More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1755 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1755  LacI family transcription regulator  100 
 
 		 360 aa  728    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.998653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0229  LacI family transcription regulator  67.76 
 
 		 358 aa  457  1e-127  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.720422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03674  transcriptional regulator LacI family  54.87 
 
 		 342 aa  383  1e-105  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3513  LacI family transcription regulator  54.57 
 
 		 338 aa  363  3e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.98216  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0031  transcriptional regulator, LacI family  51.37 
 
 		 351 aa  326  3e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.532737  hitchhiker  0.0000002992 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3033  LacI family transcription regulator  48.69 
 
 		 351 aa  315  9.999999999999999e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3025  LacI family transcription regulator  43.03 
 
 		 338 aa  285  8e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.824077 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3221  transcriptional regulator, LacI family  42.73 
 
 		 338 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2943  LacI family transcription regulator  42.73 
 
 		 338 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.318917 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1135  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  42.73 
 
 		 338 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3122  LacI family transcription regulator  42.73 
 
 		 338 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1170  LacI family transcription regulator  42.43 
 
 		 338 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.353815 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1071  regulatory protein, LacI  42.86 
 
 		 338 aa  281  1e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0937  LacI family transcription regulator  41.19 
 
 		 337 aa  280  4e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.266523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1073  regulatory protein, LacI  41.89 
 
 		 338 aa  279  5e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3516  LacI family transcription regulator  42.73 
 
 		 338 aa  279  7e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1096  LacI family transcription regulator  41.19 
 
 		 338 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1207  alanine racemase  40.3 
 
 		 339 aa  271  1e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2709  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  39.94 
 
 		 347 aa  271  2e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00648208  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1111  LacI family transcription regulator  40.77 
 
 		 339 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0121938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1304  LacI family transcription regulator  40.59 
 
 		 340 aa  261  2e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.812523 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3423  transcriptional regulator, LacI family  42.35 
 
 		 366 aa  255  1.0000000000000001e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0558625 
 
 
-
 
NC_003296  RS02195  transcription regulator transcription regulator protein  36.96 
 
 		 355 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.479594  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2371  LacI family transcription regulator  37.24 
 
 		 337 aa  253  3e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0453022  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1019  LacI family transcription regulator  37.09 
 
 		 340 aa  249  6e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0276  LacI family transcription regulator  40.95 
 
 		 347 aa  248  9e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4918  transcriptional regulator, LacI family  36.42 
 
 		 346 aa  248  1e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3841  transcriptional regulator, LacI family  36.42 
 
 		 346 aa  248  1e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.455211 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04322  transcriptional regulator LacI family  40.7 
 
 		 355 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0197  LacI family transcription regulator  41.47 
 
 		 340 aa  242  6e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1442  LacI family transcription regulator  40.53 
 
 		 341 aa  239  5.999999999999999e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0274  alanine racemase  39.53 
 
 		 340 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1662  LacI family transcription regulator  38.62 
 
 		 337 aa  232  7.000000000000001e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3042  LacI family transcription regulator  38.95 
 
 		 342 aa  232  8.000000000000001e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000688276 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2445  LacI family transcription regulator  39.22 
 
 		 337 aa  231  1e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.609487  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1728  LacI family transcription regulator  39.65 
 
 		 348 aa  229  4e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.531296  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0717  LacI family transcription regulator  40.06 
 
 		 358 aa  226  4e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0806  LacI family transcription regulator  39.77 
 
 		 358 aa  223  4.9999999999999996e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2376  LacI family transcription regulator  34.64 
 
 		 339 aa  214  1.9999999999999998e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0719999  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0755  LacI family transcription regulator  37.08 
 
 		 357 aa  214  1.9999999999999998e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3995  LacI family transcription regulator  37.25 
 
 		 352 aa  209  8e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.917064 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  34.99 
 
 		 368 aa  191  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2718  LacI family transcription regulator  36.57 
 
 		 347 aa  190  2.9999999999999997e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0935795  normal  0.0852564 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0245  LacI family transcription regulator  36.79 
 
 		 339 aa  187  2e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.05929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2141  LacI family transcription regulator  36.9 
 
 		 340 aa  183  3e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0418584  normal  0.0217452 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3555  LacI family transcription regulator  37.25 
 
 		 352 aa  181  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03849  sal operon transcriptional repressor  35.5 
 
 		 336 aa  181  2e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0006  ribose operon repressor  34.22 
 
 		 334 aa  179  9e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.038565  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0512  LacI family transcription regulator  36.63 
 
 		 336 aa  177  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  35.65 
 
 		 348 aa  176  5e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2074  LacI family transcription regulator  36.17 
 
 		 337 aa  175  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.243502  normal  0.538933 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2046  LacI family transcription regulator  36.39 
 
 		 344 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4233  transcriptional repressor RbsR  31.93 
 
 		 328 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00129115  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3973  transcriptional repressor RbsR  32.36 
 
 		 338 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000131921  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  34.78 
 
 		 353 aa  173  5e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  34.11 
 
 		 340 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  30.84 
 
 		 331 aa  171  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4896  transcriptional repressor RbsR  31.53 
 
 		 333 aa  170  4e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000156613  hitchhiker  0.000000782419 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2250  DNA-binding transcriptional regulator CytR  36.55 
 
 		 335 aa  170  4e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39300  ribose operon repressor RbsR  34.9 
 
 		 337 aa  169  9e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00488223  normal  0.347554 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0193  transcriptional regulator, LacI family  34.02 
 
 		 340 aa  168  1e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1685  transcriptional regulator, LacI family  33.63 
 
 		 337 aa  168  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03639  DNA-binding transcriptional repressor of ribose metabolism  34.92 
 
 		 330 aa  167  2e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00237415  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4122  transcriptional repressor RbsR  34.92 
 
 		 330 aa  168  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.305602  normal  0.0911869 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4270  transcriptional repressor RbsR  34.92 
 
 		 330 aa  167  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000205239  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5190  transcriptional repressor RbsR  34.92 
 
 		 330 aa  168  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00327915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0279  transcriptional regulator, LacI family  35.73 
 
 		 351 aa  168  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03584  hypothetical protein  34.92 
 
 		 330 aa  167  2e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00148852  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3623  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.51 
 
 		 335 aa  167  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.487296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1128  transcriptional regulator, LacI family  32.24 
 
 		 361 aa  167  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0297  LacI family transcription regulator  33.14 
 
 		 340 aa  167  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  29.91 
 
 		 335 aa  166  4e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4165  transcriptional repressor RbsR  34.6 
 
 		 330 aa  167  4e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0172446  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06141  hypothetical protein  32.37 
 
 		 336 aa  166  5e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4241  transcriptional repressor RbsR  34.92 
 
 		 330 aa  166  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.327464  hitchhiker  0.00680444 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  34.93 
 
 		 339 aa  165  1.0000000000000001e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  34.12 
 
 		 340 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4219  transcriptional repressor RbsR  34.38 
 
 		 332 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.817954  normal  0.878921 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000337  ribose operon repressor  32.37 
 
 		 340 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3343  ribose operon repressor RbsR  34.6 
 
 		 337 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.142594  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04200  transcriptional regulator, LacI family  33.43 
 
 		 341 aa  163  3e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2467  LacI family transcription regulator  33.03 
 
 		 336 aa  163  3e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4278  transcriptional repressor RbsR  34.07 
 
 		 332 aa  163  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.134192  normal  0.933942 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4415  transcriptional regulator, LacI family  36.01 
 
 		 342 aa  163  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4169  transcriptional repressor RbsR  34.07 
 
 		 332 aa  163  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.451515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4113  transcriptional repressor RbsR  34.07 
 
 		 332 aa  163  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.493547  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4170  transcriptional repressor RbsR  31.12 
 
 		 341 aa  162  6e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000181496  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0345  transcriptional regulator for D-ribose, periplasmic binding protein, LacI family protein  31.07 
 
 		 334 aa  162  7e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1922  LacI family transcription regulator  33.33 
 
 		 339 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.704174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0292  transcriptional regulator, LacI family  35.48 
 
 		 336 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4098  transcriptional repressor RbsR  34.07 
 
 		 332 aa  162  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.396512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2892  transcriptional regulator, LacI family  35.26 
 
 		 340 aa  162  8.000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.207309  normal  0.956989 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0819  transcriptional regulator, LacI family  34.6 
 
 		 348 aa  162  8.000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4111  transcriptional repressor RbsR  32.14 
 
 		 333 aa  162  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0488485  normal  0.0159443 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04250  transcriptional regulator, LacI family  32.19 
 
 		 337 aa  161  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.335349  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  33.33 
 
 		 353 aa  160  3e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.03 
 
 		 336 aa  160  4e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2817  LacI family transcription regulator  32.44 
 
 		 339 aa  160  4e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2195  DNA-binding transcriptional repressor PurR  32.16 
 
 		 341 aa  160  4e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.578042  hitchhiker  0.00000679153 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.75 
 
 		 336 aa  160  4e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348221  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>