More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_01060 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_01060  transcriptional regulator  100 
 
 		 340 aa  677    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0887305  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0276  transcriptional regulator, LacI family  56.29 
 
 		 342 aa  388  1e-107  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0495  transcriptional regulator, LacI family  42.3 
 
 		 335 aa  254  1.0000000000000001e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.448967  normal  0.778992 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06900  transcriptional regulator, LacI family  43.03 
 
 		 339 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0371  transcriptional regulator, LacI family  41.02 
 
 		 339 aa  251  8.000000000000001e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.802173 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3042  transcriptional regulator, LacI family  42.99 
 
 		 359 aa  241  2e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2892  transcriptional regulator, LacI family  41 
 
 		 340 aa  238  1e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.207309  normal  0.956989 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0219  LacI family transcription regulator  38.53 
 
 		 351 aa  234  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1860  transcriptional regulator, LacI family  42.23 
 
 		 338 aa  228  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6224  HTH-type transcriptional repressor PurR  41.06 
 
 		 348 aa  228  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.348111 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1918  LacI family transcription regulator  39.64 
 
 		 368 aa  227  2e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.04786  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4680  LacI family transcription regulator  39.82 
 
 		 336 aa  223  3e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0406203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0400  transcriptional regulator, LacI family  42.43 
 
 		 346 aa  222  6e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3275  transcriptional regulator, LacI family  40.67 
 
 		 333 aa  219  3.9999999999999997e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.183529  hitchhiker  0.00604574 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0379  LacI family transcription regulator  41.57 
 
 		 342 aa  217  2e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.676966  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29490  transcriptional regulator  39.64 
 
 		 340 aa  217  2.9999999999999998e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0870  LacI family transcription regulator  36.31 
 
 		 328 aa  216  5.9999999999999996e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4084  HTH-type transcriptional repressor PurR  38.58 
 
 		 346 aa  207  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.932111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4716  transcriptional regulator, LacI family  40.91 
 
 		 346 aa  205  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4705  transcriptional regulator, LacI family  39.93 
 
 		 359 aa  203  4e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.102612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11590  transcriptional regulator  38.64 
 
 		 362 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.042152 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4997  transcriptional regulator, LacI family  37.08 
 
 		 372 aa  200  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.385337 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0100  transcriptional regulator, LacI family  38.48 
 
 		 348 aa  200  3e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0658146  normal  0.053402 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0241  transcriptional regulator, LacI family  38.05 
 
 		 348 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.268594  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2947  regulatory protein LacI  39.57 
 
 		 359 aa  194  1e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.407921  normal  0.301474 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0748  transcriptional regulator, LacI family  38.62 
 
 		 346 aa  193  4e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0494571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06590  transcriptional regulator, LacI family  36.26 
 
 		 359 aa  186  5e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04300  transcriptional regulator, LacI family  37.88 
 
 		 352 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2577  transcriptional regulator, LacI family  38.6 
 
 		 346 aa  182  7e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.215831  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1363  lac repressor  35.15 
 
 		 358 aa  179  8e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.269161  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1925  LacI family transcription regulator  36.23 
 
 		 358 aa  176  5e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.149363  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1769  lac repressor  34.35 
 
 		 358 aa  176  6e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.044739  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  37.76 
 
 		 339 aa  173  3.9999999999999995e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3623  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.24 
 
 		 335 aa  172  5.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.487296  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  35.33 
 
 		 353 aa  170  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2732  lac repressor  35.58 
 
 		 357 aa  170  4e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.02392  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1021  LacI family response repressor  35.47 
 
 		 371 aa  165  9e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0916  transcriptional regulator, LacI family  37.98 
 
 		 345 aa  165  1.0000000000000001e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.684035  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0930  LacI family response repressor  35.6 
 
 		 328 aa  163  3e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.562853  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0008  transcriptional regulator, LacI family  33.53 
 
 		 337 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1262  lac repressor  35.43 
 
 		 357 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000349798  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0512  LacI family transcription regulator  33.13 
 
 		 336 aa  162  7e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0927  lac repressor  34.95 
 
 		 355 aa  161  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0196781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3665  LacI family transcription regulator  30.15 
 
 		 343 aa  160  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2751  transcriptional regulator, LacI family  37.61 
 
 		 335 aa  159  7e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.360192  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3261  transcriptional regulator, LacI family  34.33 
 
 		 363 aa  158  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000862656  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3280  lac repressor  34.33 
 
 		 363 aa  158  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000820962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0418  lac repressor  34.33 
 
 		 360 aa  158  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000822114  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00299  lac repressor  34.33 
 
 		 360 aa  158  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000126874  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10002  Lactose operon repressor  34.33 
 
 		 360 aa  158  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000792391  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0007  transcriptional regulator, LacI family  33.03 
 
 		 337 aa  157  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00303  hypothetical protein  34.33 
 
 		 360 aa  158  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000170376  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00703  hypothetical protein  34.33 
 
 		 360 aa  158  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000122917  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0409  lac repressor  34.03 
 
 		 363 aa  157  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  3.9973e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0376  lac repressor  34.55 
 
 		 360 aa  157  3e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000396722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1550  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.33 
 
 		 328 aa  157  3e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000390905  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0369  lac repressor  34.03 
 
 		 363 aa  156  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000375664  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4896  transcriptional repressor RbsR  34.34 
 
 		 333 aa  155  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000156613  hitchhiker  0.000000782419 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1600  LacI family transcription regulator  33.13 
 
 		 328 aa  155  1e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  30.75 
 
 		 332 aa  154  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0976  lac repressor  30.4 
 
 		 357 aa  152  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3358  lac repressor  30.4 
 
 		 357 aa  152  1e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1125  transcriptional regulator, LacI family  35.5 
 
 		 341 aa  150  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107829 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1071  regulatory protein, LacI  32.24 
 
 		 338 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  28.24 
 
 		 341 aa  150  2e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1823  transcriptional regulator, LacI family  33.23 
 
 		 339 aa  150  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.33943  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0922  lac repressor  30.09 
 
 		 357 aa  150  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  34.88 
 
 		 368 aa  150  4e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2320  LacI family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 340 aa  150  4e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.316441  normal  0.202359 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  31.83 
 
 		 355 aa  149  6e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.83 
 
 		 330 aa  149  7e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0282  LacI family transcriptional regulator  38.42 
 
 		 342 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.727359 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1922  LacI family transcription regulator  34.83 
 
 		 339 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.704174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6278  transcriptional regulator, LacI family  35.69 
 
 		 338 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39300  ribose operon repressor RbsR  35.01 
 
 		 337 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00488223  normal  0.347554 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0907  LacI family transcription regulator  34.74 
 
 		 341 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1135  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.94 
 
 		 338 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1283  lac repressor  30 
 
 		 357 aa  146  5e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  29.13 
 
 		 386 aa  146  5e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.15 
 
 		 336 aa  146  6e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0351  transcriptional regulator, LacI family  32.92 
 
 		 367 aa  146  6e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  31.82 
 
 		 331 aa  146  6e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3221  transcriptional regulator, LacI family  31.64 
 
 		 338 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0283  LacI family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 342 aa  145  1e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.881799  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3973  transcriptional repressor RbsR  32.74 
 
 		 338 aa  145  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000131921  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0919  LacI family transcription regulator  27.79 
 
 		 327 aa  145  1e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1128  transcriptional regulator, LacI family  30.86 
 
 		 361 aa  145  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1170  LacI family transcription regulator  31.64 
 
 		 338 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.353815 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  34.04 
 
 		 332 aa  143  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0945  LacI family transcription regulator  35.45 
 
 		 348 aa  144  3e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000657853  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3025  LacI family transcription regulator  31.27 
 
 		 338 aa  144  3e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.824077 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04075  galactose operon repressor  33.23 
 
 		 333 aa  143  3e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4233  transcriptional repressor RbsR  31.31 
 
 		 328 aa  144  3e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00129115  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06943  hypothetical protein  31.58 
 
 		 334 aa  143  3e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0416  LacI family transcription regulator  34.44 
 
 		 349 aa  143  4e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.339437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0698  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  33.99 
 
 		 330 aa  143  4e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06936  hypothetical protein  31.1 
 
 		 340 aa  143  4e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0186  transcriptional regulator, LacI family  34.33 
 
 		 330 aa  142  6e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.319705  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  28.61 
 
 		 347 aa  142  9e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3122  LacI family transcription regulator  30.97 
 
 		 338 aa  142  9e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>