More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2062 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2062  LacI family transcription regulator  100 
 
 		 348 aa  691    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0513684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1304  LacI family transcription regulator  37.87 
 
 		 340 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.812523 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1111  LacI family transcription regulator  38.99 
 
 		 339 aa  209  5e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0121938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1207  alanine racemase  37.58 
 
 		 339 aa  207  3e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0197  LacI family transcription regulator  38.55 
 
 		 340 aa  205  9e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3042  LacI family transcription regulator  37.86 
 
 		 342 aa  204  2e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000688276 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3122  LacI family transcription regulator  37.7 
 
 		 338 aa  204  2e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3025  LacI family transcription regulator  37.7 
 
 		 338 aa  203  4e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.824077 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0937  LacI family transcription regulator  37.06 
 
 		 337 aa  202  6e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.266523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2943  LacI family transcription regulator  37.38 
 
 		 338 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.318917 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1096  LacI family transcription regulator  36.91 
 
 		 338 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3221  transcriptional regulator, LacI family  37.7 
 
 		 338 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1019  LacI family transcription regulator  35.71 
 
 		 340 aa  200  1.9999999999999998e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1135  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  37.7 
 
 		 338 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1071  regulatory protein, LacI  37.7 
 
 		 338 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1170  LacI family transcription regulator  37.7 
 
 		 338 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.353815 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0755  LacI family transcription regulator  34.88 
 
 		 357 aa  198  9e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3516  LacI family transcription regulator  36.71 
 
 		 338 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1073  regulatory protein, LacI  37.03 
 
 		 338 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1442  LacI family transcription regulator  37.83 
 
 		 341 aa  196  4.0000000000000005e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2445  LacI family transcription regulator  36.96 
 
 		 337 aa  194  2e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.609487  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0274  alanine racemase  37.32 
 
 		 340 aa  192  6e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2709  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.14 
 
 		 347 aa  191  1e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00648208  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3841  transcriptional regulator, LacI family  38.98 
 
 		 346 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.455211 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1662  LacI family transcription regulator  37.96 
 
 		 337 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4918  transcriptional regulator, LacI family  38.98 
 
 		 346 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3995  LacI family transcription regulator  35.71 
 
 		 352 aa  185  8e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.917064 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2371  LacI family transcription regulator  33.85 
 
 		 337 aa  185  9e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0453022  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0276  LacI family transcription regulator  34.8 
 
 		 347 aa  185  9e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02195  transcription regulator transcription regulator protein  38.05 
 
 		 355 aa  183  3e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.479594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0229  LacI family transcription regulator  33.91 
 
 		 358 aa  179  5.999999999999999e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.720422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0245  LacI family transcription regulator  35.67 
 
 		 339 aa  176  7e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.05929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1728  LacI family transcription regulator  35.2 
 
 		 348 aa  172  5.999999999999999e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.531296  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2718  LacI family transcription regulator  35.17 
 
 		 347 aa  171  1e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0935795  normal  0.0852564 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1755  LacI family transcription regulator  33.33 
 
 		 360 aa  169  5e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.998653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03849  sal operon transcriptional repressor  35.5 
 
 		 336 aa  165  1.0000000000000001e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3033  LacI family transcription regulator  37.39 
 
 		 351 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2074  LacI family transcription regulator  33.23 
 
 		 337 aa  163  4.0000000000000004e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.243502  normal  0.538933 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3513  LacI family transcription regulator  33.87 
 
 		 338 aa  163  5.0000000000000005e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.98216  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0031  transcriptional regulator, LacI family  36.48 
 
 		 351 aa  162  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.532737  hitchhiker  0.0000002992 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3423  transcriptional regulator, LacI family  32.6 
 
 		 366 aa  161  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0558625 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2376  LacI family transcription regulator  33.12 
 
 		 339 aa  160  3e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0719999  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  31.81 
 
 		 332 aa  160  5e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3555  LacI family transcription regulator  35.61 
 
 		 352 aa  160  5e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0920  LacI family transcription regulator  34.38 
 
 		 351 aa  159  6e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.830745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3623  LacI family transcription regulator  33.63 
 
 		 350 aa  155  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.039372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04322  transcriptional regulator LacI family  32.01 
 
 		 355 aa  155  1e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1609  LacI family transcription regulator  34.48 
 
 		 356 aa  154  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2401  LacI family transcription regulator  33.83 
 
 		 318 aa  154  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2141  LacI family transcription regulator  34.39 
 
 		 340 aa  153  5e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0418584  normal  0.0217452 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0008  transcriptional regulator, LacI family  31.76 
 
 		 337 aa  151  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2788  transcriptional regulator, LacI family  33.43 
 
 		 339 aa  150  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1790  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.86 
 
 		 337 aa  151  2e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00351385  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  34.69 
 
 		 353 aa  150  3e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03674  transcriptional regulator LacI family  31.23 
 
 		 342 aa  149  7e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  30.34 
 
 		 341 aa  148  2.0000000000000003e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3623  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.66 
 
 		 335 aa  148  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.487296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0007  transcriptional regulator, LacI family  30.82 
 
 		 337 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  35.83 
 
 		 347 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  32.75 
 
 		 348 aa  145  9e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0559  transcriptional regulator, LacI family  35.73 
 
 		 337 aa  145  1e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  34.38 
 
 		 346 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.52 
 
 		 337 aa  144  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  34.06 
 
 		 346 aa  142  6e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0113  transcriptional regulator, LacI family  36.18 
 
 		 350 aa  142  7e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2808  LacI family transcription regulator  30.31 
 
 		 345 aa  142  7e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0294888  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0819  transcriptional regulator, LacI family  34.46 
 
 		 348 aa  142  8e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4705  transcriptional regulator, LacI family  33.12 
 
 		 359 aa  142  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.102612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0409  lac repressor  32.48 
 
 		 363 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  3.9973e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  31.89 
 
 		 368 aa  142  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0717  LacI family transcription regulator  31.79 
 
 		 358 aa  142  9.999999999999999e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0371  transcriptional regulator, LacI family  31.82 
 
 		 339 aa  141  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.802173 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00299  lac repressor  32.38 
 
 		 360 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000126874  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10002  Lactose operon repressor  32.38 
 
 		 360 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000792391  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3261  transcriptional regulator, LacI family  32.19 
 
 		 363 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000862656  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2732  lac repressor  33.33 
 
 		 357 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.02392  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0418  lac repressor  32.38 
 
 		 360 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000822114  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3973  transcriptional repressor RbsR  32.08 
 
 		 338 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000131921  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2858  LacI family transcription regulator  35.94 
 
 		 343 aa  141  1.9999999999999998e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.640321  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00303  hypothetical protein  32.38 
 
 		 360 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000170376  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0283  LacI family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 342 aa  141  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.881799  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1125  transcriptional regulator, LacI family  35.13 
 
 		 341 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107829 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00703  hypothetical protein  32.38 
 
 		 360 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000122917  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3280  lac repressor  32.19 
 
 		 363 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000820962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0369  lac repressor  32.19 
 
 		 363 aa  140  3e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000375664  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0512  LacI family transcription regulator  31.07 
 
 		 336 aa  140  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1363  lac repressor  31.69 
 
 		 358 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.269161  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0961  transcriptional regulator, LacI family  34.74 
 
 		 359 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2245  LacI family transcription regulator  34.69 
 
 		 338 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.115687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2472  ribose operon repressor RbsR  35.67 
 
 		 343 aa  139  6e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0376  lac repressor  33.03 
 
 		 360 aa  139  6e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000396722  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  33.12 
 
 		 353 aa  139  6e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2022  ribose operon repressor RbsR  35.28 
 
 		 343 aa  139  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.662423  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1396  LacI family transcription regulator  30.21 
 
 		 332 aa  139  7e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.188133  hitchhiker  0.000600717 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1857  ribose operon repressor RbsR  35.28 
 
 		 343 aa  139  7e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1870  ribose operon repressor RbsR  35.28 
 
 		 343 aa  139  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.585666  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0806  LacI family transcription regulator  31.79 
 
 		 358 aa  139  7.999999999999999e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3676  LacI family transcription regulator  34.86 
 
 		 323 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.259551 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0282  LacI family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 342 aa  139  8.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.727359 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04075  galactose operon repressor  34.47 
 
 		 333 aa  138  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>