More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1442 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1442  LacI family transcription regulator  100 
 
 		 341 aa  696    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0276  LacI family transcription regulator  52.24 
 
 		 347 aa  335  5.999999999999999e-91  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2371  LacI family transcription regulator  42.56 
 
 		 337 aa  296  4e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0453022  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0197  LacI family transcription regulator  44.18 
 
 		 340 aa  289  4e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3555  LacI family transcription regulator  50.29 
 
 		 352 aa  288  1e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02195  transcription regulator transcription regulator protein  48.25 
 
 		 355 aa  281  9e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.479594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0274  alanine racemase  42.56 
 
 		 340 aa  280  4e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3841  transcriptional regulator, LacI family  47.2 
 
 		 346 aa  277  1e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.455211 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4918  transcriptional regulator, LacI family  47.2 
 
 		 346 aa  277  1e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2376  LacI family transcription regulator  41.62 
 
 		 339 aa  275  8e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0719999  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0755  LacI family transcription regulator  44.11 
 
 		 357 aa  271  2e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3995  LacI family transcription regulator  44.25 
 
 		 352 aa  269  5e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.917064 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1728  LacI family transcription regulator  44.31 
 
 		 348 aa  267  2e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.531296  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1662  LacI family transcription regulator  45.1 
 
 		 337 aa  267  2.9999999999999995e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2445  LacI family transcription regulator  45.4 
 
 		 337 aa  266  5e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.609487  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1207  alanine racemase  39.52 
 
 		 339 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1073  regulatory protein, LacI  40.29 
 
 		 338 aa  264  1e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0937  LacI family transcription regulator  39.82 
 
 		 337 aa  260  2e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.266523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1304  LacI family transcription regulator  40.77 
 
 		 340 aa  259  4e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.812523 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3025  LacI family transcription regulator  40 
 
 		 338 aa  259  4e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.824077 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1111  LacI family transcription regulator  38.51 
 
 		 339 aa  259  4e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0121938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3221  transcriptional regulator, LacI family  39.7 
 
 		 338 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2943  LacI family transcription regulator  39.76 
 
 		 338 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.318917 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1135  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  39.7 
 
 		 338 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3122  LacI family transcription regulator  39.76 
 
 		 338 aa  259  6e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1170  LacI family transcription regulator  39.7 
 
 		 338 aa  258  8e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.353815 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3516  LacI family transcription regulator  39.22 
 
 		 338 aa  257  2e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1096  LacI family transcription regulator  38.21 
 
 		 338 aa  256  5e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1071  regulatory protein, LacI  39.1 
 
 		 338 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04322  transcriptional regulator LacI family  42.48 
 
 		 355 aa  254  2.0000000000000002e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1019  LacI family transcription regulator  39 
 
 		 340 aa  251  2e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3623  LacI family transcription regulator  42.32 
 
 		 350 aa  249  3e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.039372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1755  LacI family transcription regulator  40.53 
 
 		 360 aa  250  3e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.998653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3423  transcriptional regulator, LacI family  42.27 
 
 		 366 aa  250  3e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0558625 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2709  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  37.85 
 
 		 347 aa  246  4e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00648208  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3042  LacI family transcription regulator  39.37 
 
 		 342 aa  239  5.999999999999999e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000688276 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3513  LacI family transcription regulator  41.74 
 
 		 338 aa  227  2e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.98216  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0717  LacI family transcription regulator  39.83 
 
 		 358 aa  225  8e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0806  LacI family transcription regulator  39.53 
 
 		 358 aa  221  1.9999999999999999e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0245  LacI family transcription regulator  40.36 
 
 		 339 aa  220  3e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.05929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03849  sal operon transcriptional repressor  43 
 
 		 336 aa  218  1e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0229  LacI family transcription regulator  38.74 
 
 		 358 aa  218  1e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.720422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2401  LacI family transcription regulator  45 
 
 		 318 aa  216  2.9999999999999998e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2141  LacI family transcription regulator  41 
 
 		 340 aa  216  5e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0418584  normal  0.0217452 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1609  LacI family transcription regulator  39.19 
 
 		 356 aa  211  1e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2074  LacI family transcription regulator  40.94 
 
 		 337 aa  206  5e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.243502  normal  0.538933 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0920  LacI family transcription regulator  38.42 
 
 		 351 aa  205  1e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.830745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2718  LacI family transcription regulator  37.87 
 
 		 347 aa  204  2e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0935795  normal  0.0852564 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3623  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  37.39 
 
 		 335 aa  204  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.487296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0031  transcriptional regulator, LacI family  38.03 
 
 		 351 aa  203  4e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.532737  hitchhiker  0.0000002992 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0512  LacI family transcription regulator  38.53 
 
 		 336 aa  202  6e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3033  LacI family transcription regulator  37.24 
 
 		 351 aa  202  7e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03674  transcriptional regulator LacI family  35.93 
 
 		 342 aa  199  7.999999999999999e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2062  LacI family transcription regulator  38.11 
 
 		 348 aa  192  7e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0513684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  33.93 
 
 		 335 aa  189  5.999999999999999e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  37.61 
 
 		 353 aa  185  8e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04250  transcriptional regulator, LacI family  33.73 
 
 		 337 aa  181  1e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.335349  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  34.93 
 
 		 332 aa  179  7e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2788  transcriptional regulator, LacI family  35.4 
 
 		 339 aa  179  8e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2403  transcriptional regulator, LacI family  37.09 
 
 		 379 aa  176  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00011763  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  31.07 
 
 		 341 aa  176  7e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.74 
 
 		 330 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1125  transcriptional regulator, LacI family  37.65 
 
 		 341 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107829 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0296  degradation activator  33.04 
 
 		 331 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4506  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  34.44 
 
 		 332 aa  172  5e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0449  catabolite control protein A  35.2 
 
 		 332 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04200  transcriptional regulator, LacI family  33.23 
 
 		 341 aa  172  5.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.45 
 
 		 336 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348221  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39300  ribose operon repressor RbsR  36.87 
 
 		 337 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00488223  normal  0.347554 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  35.44 
 
 		 340 aa  172  9e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4790  catabolite control protein A  35.2 
 
 		 332 aa  172  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.23 
 
 		 339 aa  171  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  36.8 
 
 		 368 aa  171  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  35.14 
 
 		 340 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4811  catabolite control protein A  35.2 
 
 		 332 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  35.14 
 
 		 340 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4813  catabolite control protein A  35.53 
 
 		 332 aa  170  3e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  35.44 
 
 		 340 aa  170  4e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4410  catabolite control protein A  34.87 
 
 		 332 aa  169  7e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4427  catabolite control protein A  34.87 
 
 		 332 aa  169  7e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.85 
 
 		 336 aa  169  7e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4795  catabolite control protein A  34.87 
 
 		 332 aa  169  7e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4575  catabolite control protein A  34.87 
 
 		 332 aa  169  8e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4929  catabolite control protein A  34.87 
 
 		 332 aa  169  8e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3342  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  34.87 
 
 		 332 aa  169  8e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0559  transcriptional regulator, LacI family  37.22 
 
 		 337 aa  169  9e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0304  degradation activator  32.63 
 
 		 332 aa  168  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0006  ribose operon repressor  33.23 
 
 		 334 aa  167  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.038565  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0186  transcriptional regulator, LacI family  37.17 
 
 		 330 aa  167  2e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.319705  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1685  transcriptional regulator, LacI family  34.71 
 
 		 337 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4415  transcriptional regulator, LacI family  36.09 
 
 		 342 aa  167  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  35.29 
 
 		 339 aa  167  2.9999999999999998e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  34.84 
 
 		 386 aa  167  4e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3586  transcriptional regulator, LacI family  35.91 
 
 		 333 aa  164  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.983736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11530  transcriptional regulator, LacI family  36.74 
 
 		 331 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00809623 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0415  LacI family transcription regulator  37.06 
 
 		 335 aa  164  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.280412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3343  ribose operon repressor RbsR  35.99 
 
 		 337 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.142594  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4333  transcriptional regulator, LacI family  36.57 
 
 		 340 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.706731 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0698  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  35.31 
 
 		 330 aa  164  3e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6831  LacI family transcription regulator  35.78 
 
 		 337 aa  163  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.243711 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>