More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6684 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6684  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 338 aa  661    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.594008 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4568  transcriptional regulator, LacI family  55.76 
 
 		 357 aa  305  7e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1895  LacI family transcriptional regulator  50.3 
 
 		 339 aa  296  3e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.371942 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3304  LacI family transcription regulator  49.85 
 
 		 335 aa  289  4e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.547709 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0325  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  49.7 
 
 		 335 aa  286  2.9999999999999996e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0389  LacI family transcription regulator  50.6 
 
 		 335 aa  280  3e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0127409 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1561  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  50.15 
 
 		 348 aa  275  6e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.63047 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1510  LacI family transcription regulator  50.15 
 
 		 348 aa  275  6e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014462 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0838  LacI family transcriptional regulator  50 
 
 		 331 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.620074  normal  0.213955 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1732  transcriptional regulator, LacI family  48.64 
 
 		 340 aa  269  5e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521835  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0938  LacI family transcription regulator  47.92 
 
 		 340 aa  268  1e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0104625  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1789  transcriptional regulator, LacI family  47.43 
 
 		 343 aa  265  7e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0134  LacI family transcription regulator  47.73 
 
 		 343 aa  262  6.999999999999999e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  48.19 
 
 		 473 aa  259  4e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7169  transcriptional repressor RbsR  49.1 
 
 		 331 aa  256  4e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0351473 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5463  LacI family transcription regulator  49.85 
 
 		 344 aa  253  3e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.316293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6278  transcriptional regulator, LacI family  45.05 
 
 		 338 aa  251  2e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3394  transcriptional regulator  46.06 
 
 		 361 aa  247  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.330741 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5334  transcriptional regulator, LacI family  50 
 
 		 339 aa  241  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.431046 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0809  transcriptional regulator, LacI family  45.06 
 
 		 344 aa  237  2e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.119427 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3984  LacI family transcription regulator  45.86 
 
 		 339 aa  237  2e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.125023  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0944  transcriptional regulator, LacI family  47.43 
 
 		 334 aa  233  4.0000000000000004e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.694443 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2841  transcriptional regulator, LacI family  48.64 
 
 		 345 aa  232  9e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.595775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3721  transcriptional regulator  43.79 
 
 		 350 aa  227  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.940328  normal  0.590974 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2155  transcriptional regulator, LacI family  42.35 
 
 		 338 aa  223  3e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.677334  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3965  Alanine racemase  48.35 
 
 		 338 aa  223  4e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.578436 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0861  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  47.44 
 
 		 292 aa  222  6e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.19022 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4021  transcriptional regulator, LacI family  47.62 
 
 		 350 aa  221  9.999999999999999e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.613602  normal  0.127498 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03890  transcriptional regulator, LacI family  42.12 
 
 		 337 aa  219  6e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.229438 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2402  transcriptional regulator, LacI family  44.61 
 
 		 346 aa  218  2e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00787022 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1878  transcriptional regulator, LacI family  44.59 
 
 		 351 aa  217  2e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0941149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0403  transcriptional regulator, LacI family  43.11 
 
 		 350 aa  216  5.9999999999999996e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5673  transcriptional regulator, LacI family  45.05 
 
 		 343 aa  214  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.227027  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08380  transcriptional regulator  44.19 
 
 		 351 aa  210  3e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.689367  normal  0.241125 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13170  transcriptional regulator  42.39 
 
 		 359 aa  206  4e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.362617  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3030  transcriptional regulator, LacI family  43.67 
 
 		 342 aa  206  6e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3491  transcriptional regulator, LacI family  43.79 
 
 		 349 aa  205  7e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.201292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1685  transcriptional regulator, LacI family  39.35 
 
 		 337 aa  200  3e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3075  transcriptional regulator, LacI family  44.21 
 
 		 338 aa  200  3e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.494184  normal  0.554684 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0307  transcriptional regulator, LacI family  38.18 
 
 		 337 aa  195  1e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.211089  normal  0.109292 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1193  transcriptional regulator, LacI family  41.57 
 
 		 335 aa  188  1e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0624061  normal  0.122686 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2615  transcriptional regulator, LacI family  46.05 
 
 		 337 aa  182  8.000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.53 
 
 		 336 aa  179  8e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348221  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2788  transcriptional regulator, LacI family  36.75 
 
 		 339 aa  176  7e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0297  LacI family transcription regulator  34.94 
 
 		 340 aa  175  9e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  31.83 
 
 		 333 aa  174  9.999999999999999e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  32.84 
 
 		 386 aa  171  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20430  transcriptional regulator  39.35 
 
 		 337 aa  170  3e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16200  transcriptional regulator, LacI family  35.05 
 
 		 336 aa  169  8e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00346268  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  30.15 
 
 		 341 aa  167  2.9999999999999998e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04030  transcriptional regulator  35.42 
 
 		 351 aa  165  1.0000000000000001e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2858  LacI family transcription regulator  34.73 
 
 		 343 aa  163  4.0000000000000004e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.640321  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  36.42 
 
 		 332 aa  160  4e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  37.54 
 
 		 339 aa  159  5e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1024  LacI family transcription regulator  35.76 
 
 		 342 aa  159  5e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  35.01 
 
 		 353 aa  158  1e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0376  transcriptional regulator, LacI family  33.82 
 
 		 358 aa  156  5.0000000000000005e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.13 
 
 		 339 aa  155  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0911  transcriptional regulator, LacI family  35.71 
 
 		 332 aa  155  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  34.31 
 
 		 337 aa  155  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.23 
 
 		 333 aa  155  1e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  32.23 
 
 		 333 aa  154  2e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.83 
 
 		 330 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0663  transcriptional regulator, LacI family  28.92 
 
 		 338 aa  152  7e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3834  LacI family transcription regulator  34.63 
 
 		 336 aa  152  8.999999999999999e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  32.93 
 
 		 348 aa  151  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  33.93 
 
 		 331 aa  151  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1486  transcriptional regulator, LacI family  34.82 
 
 		 334 aa  152  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.479144 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  34.62 
 
 		 333 aa  152  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4415  transcriptional regulator, LacI family  36.28 
 
 		 342 aa  150  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0459  LacI family transcription regulator  33.83 
 
 		 340 aa  150  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1333  transcriptional regulator, LacI family  33.84 
 
 		 347 aa  150  3e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00834702  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  35.93 
 
 		 353 aa  150  3e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1550  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.73 
 
 		 328 aa  150  4e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000390905  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1790  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.63 
 
 		 337 aa  150  4e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00351385  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1725  transcriptional regulator, LacI family  31.72 
 
 		 338 aa  149  5e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0499  LacI family transcription regulator  28.74 
 
 		 330 aa  149  8e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1600  LacI family transcription regulator  32.83 
 
 		 328 aa  149  9e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0275  transcriptional regulator, LacI family  36.83 
 
 		 339 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.555598 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4233  transcriptional repressor RbsR  33.43 
 
 		 328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00129115  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1769  LacI family transcription regulator  31.25 
 
 		 339 aa  148  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0285  alanine racemase  31.04 
 
 		 337 aa  148  1.0000000000000001e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4680  LacI family transcription regulator  38.33 
 
 		 336 aa  148  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0406203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  30.27 
 
 		 332 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2250  DNA-binding transcriptional regulator CytR  35.17 
 
 		 335 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  30.15 
 
 		 342 aa  147  3e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4426  DNA-binding transcriptional regulator CytR  34.72 
 
 		 341 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4340  DNA-binding transcriptional regulator CytR  34.72 
 
 		 341 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.302828  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4310  DNA-binding transcriptional regulator CytR  34.72 
 
 		 341 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4494  DNA-binding transcriptional regulator CytR  34.72 
 
 		 341 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4424  DNA-binding transcriptional regulator CytR  34.72 
 
 		 341 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3243  HTH-type transcriptional regulator AscG  33.93 
 
 		 340 aa  146  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000054765 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3843  transcriptional regulator  34.94 
 
 		 340 aa  146  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00298813  normal  0.0397253 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1506  LacI family transcription regulator  35.14 
 
 		 343 aa  145  6e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1525  LacI family transcription regulator  35.14 
 
 		 343 aa  145  6e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2403  transcriptional regulator, LacI family  34.02 
 
 		 379 aa  145  7.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00011763  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29490  transcriptional regulator  36.55 
 
 		 340 aa  145  7.0000000000000006e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  29.17 
 
 		 347 aa  145  9e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06936  hypothetical protein  32.84 
 
 		 340 aa  145  9e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3665  LacI family transcription regulator  32.94 
 
 		 343 aa  145  9e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>