More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5102 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5102  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 326 aa  634    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0581  Alanine racemase  53.58 
 
 		 343 aa  295  9e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0953116  normal  0.13709 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07090  transcriptional regulator  47.98 
 
 		 344 aa  260  2e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.72012 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1502  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  46.08 
 
 		 323 aa  253  3e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.725302 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3013  transcriptional regulator, LacI family  47.65 
 
 		 326 aa  250  3e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.168933  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0593  transcriptional regulator, LacI family  45.34 
 
 		 328 aa  246  3e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5012  transcriptional regulator, LacI family  46.08 
 
 		 324 aa  244  9.999999999999999e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05320  transcriptional regulator  46.49 
 
 		 371 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0777  transcriptional regulator, LacI family  42.02 
 
 		 339 aa  238  1e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000623929 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07200  transcriptional regulator  44.75 
 
 		 341 aa  230  2e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0947559  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0495  LacI family transcription regulator  39.75 
 
 		 354 aa  227  2e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3313  transcriptional regulator, LacI family  46.93 
 
 		 358 aa  221  9.999999999999999e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0187548 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0372  transcriptional regulator, LacI family  44.17 
 
 		 325 aa  218  7.999999999999999e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2753  transcriptional regulator, LacI family  43.95 
 
 		 344 aa  218  8.999999999999998e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2751  transcriptional regulator, LacI family  43.17 
 
 		 335 aa  216  4e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.360192  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2982  transcriptional regulator, LacI family  42.9 
 
 		 348 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.463067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.55 
 
 		 336 aa  202  5e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1391  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  39.33 
 
 		 335 aa  199  3.9999999999999996e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0786  transcriptional regulator, LacI family  36.88 
 
 		 356 aa  199  6e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4670  transcriptional regulator, LacI family  41.74 
 
 		 328 aa  199  7e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.659427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3340  LacI family transcription regulator  39.82 
 
 		 340 aa  198  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3356  transcriptional regulator, LacI family  43.52 
 
 		 341 aa  197  2.0000000000000003e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.647155 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3140  transcriptional regulator, LacI family  39.69 
 
 		 344 aa  196  7e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.636128 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3256  LacI family transcription regulator  38.11 
 
 		 369 aa  195  7e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.893798  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1921  transcriptional regulator, LacI family  41.38 
 
 		 330 aa  194  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.295106 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4539  transcriptional regulator, LacI family  38.53 
 
 		 350 aa  187  3e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.166389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2534  transcriptional regulator, LacI family  41.18 
 
 		 663 aa  186  4e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  32.93 
 
 		 335 aa  182  6e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  39.76 
 
 		 349 aa  182  9.000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2385  transcriptional regulator, LacI family  39.51 
 
 		 346 aa  182  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.171577  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2404  transcriptional regulator, LacI family  36.56 
 
 		 349 aa  180  2.9999999999999997e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000976758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2273  LacI family transcription regulator  37.31 
 
 		 333 aa  179  4.999999999999999e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0311079  hitchhiker  0.000018406 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  34.3 
 
 		 355 aa  177  1e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1790  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.25 
 
 		 337 aa  178  1e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00351385  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2686  transcriptional regulator, LacI family  39.61 
 
 		 340 aa  177  2e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0794  transcriptional regulator, LacI family  40.49 
 
 		 332 aa  176  5e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0126496 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0892  LacI family transcription regulator  39.29 
 
 		 391 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4613  LacI family transcription regulator  38.67 
 
 		 335 aa  174  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  37.61 
 
 		 337 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0416  LacI family transcription regulator  36.72 
 
 		 349 aa  171  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.339437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2863  putative catabolite control protein A  33.44 
 
 		 332 aa  170  4e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  37.46 
 
 		 332 aa  169  6e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2548  catabolite control protein A, putative  33.12 
 
 		 332 aa  169  7e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0919  LacI family transcription regulator  28.57 
 
 		 327 aa  167  2e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0831  LacI family transcription regulator  36.5 
 
 		 326 aa  165  8e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569804  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0698  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  33.93 
 
 		 330 aa  165  9e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0131  transcriptional regulator, LacI family  41.19 
 
 		 343 aa  165  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2733  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  32.13 
 
 		 331 aa  163  3e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0975  transcriptional regulator, LacI family  39.23 
 
 		 338 aa  163  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1398  ribose operon repressor RbsR  36.56 
 
 		 334 aa  164  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4116  alanine racemase  37.98 
 
 		 334 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  33.64 
 
 		 329 aa  162  6e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4479  LacI family transcription regulator  36.97 
 
 		 342 aa  162  8.000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.277487  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01040  transcriptional regulator  36.2 
 
 		 336 aa  162  9e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1637  LacI family transcription regulator  35.09 
 
 		 337 aa  162  9e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.455476 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2994  DNA-binding transcriptional regulator GalS  36.5 
 
 		 332 aa  161  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.34 
 
 		 330 aa  162  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  36.76 
 
 		 339 aa  161  1e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2751  DNA-binding transcriptional regulator GalS  35.8 
 
 		 340 aa  161  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4039  DNA-binding transcriptional regulator CytR  34.74 
 
 		 341 aa  162  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.37 
 
 		 339 aa  160  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1050  transcriptional regulator, LacI family  36.75 
 
 		 335 aa  160  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.107431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3272  LacI family transcription regulator  31.66 
 
 		 352 aa  160  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29250  transcriptional regulator  39.14 
 
 		 651 aa  160  2e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0438  alanine racemase  33.13 
 
 		 338 aa  160  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000864233  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00429  transcriptional repressor, LacI family protein  34.22 
 
 		 334 aa  160  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0262  LacI family transcription regulator  35.22 
 
 		 344 aa  159  4e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20880  transcriptional regulator, LacI family  32.22 
 
 		 343 aa  159  6e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0768  LacI family transcription regulator  35.24 
 
 		 332 aa  159  6e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0915061  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0945  LacI family transcription regulator  37.54 
 
 		 348 aa  159  9e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000657853  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4008  transcriptional regulator, LacI family  34.83 
 
 		 340 aa  159  9e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000985107  hitchhiker  0.00000124933 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2170  LacI family transcription regulator  31.66 
 
 		 366 aa  158  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.626121  normal  0.28501 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0283  LacI family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 342 aa  158  1e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.881799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0415  LacI family transcription regulator  34.85 
 
 		 335 aa  158  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.280412  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02080  DNA-binding transcriptional repressor  35.49 
 
 		 346 aa  157  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.451006  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1507  transcriptional regulator, LacI family  35.19 
 
 		 346 aa  157  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3285  DNA-binding transcriptional regulator GalS  35.19 
 
 		 346 aa  157  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.912253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1497  DNA-binding transcriptional regulator GalS  35.19 
 
 		 346 aa  157  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31060  transcriptional regulator  35.6 
 
 		 334 aa  157  2e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.613185  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2298  DNA-binding transcriptional regulator GalS  35.19 
 
 		 346 aa  157  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00335365 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  36.47 
 
 		 353 aa  157  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  29.82 
 
 		 341 aa  157  2e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2285  DNA-binding transcriptional regulator GalS  35.19 
 
 		 346 aa  157  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02039  hypothetical protein  35.49 
 
 		 346 aa  157  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.361585  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0309  LacI family transcription regulator  33.44 
 
 		 342 aa  157  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.543523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4069  LacI family transcription regulator  33.94 
 
 		 367 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2691  LacI family transcription regulator  33.93 
 
 		 335 aa  157  3e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3452  LacI family transcription regulator  33.84 
 
 		 369 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.164472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2742  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.62 
 
 		 335 aa  157  3e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0418  alanine racemase  31.93 
 
 		 338 aa  157  3e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.923997  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0402  transcriptional regulator, LacI family  30.42 
 
 		 339 aa  156  4e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000159796  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2337  DNA-binding transcriptional regulator GalS  35.19 
 
 		 340 aa  156  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0134  transcriptional regulator, LacI family  36.56 
 
 		 360 aa  156  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2430  DNA-binding transcriptional regulator GalS  35.19 
 
 		 340 aa  156  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.688486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3283  transcriptional regulator, LacI family  37.38 
 
 		 354 aa  156  5.0000000000000005e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2382  DNA-binding transcriptional regulator GalS  35.19 
 
 		 340 aa  155  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.824252 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2311  transcriptional regulator, LacI family  31.5 
 
 		 335 aa  156  6e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000106518  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5165  LacI family transcription regulator  34.37 
 
 		 330 aa  156  6e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2250  DNA-binding transcriptional regulator CytR  33.84 
 
 		 335 aa  156  6e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  32.42 
 
 		 347 aa  155  7e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>