More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3075 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3075  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 338 aa  667    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.494184  normal  0.554684 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03890  transcriptional regulator, LacI family  67.87 
 
 		 337 aa  449  1e-125  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.229438 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0307  transcriptional regulator, LacI family  60.6 
 
 		 337 aa  419  1e-116  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.211089  normal  0.109292 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2155  transcriptional regulator, LacI family  58.79 
 
 		 338 aa  379  1e-104  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.677334  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1895  LacI family transcriptional regulator  49.7 
 
 		 339 aa  281  1e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.371942 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0838  LacI family transcriptional regulator  47.43 
 
 		 331 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.620074  normal  0.213955 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0938  LacI family transcription regulator  45.97 
 
 		 340 aa  272  5.000000000000001e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0104625  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04030  transcriptional regulator  46.29 
 
 		 351 aa  268  1e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7169  transcriptional repressor RbsR  48.64 
 
 		 331 aa  266  2.9999999999999995e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0351473 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0809  transcriptional regulator, LacI family  46.57 
 
 		 344 aa  266  5e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.119427 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1510  LacI family transcription regulator  48.74 
 
 		 348 aa  266  5e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014462 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3394  transcriptional regulator  47.73 
 
 		 361 aa  265  7e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.330741 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0325  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  47.76 
 
 		 335 aa  265  1e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1732  transcriptional regulator, LacI family  47.92 
 
 		 340 aa  261  1e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521835  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0389  LacI family transcription regulator  48.36 
 
 		 335 aa  260  2e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0127409 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1561  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  49.06 
 
 		 348 aa  259  3e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.63047 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3304  LacI family transcription regulator  47.29 
 
 		 335 aa  257  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.547709 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0134  LacI family transcription regulator  47.75 
 
 		 343 aa  255  9e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6278  transcriptional regulator, LacI family  47.45 
 
 		 338 aa  253  2.0000000000000002e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  44.31 
 
 		 473 aa  250  3e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3965  Alanine racemase  47.76 
 
 		 338 aa  246  3e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.578436 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3984  LacI family transcription regulator  45.61 
 
 		 339 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.125023  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4021  transcriptional regulator, LacI family  45.67 
 
 		 350 aa  239  5.999999999999999e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.613602  normal  0.127498 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5334  transcriptional regulator, LacI family  47.42 
 
 		 339 aa  238  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.431046 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5463  LacI family transcription regulator  46.65 
 
 		 344 aa  238  1e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.316293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1789  transcriptional regulator, LacI family  43.88 
 
 		 343 aa  233  4.0000000000000004e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5673  transcriptional regulator, LacI family  45.37 
 
 		 343 aa  230  3e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.227027  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2841  transcriptional regulator, LacI family  45.78 
 
 		 345 aa  228  1e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.595775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3721  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 350 aa  228  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.940328  normal  0.590974 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1685  transcriptional regulator, LacI family  40.9 
 
 		 337 aa  223  4e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2402  transcriptional regulator, LacI family  41.62 
 
 		 346 aa  219  5e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00787022 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4568  transcriptional regulator, LacI family  43.49 
 
 		 357 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3491  transcriptional regulator, LacI family  41.6 
 
 		 349 aa  211  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.201292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1878  transcriptional regulator, LacI family  42.44 
 
 		 351 aa  210  3e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0941149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13170  transcriptional regulator  42.73 
 
 		 359 aa  205  9e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.362617  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14260  transcriptional regulator  39.7 
 
 		 330 aa  204  2e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.419378  normal  0.681325 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0403  transcriptional regulator, LacI family  40.41 
 
 		 350 aa  199  5e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3030  transcriptional regulator, LacI family  41.09 
 
 		 342 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08380  transcriptional regulator  41.83 
 
 		 351 aa  197  3e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.689367  normal  0.241125 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6684  transcriptional regulator, LacI family  44.21 
 
 		 338 aa  194  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.594008 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  34.83 
 
 		 333 aa  192  5e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0376  transcriptional regulator, LacI family  38.44 
 
 		 358 aa  192  9e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06943  hypothetical protein  38.72 
 
 		 334 aa  191  1e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2615  transcriptional regulator, LacI family  41.39 
 
 		 337 aa  189  4e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0297  LacI family transcription regulator  37.61 
 
 		 340 aa  190  4e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0911  transcriptional regulator, LacI family  37.65 
 
 		 332 aa  186  4e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3834  LacI family transcription regulator  38.32 
 
 		 336 aa  186  5e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  37.13 
 
 		 353 aa  183  4.0000000000000006e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2691  LacI family transcription regulator  35.52 
 
 		 335 aa  181  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.04 
 
 		 336 aa  181  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0734  transcriptional regulator, LacI family  36.53 
 
 		 336 aa  175  9.999999999999999e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00429  transcriptional repressor, LacI family protein  35.8 
 
 		 334 aa  175  9.999999999999999e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1193  transcriptional regulator, LacI family  38.81 
 
 		 335 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0624061  normal  0.122686 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  33.14 
 
 		 342 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3620  transcriptional regulator, LacI family  36.14 
 
 		 337 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.223441  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3471  transcriptional regulator, LacI family  35.84 
 
 		 337 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.413963  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  30.23 
 
 		 341 aa  174  2.9999999999999996e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6195  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  38.76 
 
 		 337 aa  173  5e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.193526  normal  0.910118 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0861  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  42.55 
 
 		 292 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.19022 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  35.93 
 
 		 337 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2742  DNA-binding transcriptional regulator CytR  33.03 
 
 		 335 aa  170  4e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0008  transcriptional regulator, LacI family  36.04 
 
 		 337 aa  170  4e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16200  transcriptional regulator, LacI family  33.12 
 
 		 336 aa  169  6e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00346268  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0283  LacI family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 342 aa  169  6e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.881799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2250  DNA-binding transcriptional regulator CytR  33.83 
 
 		 335 aa  169  6e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  35.74 
 
 		 332 aa  169  8e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  33.84 
 
 		 329 aa  168  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  34.33 
 
 		 348 aa  167  2e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0768  LacI family transcription regulator  37.31 
 
 		 332 aa  167  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0915061  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2788  transcriptional regulator, LacI family  36.75 
 
 		 339 aa  167  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0577  LacI family transcription regulator  35.52 
 
 		 344 aa  167  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.868296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  32.24 
 
 		 332 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  35.01 
 
 		 331 aa  166  4e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0007  transcriptional regulator, LacI family  36.01 
 
 		 337 aa  166  5e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3187  LacI family transcription regulator  35.12 
 
 		 337 aa  166  5.9999999999999996e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  34.93 
 
 		 368 aa  166  5.9999999999999996e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0754  transcriptional regulator, LacI family  36.51 
 
 		 337 aa  166  6.9999999999999995e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.143705  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0506  LacI family transcription regulator  33.43 
 
 		 332 aa  165  8e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.549777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  32.34 
 
 		 386 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3330  transcriptional regulator, LacI family  35.82 
 
 		 343 aa  164  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.451729  normal  0.198785 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0449  catabolite control protein A  31.83 
 
 		 332 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1398  ribose operon repressor RbsR  36.42 
 
 		 334 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4790  catabolite control protein A  31.83 
 
 		 332 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0459  LacI family transcription regulator  32.93 
 
 		 340 aa  164  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03819  DNA-binding transcriptional dual regulator  35.03 
 
 		 341 aa  163  3e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4051  transcriptional regulator, LacI family  35.03 
 
 		 341 aa  163  3e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4410  catabolite control protein A  31.83 
 
 		 332 aa  164  3e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4427  catabolite control protein A  32.13 
 
 		 332 aa  164  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4416  DNA-binding transcriptional regulator CytR  35.03 
 
 		 343 aa  163  3e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.506908  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0241  transcriptional regulator, LacI family  37.2 
 
 		 348 aa  164  3e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.268594  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4376  DNA-binding transcriptional regulator CytR  35.03 
 
 		 341 aa  163  3e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.76111 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.53 
 
 		 336 aa  164  3e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348221  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4166  DNA-binding transcriptional regulator CytR  35.03 
 
 		 343 aa  163  3e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4470  DNA-binding transcriptional regulator CytR  35.03 
 
 		 341 aa  163  3e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03768  hypothetical protein  35.03 
 
 		 341 aa  163  3e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4084  DNA-binding transcriptional regulator CytR  35.03 
 
 		 341 aa  163  3e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4795  catabolite control protein A  31.83 
 
 		 332 aa  164  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0892  LacI family transcription regulator  36.05 
 
 		 391 aa  163  4.0000000000000004e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3665  LacI family transcription regulator  35.45 
 
 		 343 aa  163  4.0000000000000004e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4575  catabolite control protein A  31.83 
 
 		 332 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>