More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2718 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2718  LacI family transcription regulator  100 
 
 		 347 aa  703    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0935795  normal  0.0852564 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1662  LacI family transcription regulator  39.42 
 
 		 337 aa  241  1e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4918  transcriptional regulator, LacI family  39.64 
 
 		 346 aa  228  2e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3841  transcriptional regulator, LacI family  39.64 
 
 		 346 aa  228  2e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.455211 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2445  LacI family transcription regulator  38.94 
 
 		 337 aa  224  2e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.609487  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02195  transcription regulator transcription regulator protein  39.17 
 
 		 355 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.479594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0755  LacI family transcription regulator  36.47 
 
 		 357 aa  219  5e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0274  alanine racemase  38.92 
 
 		 340 aa  219  6e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0276  LacI family transcription regulator  36.44 
 
 		 347 aa  219  7e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0937  LacI family transcription regulator  38.44 
 
 		 337 aa  218  1e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.266523  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3516  LacI family transcription regulator  36.81 
 
 		 338 aa  218  2e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3025  LacI family transcription regulator  37.13 
 
 		 338 aa  217  2e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.824077 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1135  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  37.13 
 
 		 338 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3221  transcriptional regulator, LacI family  37.13 
 
 		 338 aa  216  4e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1073  regulatory protein, LacI  36.39 
 
 		 338 aa  216  4e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1728  LacI family transcription regulator  39.18 
 
 		 348 aa  216  5e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.531296  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1170  LacI family transcription regulator  37.13 
 
 		 338 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.353815 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2371  LacI family transcription regulator  35.88 
 
 		 337 aa  215  8e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0453022  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1019  LacI family transcription regulator  36.63 
 
 		 340 aa  215  9.999999999999999e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1207  alanine racemase  36.26 
 
 		 339 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2943  LacI family transcription regulator  36.48 
 
 		 338 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.318917 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3122  LacI family transcription regulator  36.48 
 
 		 338 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1071  regulatory protein, LacI  36.81 
 
 		 338 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1096  LacI family transcription regulator  37.46 
 
 		 338 aa  211  1e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1304  LacI family transcription regulator  37.58 
 
 		 340 aa  211  1e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.812523 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1111  LacI family transcription regulator  36.09 
 
 		 339 aa  211  1e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0121938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0197  LacI family transcription regulator  39.4 
 
 		 340 aa  211  1e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2709  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35 
 
 		 347 aa  210  2e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00648208  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1442  LacI family transcription regulator  37.87 
 
 		 341 aa  210  3e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3042  LacI family transcription regulator  39.24 
 
 		 342 aa  207  2e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000688276 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3033  LacI family transcription regulator  36.12 
 
 		 351 aa  206  6e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3513  LacI family transcription regulator  37.54 
 
 		 338 aa  205  1e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.98216  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3555  LacI family transcription regulator  38.4 
 
 		 352 aa  203  3e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0245  LacI family transcription regulator  38.42 
 
 		 339 aa  201  9.999999999999999e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.05929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2141  LacI family transcription regulator  37.18 
 
 		 340 aa  200  3e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0418584  normal  0.0217452 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1755  LacI family transcription regulator  36.33 
 
 		 360 aa  199  3.9999999999999996e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.998653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0920  LacI family transcription regulator  35.55 
 
 		 351 aa  199  5e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.830745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04322  transcriptional regulator LacI family  37.22 
 
 		 355 aa  197  3e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2376  LacI family transcription regulator  33.23 
 
 		 339 aa  194  2e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0719999  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3423  transcriptional regulator, LacI family  36.1 
 
 		 366 aa  193  4e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0558625 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03849  sal operon transcriptional repressor  36.69 
 
 		 336 aa  192  5e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  39 
 
 		 339 aa  192  8e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1609  LacI family transcription regulator  36.56 
 
 		 356 aa  189  5.999999999999999e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03674  transcriptional regulator LacI family  34.51 
 
 		 342 aa  185  1.0000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  36.8 
 
 		 353 aa  184  1.0000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3623  LacI family transcription regulator  34.37 
 
 		 350 aa  183  3e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.039372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0229  LacI family transcription regulator  34.84 
 
 		 358 aa  182  9.000000000000001e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.720422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3995  LacI family transcription regulator  35.34 
 
 		 352 aa  181  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.917064 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3179  transcriptional regulator, LacI family  36.95 
 
 		 355 aa  177  2e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.588941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  36.2 
 
 		 368 aa  176  4e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00429  transcriptional repressor, LacI family protein  32.75 
 
 		 334 aa  176  5e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2691  LacI family transcription regulator  33.14 
 
 		 335 aa  176  7e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0512  LacI family transcription regulator  36.71 
 
 		 336 aa  175  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3470  transcriptional regulator, LacI family  38.81 
 
 		 331 aa  174  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2074  LacI family transcription regulator  35.58 
 
 		 337 aa  174  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.243502  normal  0.538933 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  36.18 
 
 		 353 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0345  transcriptional regulator for D-ribose, periplasmic binding protein, LacI family protein  31.95 
 
 		 334 aa  172  7.999999999999999e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.14 
 
 		 339 aa  171  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0717  LacI family transcription regulator  34.67 
 
 		 358 aa  170  3e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0031  transcriptional regulator, LacI family  34.41 
 
 		 351 aa  170  4e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.532737  hitchhiker  0.0000002992 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0768  LacI family transcription regulator  33.24 
 
 		 332 aa  169  5e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0915061  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2511  LacI family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 346 aa  169  6e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.743819  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2250  DNA-binding transcriptional regulator CytR  34.38 
 
 		 335 aa  167  2.9999999999999998e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1367  ribose operon repressor  31.38 
 
 		 333 aa  166  4e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.390962  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4896  transcriptional repressor RbsR  32.54 
 
 		 333 aa  166  4e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000156613  hitchhiker  0.000000782419 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3973  transcriptional repressor RbsR  32.94 
 
 		 338 aa  166  5e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000131921  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0806  LacI family transcription regulator  34.92 
 
 		 358 aa  166  5e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0006  ribose operon repressor  32.64 
 
 		 334 aa  166  5e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.038565  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23440  transcriptional regulator, LacI family  37.43 
 
 		 350 aa  166  6.9999999999999995e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.769589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3623  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.83 
 
 		 335 aa  166  6.9999999999999995e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.487296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3252  transcriptional regulator, LacI family  35.19 
 
 		 351 aa  166  8e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3918  LacI family transcription regulator  37.04 
 
 		 351 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  34.12 
 
 		 337 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4170  transcriptional repressor RbsR  32.75 
 
 		 341 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000181496  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03819  DNA-binding transcriptional dual regulator  35.21 
 
 		 341 aa  163  3e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4376  DNA-binding transcriptional regulator CytR  35.21 
 
 		 341 aa  163  3e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.76111 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4051  transcriptional regulator, LacI family  35.21 
 
 		 341 aa  163  3e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4166  DNA-binding transcriptional regulator CytR  35.21 
 
 		 343 aa  163  3e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0168  DNA-binding transcriptional regulator CytR  34.01 
 
 		 347 aa  164  3e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4084  DNA-binding transcriptional regulator CytR  35.21 
 
 		 341 aa  163  3e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03768  hypothetical protein  35.21 
 
 		 341 aa  163  3e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4470  DNA-binding transcriptional regulator CytR  35.21 
 
 		 341 aa  163  3e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4416  DNA-binding transcriptional regulator CytR  35.21 
 
 		 343 aa  163  3e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.506908  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2311  transcriptional regulator, LacI family  30.91 
 
 		 335 aa  163  4.0000000000000004e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000106518  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2401  LacI family transcription regulator  35.29 
 
 		 318 aa  163  4.0000000000000004e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  33.13 
 
 		 341 aa  163  5.0000000000000005e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0182  DNA-binding transcriptional regulator CytR  33.43 
 
 		 347 aa  162  7e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0282  LacI family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 342 aa  162  7e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.727359 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0506  LacI family transcription regulator  31.88 
 
 		 332 aa  162  7e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.549777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000337  ribose operon repressor  31.36 
 
 		 340 aa  162  7e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2062  LacI family transcription regulator  35.17 
 
 		 348 aa  162  8.000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0513684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4039  DNA-binding transcriptional regulator CytR  35.5 
 
 		 341 aa  162  8.000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06141  hypothetical protein  31.07 
 
 		 336 aa  162  9e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5391  DNA-binding transcriptional regulator CytR  35.12 
 
 		 330 aa  162  9e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.504328  normal  0.696689 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4424  DNA-binding transcriptional regulator CytR  35.12 
 
 		 341 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4426  DNA-binding transcriptional regulator CytR  35.12 
 
 		 341 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4310  DNA-binding transcriptional regulator CytR  35.12 
 
 		 341 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  32.84 
 
 		 331 aa  162  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2894  transcriptional regulator, LacI family  36.93 
 
 		 350 aa  162  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4494  DNA-binding transcriptional regulator CytR  35.12 
 
 		 341 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>