More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2401 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2401  LacI family transcription regulator  100 
 
 		 318 aa  626  1e-178  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2074  LacI family transcription regulator  60.82 
 
 		 337 aa  353  2.9999999999999997e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.243502  normal  0.538933 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0755  LacI family transcription regulator  45.96 
 
 		 357 aa  253  4.0000000000000004e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03849  sal operon transcriptional repressor  45.94 
 
 		 336 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3995  LacI family transcription regulator  46.13 
 
 		 352 aa  239  5.999999999999999e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.917064 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0276  LacI family transcription regulator  42.81 
 
 		 347 aa  226  4e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1442  LacI family transcription regulator  44.55 
 
 		 341 aa  218  1e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2445  LacI family transcription regulator  40.5 
 
 		 337 aa  198  1.0000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.609487  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1662  LacI family transcription regulator  40.55 
 
 		 337 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02195  transcription regulator transcription regulator protein  36.65 
 
 		 355 aa  186  4e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.479594  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3841  transcriptional regulator, LacI family  36.7 
 
 		 346 aa  186  6e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.455211 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4918  transcriptional regulator, LacI family  36.7 
 
 		 346 aa  186  6e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2376  LacI family transcription regulator  34.58 
 
 		 339 aa  185  8e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0719999  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2371  LacI family transcription regulator  33.86 
 
 		 337 aa  185  1.0000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0453022  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0274  alanine racemase  36.22 
 
 		 340 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0197  LacI family transcription regulator  37.58 
 
 		 340 aa  183  4.0000000000000006e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1096  LacI family transcription regulator  36.73 
 
 		 338 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2141  LacI family transcription regulator  38.82 
 
 		 340 aa  180  2.9999999999999997e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0418584  normal  0.0217452 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1207  alanine racemase  34.69 
 
 		 339 aa  179  8e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1019  LacI family transcription regulator  33.55 
 
 		 340 aa  178  9e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3042  LacI family transcription regulator  35.71 
 
 		 342 aa  176  4e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000688276 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1073  regulatory protein, LacI  35.09 
 
 		 338 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0937  LacI family transcription regulator  35.55 
 
 		 337 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.266523  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3516  LacI family transcription regulator  34.46 
 
 		 338 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3423  transcriptional regulator, LacI family  37.29 
 
 		 366 aa  172  5e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0558625 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2943  LacI family transcription regulator  34.8 
 
 		 338 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.318917 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3122  LacI family transcription regulator  34.8 
 
 		 338 aa  171  1e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3025  LacI family transcription regulator  34.8 
 
 		 338 aa  171  2e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.824077 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1071  regulatory protein, LacI  35.25 
 
 		 338 aa  170  3e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1135  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.92 
 
 		 338 aa  169  4e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3221  transcriptional regulator, LacI family  34.92 
 
 		 338 aa  169  7e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1304  LacI family transcription regulator  33.75 
 
 		 340 aa  169  7e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.812523 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4790  catabolite control protein A  33.44 
 
 		 332 aa  169  8e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4813  catabolite control protein A  33.75 
 
 		 332 aa  168  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4811  catabolite control protein A  33.44 
 
 		 332 aa  168  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1170  LacI family transcription regulator  34.92 
 
 		 338 aa  168  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.353815 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3033  LacI family transcription regulator  34.28 
 
 		 351 aa  167  2e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0449  catabolite control protein A  33.13 
 
 		 332 aa  167  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4506  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  33.75 
 
 		 332 aa  167  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4410  catabolite control protein A  33.13 
 
 		 332 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2709  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.44 
 
 		 347 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00648208  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4795  catabolite control protein A  33.13 
 
 		 332 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0245  LacI family transcription regulator  37.58 
 
 		 339 aa  167  2.9999999999999998e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.05929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1111  LacI family transcription regulator  34.71 
 
 		 339 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0121938  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4575  catabolite control protein A  33.13 
 
 		 332 aa  166  5e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4929  catabolite control protein A  33.13 
 
 		 332 aa  166  5e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4427  catabolite control protein A  33.13 
 
 		 332 aa  165  9e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04322  transcriptional regulator LacI family  37.12 
 
 		 355 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3623  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  37.07 
 
 		 335 aa  164  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.487296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3342  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  33.44 
 
 		 332 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0283  LacI family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 342 aa  162  1e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.881799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  32.62 
 
 		 342 aa  160  3e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  37.54 
 
 		 340 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3513  LacI family transcription regulator  36.11 
 
 		 338 aa  159  5e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.98216  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  33.54 
 
 		 332 aa  159  6e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0512  LacI family transcription regulator  36.56 
 
 		 336 aa  159  9e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  34.71 
 
 		 342 aa  157  2e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  34.58 
 
 		 368 aa  157  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1755  LacI family transcription regulator  35.86 
 
 		 360 aa  156  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.998653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1728  LacI family transcription regulator  36.84 
 
 		 348 aa  156  5.0000000000000005e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.531296  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.47 
 
 		 330 aa  154  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2311  transcriptional regulator, LacI family  31.23 
 
 		 335 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000106518  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2718  LacI family transcription regulator  35.29 
 
 		 347 aa  153  5e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0935795  normal  0.0852564 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2733  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  31.56 
 
 		 331 aa  152  7e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0698  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  33.23 
 
 		 330 aa  152  8e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  34.59 
 
 		 340 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  34.28 
 
 		 340 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3623  LacI family transcription regulator  35.31 
 
 		 350 aa  151  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.039372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  32.7 
 
 		 386 aa  151  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  34.59 
 
 		 340 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3555  LacI family transcription regulator  37.46 
 
 		 352 aa  149  8e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2062  LacI family transcription regulator  33.83 
 
 		 348 aa  147  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0513684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1628  LacI family transcription regulator  34.17 
 
 		 343 aa  147  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1525  LacI family transcription regulator  34.17 
 
 		 343 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1506  LacI family transcription regulator  34.17 
 
 		 343 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  37.1 
 
 		 347 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0945  LacI family transcription regulator  37.85 
 
 		 348 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000657853  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03674  transcriptional regulator LacI family  35.96 
 
 		 342 aa  146  4.0000000000000006e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15580  transcriptional regulator, LacI family  30.58 
 
 		 336 aa  146  5e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.72 
 
 		 339 aa  145  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4748  LacI family transcription regulator  33.86 
 
 		 343 aa  145  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1983  HTH-type transcriptional repressor PurR (purine nucleotide synthesis repressor)  29.32 
 
 		 333 aa  145  1e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1129  LacI family transcription regulator  33.86 
 
 		 343 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0146  LacI family transcription regulator  32.31 
 
 		 335 aa  145  1e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1609  LacI family transcription regulator  33.86 
 
 		 343 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0684889  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20880  transcriptional regulator, LacI family  33.54 
 
 		 343 aa  144  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1586  LacI family transcription regulator  33.86 
 
 		 343 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122412  normal  0.650271 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  37.1 
 
 		 346 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4310  DNA-binding transcriptional regulator CytR  33.75 
 
 		 341 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4426  DNA-binding transcriptional regulator CytR  33.75 
 
 		 341 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4424  DNA-binding transcriptional regulator CytR  33.75 
 
 		 341 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0717  LacI family transcription regulator  33.11 
 
 		 358 aa  144  2e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4494  DNA-binding transcriptional regulator CytR  33.75 
 
 		 341 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4340  DNA-binding transcriptional regulator CytR  33.75 
 
 		 341 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.302828  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  34.01 
 
 		 348 aa  143  4e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  37.1 
 
 		 346 aa  143  4e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0806  LacI family transcription regulator  33.11 
 
 		 358 aa  143  5e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  34.58 
 
 		 353 aa  142  6e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5391  DNA-binding transcriptional regulator CytR  33.33 
 
 		 330 aa  142  7e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.504328  normal  0.696689 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2000  LacI family transcription regulator  33.85 
 
 		 346 aa  142  7e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.121919  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>