More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0459 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_0459  LacI family transcription regulator  100 
 
 
340 aa  692    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0297  LacI family transcription regulator  44.44 
 
 
340 aa  301  9e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2788  transcriptional regulator, LacI family  37.54 
 
 
339 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1685  transcriptional regulator, LacI family  37.5 
 
 
337 aa  232  6e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04200  transcriptional regulator, LacI family  32.01 
 
 
341 aa  208  1e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.63 
 
 
337 aa  203  4e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0582  alanine racemase  31.63 
 
 
337 aa  203  4e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04250  transcriptional regulator, LacI family  31.33 
 
 
337 aa  200  3e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.335349  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3623  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.14 
 
 
335 aa  200  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.487296  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  30.33 
 
 
341 aa  199  5e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  35.12 
 
 
348 aa  196  5.000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.06 
 
 
336 aa  196  7e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0699  transcriptional regulator, LacI family  33.13 
 
 
341 aa  195  9e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.42 
 
 
330 aa  194  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3179  transcriptional regulator, LacI family  36.2 
 
 
355 aa  194  3e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.588941  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0006  ribose operon repressor  33.33 
 
 
334 aa  193  4e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.038565  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  32.83 
 
 
353 aa  192  1e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  31.83 
 
 
333 aa  192  1e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1515  transcriptional regulator, LacI family  32.83 
 
 
339 aa  190  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  33.33 
 
 
337 aa  190  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  31.12 
 
 
335 aa  189  4e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0512  LacI family transcription regulator  33.73 
 
 
336 aa  188  9e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2817  LacI family transcription regulator  31.82 
 
 
339 aa  187  3e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5463  LacI family transcription regulator  34.95 
 
 
344 aa  187  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.316293  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16200  transcriptional regulator, LacI family  31.83 
 
 
336 aa  187  3e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00346268  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.31 
 
 
336 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348221  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6278  transcriptional regulator, LacI family  34.74 
 
 
338 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2606  transcriptional regulator  27.81 
 
 
348 aa  184  3e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1732  transcriptional regulator, LacI family  34.44 
 
 
340 aa  183  3e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521835  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19800  transcriptional regulator, LacI family  31.42 
 
 
336 aa  184  3e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3342  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  31.71 
 
 
332 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  31.86 
 
 
368 aa  181  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0663  transcriptional regulator, LacI family  30.12 
 
 
338 aa  181  2e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2503  transcriptional regulator  31 
 
 
339 aa  181  2e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.117668  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1789  transcriptional regulator, LacI family  35.06 
 
 
343 aa  181  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  34.23 
 
 
339 aa  180  2.9999999999999997e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2870  transcriptional regulator, LacI family  32.52 
 
 
342 aa  180  2.9999999999999997e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4506  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  31.71 
 
 
332 aa  180  4e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1725  transcriptional regulator, LacI family  31.86 
 
 
338 aa  179  4e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  32.02 
 
 
332 aa  179  5.999999999999999e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4575  catabolite control protein A  31.71 
 
 
332 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4929  catabolite control protein A  31.71 
 
 
332 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4410  catabolite control protein A  31.71 
 
 
332 aa  179  7e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4795  catabolite control protein A  31.71 
 
 
332 aa  179  7e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0809  transcriptional regulator, LacI family  32.43 
 
 
344 aa  179  8e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.119427 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4427  catabolite control protein A  31.71 
 
 
332 aa  179  9e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4811  catabolite control protein A  31.4 
 
 
332 aa  178  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.52 
 
 
339 aa  178  1e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2250  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.94 
 
 
335 aa  178  1e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.31 
 
 
333 aa  178  1e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4813  catabolite control protein A  31.4 
 
 
332 aa  177  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  29.31 
 
 
333 aa  177  2e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  34.81 
 
 
473 aa  177  2e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0911  transcriptional regulator, LacI family  32.24 
 
 
332 aa  177  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  31.16 
 
 
342 aa  177  3e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1983  HTH-type transcriptional repressor PurR (purine nucleotide synthesis repressor)  30.25 
 
 
333 aa  177  3e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2000  LacI family transcription regulator  31.7 
 
 
346 aa  176  6e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.121919  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4790  catabolite control protein A  31.1 
 
 
332 aa  176  7e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  31.56 
 
 
342 aa  175  8e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1069  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  31.02 
 
 
328 aa  174  9.999999999999999e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.209088 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  31.34 
 
 
347 aa  174  9.999999999999999e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1333  transcriptional regulator, LacI family  33.81 
 
 
347 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00834702  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0588  LacI family transcription regulator  31.02 
 
 
328 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.979882  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1586  LacI family transcription regulator  32.07 
 
 
343 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122412  normal  0.650271 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4748  LacI family transcription regulator  32.07 
 
 
343 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1129  LacI family transcription regulator  32.07 
 
 
343 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1628  LacI family transcription regulator  32.07 
 
 
343 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1609  LacI family transcription regulator  32.07 
 
 
343 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0684889  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0524  alanine racemase  34.34 
 
 
339 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0527  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  31.02 
 
 
328 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0449  catabolite control protein A  30.79 
 
 
332 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4573  LacI family transcription regulator  33.64 
 
 
326 aa  174  2.9999999999999996e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0936264  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1895  LacI family transcriptional regulator  32.62 
 
 
339 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.371942 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  34.09 
 
 
347 aa  173  5e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1234  LacI family transcription regulator  31.4 
 
 
343 aa  173  5e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50127  normal  0.134178 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0197  LacI family transcription regulator  33.43 
 
 
340 aa  172  5e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2711  alanine racemase  28.57 
 
 
342 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000872573  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0838  LacI family transcriptional regulator  33.23 
 
 
331 aa  172  9e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.620074  normal  0.213955 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2808  LacI family transcription regulator  30.9 
 
 
345 aa  172  9e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0294888  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4639  transcriptional regulator, LacI family  34.34 
 
 
357 aa  171  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.496087  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0279  transcriptional regulator, LacI family  34.9 
 
 
351 aa  171  1e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0283  LacI family transcriptional regulator  33.02 
 
 
342 aa  171  1e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.881799  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0728  transcriptional regulator, LacI family  32.12 
 
 
337 aa  171  2e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.3979  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4061  maltose operon transcriptional repressor  27.93 
 
 
343 aa  171  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0938  LacI family transcription regulator  31.83 
 
 
340 aa  171  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0104625  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2472  ribose operon repressor RbsR  32.07 
 
 
343 aa  171  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1128  transcriptional regulator, LacI family  30.65 
 
 
361 aa  171  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2022  ribose operon repressor RbsR  32.07 
 
 
343 aa  170  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.662423  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1367  ribose operon repressor  32.23 
 
 
333 aa  170  3e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.390962  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1857  ribose operon repressor RbsR  32.07 
 
 
343 aa  170  3e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1870  ribose operon repressor RbsR  32.07 
 
 
343 aa  170  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.585666  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4028  maltose operon transcriptional repressor  27.63 
 
 
343 aa  169  4e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3919  maltose operon transcriptional repressor  27.63 
 
 
343 aa  169  4e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4226  maltose operon transcriptional repressor  27.63 
 
 
343 aa  169  4e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4134  maltose operon transcriptional repressor  27.63 
 
 
340 aa  169  4e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4116  maltose operon transcriptional repressor  27.93 
 
 
340 aa  169  4e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.271073  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3751  maltose operon transcriptional repressor  27.63 
 
 
343 aa  169  5e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1561  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.34 
 
 
348 aa  169  5e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.63047 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2511  LacI family transcriptional regulator  31.96 
 
 
346 aa  169  5e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.743819  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4039  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.55 
 
 
341 aa  169  6e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>