 aa  187  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0494571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6224  HTH-type transcriptional repressor PurR  37.07 
 
 		 348 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.348111 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4680  LacI family transcription regulator  37.22 
 
 		 336 aa  180  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0406203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4705  transcriptional regulator, LacI family  35.96 
 
 		 359 aa  180  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.102612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4084  HTH-type transcriptional repressor PurR  37.93 
 
 		 346 aa  180  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.932111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2480  transcriptional regulator, LacI family  36.94 
 
 		 341 aa  172  1e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.725797  normal  0.877473 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2892  transcriptional regulator, LacI family  36.3 
 
 		 340 aa  169  6e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.207309  normal  0.956989 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0371  transcriptional regulator, LacI family  35.41 
 
 		 339 aa  168  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.802173 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1860  transcriptional regulator, LacI family  36.89 
 
 		 338 aa  168  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4997  transcriptional regulator, LacI family  36.86 
 
 		 372 aa  163  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.385337 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0870  LacI family transcription regulator  35.29 
 
 		 328 aa  162  6e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1925  LacI family transcription regulator  36.57 
 
 		 358 aa  162  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.149363  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2947  regulatory protein LacI  36.57 
 
 		 359 aa  161  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.407921  normal  0.301474 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0241  transcriptional regulator, LacI family  36.19 
 
 		 348 aa  158  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.268594  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0219  LacI family transcription regulator  33.74 
 
 		 351 aa  157  3e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2577  transcriptional regulator, LacI family  33.44 
 
 		 346 aa  150  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.215831  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11590  transcriptional regulator  32.43 
 
 		 362 aa  150  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.042152 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0100  transcriptional regulator, LacI family  34.41 
 
 		 348 aa  148  1.0000000000000001e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0658146  normal  0.053402 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4716  transcriptional regulator, LacI family  33.44 
 
 		 346 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.23 
 
 		 333 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3275  transcriptional regulator, LacI family  34.54 
 
 		 333 aa  146  5e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.183529  hitchhiker  0.00604574 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  33.23 
 
 		 333 aa  146  6e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04300  transcriptional regulator, LacI family  33.33 
 
 		 352 aa  145  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0495  transcriptional regulator, LacI family  31.87 
 
 		 335 aa  144  2e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.448967  normal  0.778992 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06900  transcriptional regulator, LacI family  33.73 
 
 		 339 aa  144  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0916  transcriptional regulator, LacI family  35.71 
 
 		 345 aa  144  2e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.684035  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3042  transcriptional regulator, LacI family  34.31 
 
 		 359 aa  141  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06590  transcriptional regulator, LacI family  31.11 
 
 		 359 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1983  HTH-type transcriptional repressor PurR (purine nucleotide synthesis repressor)  32.8 
 
 		 333 aa  139  4.999999999999999e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0379  LacI family transcription regulator  36.53 
 
 		 342 aa  139  4.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.676966  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  32.27 
 
 		 348 aa  139  7.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1506  LacI family transcription regulator  33.04 
 
 		 343 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1525  LacI family transcription regulator  33.04 
 
 		 343 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1922  LacI family transcription regulator  33.22 
 
 		 339 aa  136  5e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.704174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2672  DNA-binding transcriptional repressor PurR  33.14 
 
 		 341 aa  136  5e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.807137  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2370  ribose operon repressor  32.34 
 
 		 338 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  30.41 
 
 		 337 aa  135  7.000000000000001e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1628  LacI family transcription regulator  33.04 
 
 		 343 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.28 
 
 		 336 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1129  LacI family transcription regulator  33.33 
 
 		 343 aa  135  9e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1609  LacI family transcription regulator  33.33 
 
 		 343 aa  135  9e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0684889  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1586  LacI family transcription regulator  33.33 
 
 		 343 aa  135  9e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122412  normal  0.650271 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2572  DNA-binding transcriptional repressor PurR  33.33 
 
 		 341 aa  135  9.999999999999999e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.407544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4748  LacI family transcription regulator  33.33 
 
 		 343 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1862  DNA-binding transcriptional repressor PurR  33.33 
 
 		 341 aa  135  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.171232  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2195  DNA-binding transcriptional repressor PurR  33.33 
 
 		 341 aa  135  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.578042  hitchhiker  0.00000679153 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  34.93 
 
 		 353 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1214  transcriptional regulator, LacI family  31.8 
 
 		 333 aa  135  9.999999999999999e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000107104  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1755  DNA-binding transcriptional repressor PurR  33.33 
 
 		 341 aa  135  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00265778  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.87 
 
 		 330 aa  134  3e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0930  LacI family response repressor  29.97 
 
 		 328 aa  134  3e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.562853  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3586  transcriptional regulator, LacI family  34.71 
 
 		 333 aa  134  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.983736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1234  LacI family transcription regulator  32.69 
 
 		 343 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50127  normal  0.134178 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2388  DNA-binding transcriptional repressor PurR  32.55 
 
 		 341 aa  133  5e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.282493  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1883  LacI family transcription regulator  31.4 
 
 		 351 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0216034  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0728  transcriptional regulator, LacI family  29.84 
 
 		 337 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.3979  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2403  transcriptional regulator, LacI family  33.97 
 
 		 379 aa  131  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00011763  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1683  DNA-binding transcriptional repressor PurR  32.91 
 
 		 341 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06943  hypothetical protein  30.45 
 
 		 334 aa  131  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3227  LacI family transcription regulator  33.33 
 
 		 362 aa  131  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  30 
 
 		 342 aa  130  3e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  31.41 
 
 		 340 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0832  LacI family transcription regulator  29.62 
 
 		 346 aa  130  3e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06936  hypothetical protein  31.27 
 
 		 340 aa  129  5.0000000000000004e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0276  transcriptional regulator, LacI family  33.01 
 
 		 342 aa  129  6e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1918  LacI family transcription regulator  32.14 
 
 		 368 aa  129  7.000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.04786  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02195  transcription regulator transcription regulator protein  30.48 
 
 		 355 aa  129  9.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.479594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1873  DNA-binding transcriptional repressor PurR  32.72 
 
 		 341 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000326079  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2782  transcriptional regulator, LacI family  29.68 
 
 		 338 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0186  transcriptional regulator, LacI family  33.02 
 
 		 330 aa  128  1.0000000000000001e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.319705  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2141  LacI family transcription regulator  33.44 
 
 		 340 aa  128  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0418584  normal  0.0217452 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01629  DNA-binding transcriptional repressor, hypoxanthine-binding  32.72 
 
 		 341 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.847977  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1982  transcriptional regulator, LacI family  32.72 
 
 		 341 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0168569  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2372  DNA-binding transcriptional repressor PurR  32.72 
 
 		 341 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000002203  normal  0.181026 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1744  DNA-binding transcriptional repressor PurR  33.33 
 
 		 341 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000285436  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2154  LacI transcriptional regulator  32.9 
 
 		 338 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0306626  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1971  DNA-binding transcriptional repressor PurR  32.72 
 
 		 341 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000994316 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  29.08 
 
 		 335 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1738  DNA-binding transcriptional repressor PurR  32.72 
 
 		 341 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.20958e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1857  DNA-binding transcriptional repressor PurR  32.72 
 
 		 341 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000046163  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1538  DNA-binding transcriptional repressor PurR  32.72 
 
 		 341 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0686294  normal  0.0781462 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1540  DNA-binding transcriptional repressor PurR  33.33 
 
 		 341 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000065632  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01618  hypothetical protein  32.72 
 
 		 341 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.850711  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1563  DNA-binding transcriptional repressor PurR  33.33 
 
 		 341 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00208837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1913  DNA-binding transcriptional repressor PurR  33.33 
 
 		 341 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000592501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2691  LacI family transcription regulator  27.83 
 
 		 335 aa  127  3e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1526  DNA-binding transcriptional repressor PurR  33.33 
 
 		 341 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580264  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1715  DNA-binding transcriptional repressor PurR  32.27 
 
 		 341 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.117715  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0512  LacI family transcription regulator  32.04 
 
 		 336 aa  126  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0559  transcriptional regulator, LacI family  36.09 
 
 		 337 aa  126  5e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2686  transcriptional regulator, LacI family  32.34 
 
 		 340 aa  126  5e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2863  putative catabolite control protein A  29.43 
 
 		 332 aa  126  5e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2548  catabolite control protein A, putative  29.43 
 
 		 332 aa  126  5e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  31.51 
 
 		 332 aa  126  5e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  30.97 
 
 		 340 aa  126  5e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0415  LacI family transcription regulator  30.54 
 
 		 335 aa  126  6e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.280412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04075  galactose operon repressor  30.97 
 
 		 333 aa  126  7e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  29.47 
 
 		 332 aa  126  7e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>