More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0786 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_0786  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 356 aa  723    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0495  LacI family transcription regulator  42.86 
 
 		 354 aa  260  3e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2404  transcriptional regulator, LacI family  42.15 
 
 		 349 aa  246  3e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000976758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05320  transcriptional regulator  44.88 
 
 		 371 aa  244  9.999999999999999e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0777  transcriptional regulator, LacI family  43.62 
 
 		 339 aa  241  1e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000623929 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3256  LacI family transcription regulator  41.56 
 
 		 369 aa  230  3e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.893798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1502  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  42.11 
 
 		 323 aa  229  4e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.725302 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3013  transcriptional regulator, LacI family  41.12 
 
 		 326 aa  219  6e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.168933  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2982  transcriptional regulator, LacI family  39.94 
 
 		 348 aa  219  7e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.463067  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3313  transcriptional regulator, LacI family  41.69 
 
 		 358 aa  215  9.999999999999999e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0187548 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2753  transcriptional regulator, LacI family  41.18 
 
 		 344 aa  210  4e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0593  transcriptional regulator, LacI family  37.89 
 
 		 328 aa  207  2e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5012  transcriptional regulator, LacI family  41.25 
 
 		 324 aa  207  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0581  Alanine racemase  39.69 
 
 		 343 aa  207  2e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0953116  normal  0.13709 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1391  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  41.59 
 
 		 335 aa  207  3e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07090  transcriptional regulator  39.22 
 
 		 344 aa  206  4e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.72012 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07200  transcriptional regulator  39.53 
 
 		 341 aa  206  4e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0947559  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2751  transcriptional regulator, LacI family  37.07 
 
 		 335 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.360192  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3140  transcriptional regulator, LacI family  35.95 
 
 		 344 aa  198  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.636128 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3356  transcriptional regulator, LacI family  40.42 
 
 		 341 aa  196  6e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.647155 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5102  transcriptional regulator, LacI family  36.88 
 
 		 326 aa  195  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0892  LacI family transcription regulator  36.97 
 
 		 391 aa  186  6e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31060  transcriptional regulator  36.96 
 
 		 334 aa  185  1.0000000000000001e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.613185  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0794  transcriptional regulator, LacI family  36.96 
 
 		 332 aa  184  1.0000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0126496 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3340  LacI family transcription regulator  38.01 
 
 		 340 aa  182  7e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.23 
 
 		 339 aa  177  3e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0372  transcriptional regulator, LacI family  40.98 
 
 		 325 aa  174  2.9999999999999996e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1921  transcriptional regulator, LacI family  37.91 
 
 		 330 aa  172  5.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.295106 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2534  transcriptional regulator, LacI family  38.64 
 
 		 663 aa  172  9e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0283  LacI family transcriptional regulator  33.43 
 
 		 342 aa  168  1e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.881799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0262  LacI family transcription regulator  32.44 
 
 		 344 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4790  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.82 
 
 		 342 aa  164  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120208 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1744  transcriptional regulator, LacI family  33.43 
 
 		 336 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  32.95 
 
 		 349 aa  164  3e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4670  transcriptional regulator, LacI family  34.74 
 
 		 328 aa  162  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.659427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001746  transcriptional (co)regulator CytR  32.23 
 
 		 335 aa  161  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29250  transcriptional regulator  35.37 
 
 		 651 aa  160  3e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0131  transcriptional regulator, LacI family  34.74 
 
 		 343 aa  160  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00726  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.32 
 
 		 335 aa  160  4e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  32.02 
 
 		 329 aa  160  4e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0416  LacI family transcription regulator  34.58 
 
 		 349 aa  159  5e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.339437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.47 
 
 		 336 aa  159  8e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4479  LacI family transcription regulator  33.63 
 
 		 342 aa  159  9e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.277487  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1790  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.98 
 
 		 337 aa  158  1e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00351385  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2601  transcriptional regulator, LacI family  33.43 
 
 		 388 aa  158  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0945  LacI family transcription regulator  34.55 
 
 		 348 aa  157  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000657853  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1050  transcriptional regulator, LacI family  35.54 
 
 		 335 aa  157  3e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.107431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5553  transcriptional regulator LacI family  33.14 
 
 		 356 aa  157  4e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539573  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  31.63 
 
 		 337 aa  157  4e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4315  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.13 
 
 		 352 aa  156  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0957821 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1400  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.5 
 
 		 332 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.665266  normal  0.0917942 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2250  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.07 
 
 		 335 aa  156  6e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09530  transcriptional regulator, LacI family  30.54 
 
 		 340 aa  155  7e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00123183  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5165  LacI family transcription regulator  31.9 
 
 		 330 aa  155  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  32.81 
 
 		 355 aa  155  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0477  transcriptional regulator, LacI family  32.85 
 
 		 352 aa  154  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  31.29 
 
 		 341 aa  154  2e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1637  LacI family transcription regulator  32.73 
 
 		 337 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.455476 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  33.84 
 
 		 339 aa  153  4e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1725  transcriptional regulator, LacI family  31.91 
 
 		 338 aa  153  5e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2717  LacI family transcription regulator  31.6 
 
 		 330 aa  151  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1631  LacI family transcription regulator  31.27 
 
 		 381 aa  152  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.213128  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16200  transcriptional regulator, LacI family  32.94 
 
 		 336 aa  151  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00346268  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3401  LacI family transcription regulator  31.6 
 
 		 367 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7472  transcriptional regulator LacI family  33.43 
 
 		 339 aa  150  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0728  transcriptional regulator, LacI family  30.9 
 
 		 337 aa  150  2e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.3979  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4069  LacI family transcription regulator  31.6 
 
 		 367 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0299  transcriptional regulator protein  34.58 
 
 		 365 aa  151  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3452  LacI family transcription regulator  31.6 
 
 		 369 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.164472  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  33.92 
 
 		 353 aa  151  2e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1943  transcriptional regulator, LacI family  37.24 
 
 		 347 aa  151  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.102269 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3410  transcriptional regulator, LacI family  32.63 
 
 		 343 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.21 
 
 		 336 aa  150  3e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348221  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4285  transcriptional regulator, LacI family  37.89 
 
 		 338 aa  150  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.171981  normal  0.523747 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06943  hypothetical protein  31.83 
 
 		 334 aa  150  4e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3272  LacI family transcription regulator  33.13 
 
 		 352 aa  150  4e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5883  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.6 
 
 		 356 aa  149  6e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.92391 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3708  transcriptional regulator, LacI family  32.63 
 
 		 343 aa  149  9e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.36497  normal  0.667413 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0006  ribose operon repressor  30.32 
 
 		 334 aa  149  9e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.038565  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03819  DNA-binding transcriptional dual regulator  30.18 
 
 		 341 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4051  transcriptional regulator, LacI family  30.18 
 
 		 341 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4376  DNA-binding transcriptional regulator CytR  30.18 
 
 		 341 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.76111 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5674  LacI family transcription regulator  32.73 
 
 		 347 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0466  transcriptional regulator, LacI family  32.54 
 
 		 347 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.450137  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2385  transcriptional regulator, LacI family  32.12 
 
 		 346 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.171577  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4416  DNA-binding transcriptional regulator CytR  30.18 
 
 		 343 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.506908  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5235  LacI family transcription regulator  30.98 
 
 		 330 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03768  hypothetical protein  30.18 
 
 		 341 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4166  DNA-binding transcriptional regulator CytR  30.18 
 
 		 343 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2742  DNA-binding transcriptional regulator CytR  30.79 
 
 		 335 aa  148  1.0000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4084  DNA-binding transcriptional regulator CytR  30.18 
 
 		 341 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4470  DNA-binding transcriptional regulator CytR  30.18 
 
 		 341 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  30.38 
 
 		 342 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4008  transcriptional regulator, LacI family  31.21 
 
 		 340 aa  147  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000985107  hitchhiker  0.00000124933 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2281  transcriptional regulator, LacI family  30.86 
 
 		 334 aa  146  4.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2681  LacI family transcription regulator  30.72 
 
 		 335 aa  146  6e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1732  HTH-type transcriptional regulator GalR  30.51 
 
 		 335 aa  146  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1610  HTH-type transcriptional regulator GalR  30.51 
 
 		 335 aa  145  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.578137  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0345  transcriptional regulator for D-ribose, periplasmic binding protein, LacI family protein  32.13 
 
 		 334 aa  145  7.0000000000000006e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2867  transcriptional regulator, LacI family  34.23 
 
 		 336 aa  146  7.0000000000000006e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0458283 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>