More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_07780 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_07780  transcriptional regulator  100 
 
 		 339 aa  648    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4321  transcriptional regulator, LacI family  47.54 
 
 		 348 aa  221  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.794794  hitchhiker  0.00774423 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2877  transcriptional regulator, LacI family  45.78 
 
 		 372 aa  216  2.9999999999999998e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0137169 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0201  transcriptional regulator, LacI family  42.6 
 
 		 342 aa  214  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0642992 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4368  transcriptional regulator, LacI family  45.35 
 
 		 347 aa  210  3e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.0119453 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1535  transcriptional regulator, LacI family  42.9 
 
 		 465 aa  207  2e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38669  decreased coverage  0.00974115 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1087  transcriptional regulator, LacI family  46.44 
 
 		 350 aa  204  1e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.978331 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1802  transcriptional regulator, LacI family  44.95 
 
 		 339 aa  204  1e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.328257 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0892  transcriptional regulator, LacI family  43.95 
 
 		 348 aa  202  7e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.774645  normal  0.081922 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0385  transcriptional regulator, LacI family  40.84 
 
 		 334 aa  202  8e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07020  transcriptional regulator, LacI family  42.6 
 
 		 345 aa  202  9e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.851743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0408  transcriptional regulator, LacI family  41.92 
 
 		 335 aa  198  1.0000000000000001e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1871  transcriptional regulator, LacI family  47.42 
 
 		 333 aa  196  7e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3167  transcriptional regulator, LacI family  45.36 
 
 		 357 aa  194  1e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0967324 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03100  transcriptional regulator, LacI family  42.47 
 
 		 345 aa  194  1e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0219145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0426  transcriptional regulator, LacI family  42.02 
 
 		 381 aa  193  3e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2486  ribose operon repressor RbsR  41.87 
 
 		 331 aa  190  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.008295 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3896  transcriptional regulator, LacI family  40.53 
 
 		 341 aa  185  1.0000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.469202 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0228  LacI family transcription regulator  38.74 
 
 		 334 aa  183  3e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0508  transcriptional regulator, LacI family  39.27 
 
 		 347 aa  180  2.9999999999999997e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.339758  normal  0.020506 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02810  transcriptional regulator  39.27 
 
 		 334 aa  179  7e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29360  transcriptional regulator  39.08 
 
 		 359 aa  178  1e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29310  transcriptional regulator  37.94 
 
 		 357 aa  177  2e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1300  RbsR family transcriptional regulator/Ribose operon repressor  36.45 
 
 		 342 aa  177  2e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1545  RbsR family transcriptional regulator/Ribose operon repressor  37.97 
 
 		 352 aa  176  3e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0174364  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1926  transcriptional regulator, LacI family  38.05 
 
 		 344 aa  176  7e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1038  Alanine racemase  40.35 
 
 		 351 aa  174  9.999999999999999e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.255953  normal  0.612025 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0056  transcriptional regulator, LacI family  38.55 
 
 		 335 aa  174  2.9999999999999996e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.650576  normal  0.249866 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0775  Alanine racemase  44.51 
 
 		 341 aa  172  5.999999999999999e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.212824  hitchhiker  0.00169568 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0014  transcriptional regulator, LacI family  42 
 
 		 344 aa  171  1e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2262  transcriptional regulator, LacI family  43.15 
 
 		 336 aa  169  7e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.638644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0925  RbsR family transcriptional regulator/Ribose operon repressor  35.63 
 
 		 337 aa  162  9e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.197996  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  31.02 
 
 		 386 aa  160  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1520  transcriptional regulator, LacI family  38.51 
 
 		 338 aa  160  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0658956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0418  alanine racemase  30.18 
 
 		 338 aa  159  9e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.923997  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  32.88 
 
 		 333 aa  155  1e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.88 
 
 		 333 aa  155  1e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1790  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.89 
 
 		 337 aa  155  1e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00351385  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2584  Alanine racemase  40.61 
 
 		 376 aa  150  4e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  34.36 
 
 		 347 aa  149  5e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1093  LacI family transcription regulator  37.5 
 
 		 351 aa  149  5e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.137161  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0362  transcriptional regulator, LacI family  35.14 
 
 		 337 aa  148  1.0000000000000001e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06943  hypothetical protein  32.8 
 
 		 334 aa  148  1.0000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2273  LacI family transcription regulator  36.15 
 
 		 333 aa  146  4.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0311079  hitchhiker  0.000018406 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1971  LacI family transcription regulator  37.12 
 
 		 352 aa  146  6e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.137395  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2049  LacI family transcription regulator  37.12 
 
 		 352 aa  145  8.000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.586342  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3140  transcriptional regulator, LacI family  36.45 
 
 		 344 aa  144  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.636128 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3529  transcriptional regulator, LacI family  34.52 
 
 		 333 aa  143  3e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.27 
 
 		 330 aa  144  3e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  29.82 
 
 		 335 aa  143  4e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1078  transcriptional regulator, LacI family  33.44 
 
 		 334 aa  143  5e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00527595 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3331  regulatory protein LacI  33.44 
 
 		 334 aa  143  5e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0343  transcriptional regulator, LacI family  31.53 
 
 		 327 aa  142  6e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  35.14 
 
 		 333 aa  142  7e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00229  putative GalR repressor of contiguous operon, likely to bind a galactoside  33.45 
 
 		 351 aa  142  7e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4539  transcriptional regulator, LacI family  35.31 
 
 		 350 aa  141  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.166389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.4 
 
 		 337 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  32.55 
 
 		 368 aa  142  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0832  LacI family transcription regulator  28.57 
 
 		 346 aa  140  1.9999999999999998e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4333  transcriptional regulator, LacI family  35.12 
 
 		 340 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.706731 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4596  transcriptional regulator, LacI family  33.55 
 
 		 340 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0502076 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  34.38 
 
 		 346 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0007  transcriptional regulator, LacI family  33.12 
 
 		 337 aa  139  4.999999999999999e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  34.94 
 
 		 346 aa  139  6e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0686  LacI family transcription regulator  32.9 
 
 		 334 aa  139  7.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20880  transcriptional regulator, LacI family  28.48 
 
 		 343 aa  138  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1398  ribose operon repressor RbsR  35.47 
 
 		 334 aa  138  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0565  LacI family transcription regulator  34.62 
 
 		 339 aa  138  1e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.344337 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2196  LacI family transcription regulator  31.34 
 
 		 340 aa  137  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0908748  hitchhiker  0.000488625 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  34.64 
 
 		 347 aa  137  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1214  transcriptional regulator, LacI family  35.14 
 
 		 333 aa  137  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000107104  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2994  DNA-binding transcriptional regulator GalS  32.68 
 
 		 332 aa  137  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2867  transcriptional regulator, LacI family  35.1 
 
 		 336 aa  138  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0458283 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5102  transcriptional regulator, LacI family  38.18 
 
 		 326 aa  137  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.61 
 
 		 339 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2691  LacI family transcription regulator  30.46 
 
 		 335 aa  136  5e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1608  HTH-type transcriptional regulator GalR  31.8 
 
 		 340 aa  136  5e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.656083  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  33.13 
 
 		 332 aa  136  5e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  29.51 
 
 		 355 aa  136  6.0000000000000005e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002667  Galactose operon repressor  31.08 
 
 		 332 aa  136  6.0000000000000005e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0754  transcriptional regulator, LacI family  33.53 
 
 		 337 aa  135  7.000000000000001e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.143705  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0282  LacI family transcriptional regulator  36.01 
 
 		 342 aa  135  7.000000000000001e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.727359 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0870  alanine racemase  36.12 
 
 		 351 aa  135  7.000000000000001e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0415  LacI family transcription regulator  33.33 
 
 		 335 aa  135  8e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.280412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3091  LacI family transcription regulator  32.13 
 
 		 328 aa  135  8e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.224445  normal  0.366148 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  32.44 
 
 		 340 aa  135  9e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0755  LacI family transcription regulator  32.94 
 
 		 357 aa  135  9e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0008  transcriptional regulator, LacI family  31.83 
 
 		 337 aa  135  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2863  putative catabolite control protein A  28.92 
 
 		 332 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1637  LacI family transcription regulator  34.73 
 
 		 337 aa  135  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.455476 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0413  transcriptional regulator, LacI family  38.1 
 
 		 358 aa  135  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2652  LacI family transcription regulator  31.46 
 
 		 335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.126307  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  32.41 
 
 		 340 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1922  LacI family transcription regulator  34.34 
 
 		 339 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.704174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2548  catabolite control protein A, putative  28.92 
 
 		 332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  36.43 
 
 		 349 aa  134  3e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3383  LacI family transcription regulator  33.24 
 
 		 344 aa  134  3e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0237122 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1715  DNA-binding transcriptional repressor PurR  32.04 
 
 		 341 aa  134  3e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.117715  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2711  alanine racemase  29.63 
 
 		 342 aa  134  3e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000872573  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0120  LacI family transcription regulator  32.7 
 
 		 351 aa  134  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>