More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0245 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0245  LacI family transcription regulator  100 
 
 		 339 aa  691    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.05929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2141  LacI family transcription regulator  48.2 
 
 		 340 aa  299  5e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0418584  normal  0.0217452 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0276  LacI family transcription regulator  40.9 
 
 		 347 aa  237  2e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02195  transcription regulator transcription regulator protein  38.32 
 
 		 355 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.479594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1442  LacI family transcription regulator  41.78 
 
 		 341 aa  214  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0197  LacI family transcription regulator  40.36 
 
 		 340 aa  214  1.9999999999999998e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0755  LacI family transcription regulator  38.58 
 
 		 357 aa  213  2.9999999999999995e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4918  transcriptional regulator, LacI family  37.43 
 
 		 346 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3841  transcriptional regulator, LacI family  37.43 
 
 		 346 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.455211 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1207  alanine racemase  37.91 
 
 		 339 aa  211  2e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3516  LacI family transcription regulator  37.25 
 
 		 338 aa  208  9e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2371  LacI family transcription regulator  38.11 
 
 		 337 aa  208  1e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0453022  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1096  LacI family transcription regulator  38.56 
 
 		 338 aa  207  2e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2943  LacI family transcription regulator  37.58 
 
 		 338 aa  207  2e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.318917 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3122  LacI family transcription regulator  37.58 
 
 		 338 aa  206  3e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3025  LacI family transcription regulator  37.58 
 
 		 338 aa  206  4e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.824077 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0937  LacI family transcription regulator  38.24 
 
 		 337 aa  206  5e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.266523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1662  LacI family transcription regulator  38.83 
 
 		 337 aa  205  7e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1073  regulatory protein, LacI  36.6 
 
 		 338 aa  203  3e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1135  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.93 
 
 		 338 aa  203  4e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1170  LacI family transcription regulator  36.93 
 
 		 338 aa  202  5e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.353815 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3221  transcriptional regulator, LacI family  36.93 
 
 		 338 aa  202  5e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1304  LacI family transcription regulator  37.34 
 
 		 340 aa  202  6e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.812523 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1728  LacI family transcription regulator  37.5 
 
 		 348 aa  201  9.999999999999999e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.531296  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3995  LacI family transcription regulator  41.25 
 
 		 352 aa  201  9.999999999999999e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.917064 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0274  alanine racemase  38.02 
 
 		 340 aa  202  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1071  regulatory protein, LacI  36.6 
 
 		 338 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1111  LacI family transcription regulator  36.36 
 
 		 339 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0121938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2709  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.28 
 
 		 347 aa  199  5e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00648208  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2445  LacI family transcription regulator  38.51 
 
 		 337 aa  195  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.609487  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2718  LacI family transcription regulator  38.42 
 
 		 347 aa  193  3e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0935795  normal  0.0852564 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2376  LacI family transcription regulator  32.74 
 
 		 339 aa  191  2e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0719999  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3042  LacI family transcription regulator  35.58 
 
 		 342 aa  189  5.999999999999999e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000688276 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1019  LacI family transcription regulator  35.37 
 
 		 340 aa  189  8e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1755  LacI family transcription regulator  36.79 
 
 		 360 aa  187  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.998653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4415  transcriptional regulator, LacI family  41.69 
 
 		 342 aa  186  5e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2403  transcriptional regulator, LacI family  38.14 
 
 		 379 aa  185  9e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00011763  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3423  transcriptional regulator, LacI family  36.6 
 
 		 366 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0558625 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  36.93 
 
 		 348 aa  184  3e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2720  transcriptional regulator, LacI family  39.16 
 
 		 337 aa  183  4.0000000000000006e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.687845  normal  0.476409 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0186  transcriptional regulator, LacI family  38.64 
 
 		 330 aa  182  9.000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.319705  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0262  LacI family transcription regulator  37.09 
 
 		 344 aa  181  1e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03674  transcriptional regulator LacI family  35.74 
 
 		 342 aa  180  2.9999999999999997e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3513  LacI family transcription regulator  36.67 
 
 		 338 aa  179  4e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.98216  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04322  transcriptional regulator LacI family  36.39 
 
 		 355 aa  179  8e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2074  LacI family transcription regulator  37.89 
 
 		 337 aa  178  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.243502  normal  0.538933 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6389  transcriptional regulator, LacI family  37.98 
 
 		 342 aa  178  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1125  transcriptional regulator, LacI family  39.87 
 
 		 341 aa  177  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107829 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2281  transcriptional regulator, LacI family  36.98 
 
 		 334 aa  177  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0229  LacI family transcription regulator  35.39 
 
 		 358 aa  176  6e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.720422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  38.66 
 
 		 353 aa  175  9e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11530  transcriptional regulator, LacI family  37.46 
 
 		 331 aa  175  9.999999999999999e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00809623 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4116  alanine racemase  36.9 
 
 		 334 aa  175  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0717  LacI family transcription regulator  35.5 
 
 		 358 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3623  LacI family transcription regulator  36.52 
 
 		 350 aa  174  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.039372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0031  transcriptional regulator, LacI family  35.42 
 
 		 351 aa  173  2.9999999999999996e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.532737  hitchhiker  0.0000002992 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3555  LacI family transcription regulator  37.62 
 
 		 352 aa  172  9e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3586  transcriptional regulator, LacI family  37.24 
 
 		 333 aa  171  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.983736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0806  LacI family transcription regulator  35.18 
 
 		 358 aa  171  2e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03849  sal operon transcriptional repressor  35.84 
 
 		 336 aa  171  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2858  LacI family transcription regulator  35.86 
 
 		 343 aa  170  3e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.640321  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4315  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.06 
 
 		 352 aa  169  7e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0957821 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2062  LacI family transcription regulator  35.67 
 
 		 348 aa  168  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0513684  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  35.86 
 
 		 353 aa  167  2e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.54 
 
 		 330 aa  166  8e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4417  transcriptional regulator, LacI family  34.83 
 
 		 351 aa  164  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.728292  normal  0.68385 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0512  LacI family transcription regulator  36.01 
 
 		 336 aa  163  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4293  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.61 
 
 		 342 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.719683 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  34.63 
 
 		 332 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4592  LacI family transcription regulator  36.42 
 
 		 327 aa  162  6e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0768  LacI family transcription regulator  34.75 
 
 		 332 aa  162  7e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0915061  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5190  transcriptional repressor RbsR  35.14 
 
 		 330 aa  162  9e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00327915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4122  transcriptional repressor RbsR  35.14 
 
 		 330 aa  162  9e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.305602  normal  0.0911869 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4613  LacI family transcription regulator  36.29 
 
 		 335 aa  161  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4270  transcriptional repressor RbsR  35.14 
 
 		 330 aa  162  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000205239  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2250  DNA-binding transcriptional regulator CytR  34.07 
 
 		 335 aa  161  1e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4241  transcriptional repressor RbsR  35.14 
 
 		 330 aa  161  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.327464  hitchhiker  0.00680444 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0296  degradation activator  32.74 
 
 		 331 aa  161  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4165  transcriptional repressor RbsR  34.82 
 
 		 330 aa  161  2e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0172446  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  35.92 
 
 		 340 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04300  transcriptional regulator, LacI family  37.91 
 
 		 352 aa  159  6e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  34.53 
 
 		 368 aa  159  6e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0698  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  33.33 
 
 		 330 aa  158  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0916  transcriptional regulator, LacI family  35.29 
 
 		 345 aa  158  1e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.684035  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03639  DNA-binding transcriptional repressor of ribose metabolism  34.82 
 
 		 330 aa  157  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00237415  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2370  ribose operon repressor  35.47 
 
 		 338 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2401  LacI family transcription regulator  39.29 
 
 		 318 aa  157  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03584  hypothetical protein  34.82 
 
 		 330 aa  157  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00148852  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4169  transcriptional repressor RbsR  34.08 
 
 		 332 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.451515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1609  LacI family transcription regulator  33.24 
 
 		 356 aa  157  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  36.91 
 
 		 346 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3688  LacI family transcription regulator  36.47 
 
 		 332 aa  157  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4113  transcriptional repressor RbsR  34.08 
 
 		 332 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.493547  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4278  transcriptional repressor RbsR  34.08 
 
 		 332 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.134192  normal  0.933942 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  35.33 
 
 		 340 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1398  ribose operon repressor RbsR  34.42 
 
 		 334 aa  156  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1032  DNA-binding transcriptional repressor PurR  30.41 
 
 		 333 aa  156  5.0000000000000005e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.872659  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4098  transcriptional repressor RbsR  33.76 
 
 		 332 aa  156  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.396512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  32.79 
 
 		 332 aa  156  5.0000000000000005e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3033  LacI family transcription regulator  32.15 
 
 		 351 aa  156  6e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>