More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3995 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3995  LacI family transcription regulator  100 
 
 		 352 aa  711    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.917064 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0755  LacI family transcription regulator  48.12 
 
 		 357 aa  320  1.9999999999999998e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0276  LacI family transcription regulator  46.44 
 
 		 347 aa  276  5e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03849  sal operon transcriptional repressor  49.24 
 
 		 336 aa  276  5e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2074  LacI family transcription regulator  45.94 
 
 		 337 aa  271  1e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.243502  normal  0.538933 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1442  LacI family transcription regulator  44.25 
 
 		 341 aa  262  6e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2371  LacI family transcription regulator  37.5 
 
 		 337 aa  237  2e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0453022  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2401  LacI family transcription regulator  46.13 
 
 		 318 aa  236  3e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2445  LacI family transcription regulator  38.76 
 
 		 337 aa  236  4e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.609487  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1662  LacI family transcription regulator  37.57 
 
 		 337 aa  230  2e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4918  transcriptional regulator, LacI family  39 
 
 		 346 aa  227  2e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3841  transcriptional regulator, LacI family  39 
 
 		 346 aa  227  2e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.455211 
 
 
-
 
NC_003296  RS02195  transcription regulator transcription regulator protein  38.26 
 
 		 355 aa  225  1e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.479594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0274  alanine racemase  39.59 
 
 		 340 aa  224  2e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0197  LacI family transcription regulator  39.77 
 
 		 340 aa  223  4.9999999999999996e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1207  alanine racemase  37.57 
 
 		 339 aa  218  8.999999999999998e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3221  transcriptional regulator, LacI family  39.22 
 
 		 338 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1170  LacI family transcription regulator  39.22 
 
 		 338 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.353815 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2141  LacI family transcription regulator  40.35 
 
 		 340 aa  218  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0418584  normal  0.0217452 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1071  regulatory protein, LacI  38.92 
 
 		 338 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1135  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  39.22 
 
 		 338 aa  218  2e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1755  LacI family transcription regulator  38.24 
 
 		 360 aa  216  4e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.998653  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3516  LacI family transcription regulator  39.05 
 
 		 338 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2943  LacI family transcription regulator  39.37 
 
 		 338 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.318917 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1073  regulatory protein, LacI  38.39 
 
 		 338 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3122  LacI family transcription regulator  39.37 
 
 		 338 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3025  LacI family transcription regulator  39.37 
 
 		 338 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.824077 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0937  LacI family transcription regulator  37.13 
 
 		 337 aa  211  2e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.266523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1728  LacI family transcription regulator  38.83 
 
 		 348 aa  210  3e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.531296  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0245  LacI family transcription regulator  41.25 
 
 		 339 aa  210  3e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.05929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1096  LacI family transcription regulator  37.01 
 
 		 338 aa  208  1e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3042  LacI family transcription regulator  37.35 
 
 		 342 aa  208  1e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000688276 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2709  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.22 
 
 		 347 aa  208  1e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00648208  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2376  LacI family transcription regulator  35.74 
 
 		 339 aa  207  2e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0719999  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1111  LacI family transcription regulator  35.63 
 
 		 339 aa  204  1e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0121938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04322  transcriptional regulator LacI family  37.83 
 
 		 355 aa  204  2e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1019  LacI family transcription regulator  35.59 
 
 		 340 aa  203  3e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1304  LacI family transcription regulator  35.99 
 
 		 340 aa  203  4e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.812523 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3423  transcriptional regulator, LacI family  37.46 
 
 		 366 aa  195  1e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0558625 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3513  LacI family transcription regulator  37.31 
 
 		 338 aa  192  6e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.98216  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.21 
 
 		 339 aa  189  7e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3623  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  38.1 
 
 		 335 aa  187  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.487296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3033  LacI family transcription regulator  35.91 
 
 		 351 aa  185  8e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.24 
 
 		 330 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03674  transcriptional regulator LacI family  35.69 
 
 		 342 aa  185  1.0000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  36.8 
 
 		 340 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0512  LacI family transcription regulator  37.21 
 
 		 336 aa  183  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  36.5 
 
 		 340 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3555  LacI family transcription regulator  37.68 
 
 		 352 aa  182  6e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  36.2 
 
 		 340 aa  182  7e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0717  LacI family transcription regulator  35.48 
 
 		 358 aa  182  8.000000000000001e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  35.91 
 
 		 340 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  36.47 
 
 		 347 aa  181  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  35.12 
 
 		 353 aa  181  2e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2062  LacI family transcription regulator  37.9 
 
 		 348 aa  180  2.9999999999999997e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0513684  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  36.28 
 
 		 346 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0806  LacI family transcription regulator  35.19 
 
 		 358 aa  179  4.999999999999999e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  36.28 
 
 		 346 aa  177  3e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2154  LacI transcriptional regulator  38.32 
 
 		 338 aa  176  4e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0306626  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1922  LacI family transcription regulator  36.61 
 
 		 339 aa  176  5e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.704174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  33.43 
 
 		 348 aa  176  7e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0296  degradation activator  35.63 
 
 		 331 aa  175  9e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0031  transcriptional regulator, LacI family  33.44 
 
 		 351 aa  175  9.999999999999999e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.532737  hitchhiker  0.0000002992 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1628  LacI family transcription regulator  36.14 
 
 		 343 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1683  DNA-binding transcriptional repressor PurR  35.4 
 
 		 341 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2022  ribose operon repressor RbsR  36.53 
 
 		 343 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.662423  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0920  LacI family transcription regulator  34.72 
 
 		 351 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.830745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0229  LacI family transcription regulator  33.73 
 
 		 358 aa  174  1.9999999999999998e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.720422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1857  ribose operon repressor RbsR  36.53 
 
 		 343 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1870  ribose operon repressor RbsR  36.53 
 
 		 343 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.585666  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2370  ribose operon repressor  37.72 
 
 		 338 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  34.33 
 
 		 332 aa  173  2.9999999999999996e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1609  LacI family transcription regulator  35.07 
 
 		 356 aa  173  3.9999999999999995e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1129  LacI family transcription regulator  35.63 
 
 		 343 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1609  LacI family transcription regulator  35.63 
 
 		 343 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0684889  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1586  LacI family transcription regulator  35.63 
 
 		 343 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122412  normal  0.650271 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4748  LacI family transcription regulator  35.63 
 
 		 343 aa  173  5e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2718  LacI family transcription regulator  36.96 
 
 		 347 aa  172  5.999999999999999e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0935795  normal  0.0852564 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1525  LacI family transcription regulator  35.84 
 
 		 343 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1506  LacI family transcription regulator  35.84 
 
 		 343 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4415  transcriptional regulator, LacI family  38.51 
 
 		 342 aa  172  6.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2472  ribose operon repressor RbsR  36.23 
 
 		 343 aa  172  9e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  33.24 
 
 		 342 aa  171  2e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4506  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  33.23 
 
 		 332 aa  171  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  33.04 
 
 		 335 aa  170  3e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  35.33 
 
 		 337 aa  170  4e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1983  HTH-type transcriptional repressor PurR (purine nucleotide synthesis repressor)  33.43 
 
 		 333 aa  169  5e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  36.47 
 
 		 353 aa  169  7e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0282  LacI family transcriptional regulator  36.66 
 
 		 342 aa  169  8e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.727359 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  36.66 
 
 		 339 aa  169  9e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0768  LacI family transcription regulator  35.71 
 
 		 332 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0915061  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1234  LacI family transcription regulator  35.93 
 
 		 343 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50127  normal  0.134178 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  32.65 
 
 		 341 aa  167  2.9999999999999998e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2870  transcriptional regulator, LacI family  34.1 
 
 		 342 aa  166  5e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2388  DNA-binding transcriptional repressor PurR  35.94 
 
 		 341 aa  166  5e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.282493  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4813  catabolite control protein A  32.63 
 
 		 332 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1873  DNA-binding transcriptional repressor PurR  35.55 
 
 		 341 aa  166  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000326079  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4811  catabolite control protein A  32.34 
 
 		 332 aa  166  8e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1971  DNA-binding transcriptional repressor PurR  35.55 
 
 		 341 aa  165  9e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000994316 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01618  hypothetical protein  35.55 
 
 		 341 aa  165  9e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.850711  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>