More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2894 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_2894  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 350 aa  701    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2898  transcriptional regulator, LacI family  82 
 
 		 350 aa  587  1e-166  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0052  LacI family transcription regulator  68.1 
 
 		 364 aa  479  1e-134  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0313  transcriptional regulator, LacI family  68.25 
 
 		 334 aa  455  1e-127  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3846  transcriptional regulator, LacI family  53.64 
 
 		 348 aa  348  9e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00500845  normal  0.20128 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7053  LacI family transcription regulator  54.73 
 
 		 350 aa  340  2e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3715  transcriptional regulator, LacI family  47.04 
 
 		 329 aa  285  5.999999999999999e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000372976 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0397  LacI family transcription regulator  46.55 
 
 		 371 aa  267  2e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3799  transcriptional regulator, LacI family  44.67 
 
 		 356 aa  261  1e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7040  LacI family transcription regulator  46.44 
 
 		 353 aa  253  3e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7045  LacI family transcription regulator  42.18 
 
 		 340 aa  249  3e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4611  transcriptional regulator, LacI family  42.07 
 
 		 344 aa  231  2e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0429  LacI family transcription regulator  39.83 
 
 		 336 aa  226  5.0000000000000005e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.75563  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17860  transcriptional regulator  39.42 
 
 		 339 aa  219  6e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.6068  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3267  transcriptional regulator, LacI family  36.41 
 
 		 361 aa  216  4e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0125  LacI family response repressor  38.35 
 
 		 346 aa  214  9.999999999999999e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.258556  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3139  LacI family transcription regulator  37.33 
 
 		 370 aa  214  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1359  LacI family transcription regulator  41.39 
 
 		 350 aa  208  1e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.343694 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4706  transcriptional regulator, LacI family  37.29 
 
 		 339 aa  195  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5743  transcriptional regulator, LacI family  37.39 
 
 		 349 aa  193  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1128  transcriptional regulator, LacI family  34.27 
 
 		 361 aa  192  7e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2027  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  38.4 
 
 		 346 aa  189  5.999999999999999e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.571384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0382  transcriptional regulator, LacI family  36.28 
 
 		 360 aa  189  7e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4339  LacI family transcription regulator  36.28 
 
 		 373 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  34.86 
 
 		 342 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2373  LacI family transcription regulator  35.88 
 
 		 346 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0006  ribose operon repressor  34.31 
 
 		 334 aa  183  4.0000000000000006e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.038565  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000337  ribose operon repressor  32.75 
 
 		 340 aa  182  9.000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06141  hypothetical protein  33.04 
 
 		 336 aa  182  1e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1367  ribose operon repressor  34.31 
 
 		 333 aa  181  2e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.390962  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0559  transcriptional regulator, LacI family  36.34 
 
 		 337 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4870  transcriptional regulator, LacI family  37.93 
 
 		 336 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.191051  normal  0.157 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0345  transcriptional regulator for D-ribose, periplasmic binding protein, LacI family protein  33.14 
 
 		 334 aa  177  2e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2863  putative catabolite control protein A  34.41 
 
 		 332 aa  177  4e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4741  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  37.1 
 
 		 350 aa  176  6e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00115423 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2548  catabolite control protein A, putative  34.12 
 
 		 332 aa  176  7e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04200  transcriptional regulator, LacI family  32.37 
 
 		 341 aa  175  8e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3366  transcriptional regulator, LacI family  38.41 
 
 		 345 aa  175  9.999999999999999e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.621773  hitchhiker  0.000736287 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0233  regulatory protein LacI  33.62 
 
 		 349 aa  174  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  31.59 
 
 		 333 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.59 
 
 		 333 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3243  LacI family transcription regulator  34.68 
 
 		 344 aa  172  7.999999999999999e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1962  transcriptional regulator, LacI family  34.57 
 
 		 352 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  36.56 
 
 		 355 aa  172  1e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0832  LacI family transcription regulator  33.05 
 
 		 346 aa  171  1e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0590  LacI family transcription regulator  32.66 
 
 		 346 aa  171  2e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000145078  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0825  transcriptional regulator, LacI family  38.48 
 
 		 347 aa  169  5e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.129888 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3298  LacI family transcription regulator  36.2 
 
 		 388 aa  168  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.27 
 
 		 336 aa  167  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0757  LacI transcriptional regulator  32.85 
 
 		 330 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4598  transcriptional regulator, LacI family  34.29 
 
 		 367 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  36.98 
 
 		 332 aa  166  4e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4680  transcriptional regulator, LacI family  34.76 
 
 		 331 aa  166  5e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  34.18 
 
 		 342 aa  166  8e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  38.32 
 
 		 353 aa  166  8e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23020  transcriptional regulator, LacI family  32.31 
 
 		 336 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000406909  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.85 
 
 		 330 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0296  degradation activator  34.91 
 
 		 331 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51820  sucrose operon repressor protein  34.78 
 
 		 332 aa  165  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.769791  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2170  LacI family transcription regulator  32.47 
 
 		 366 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.626121  normal  0.28501 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04250  transcriptional regulator, LacI family  30.66 
 
 		 337 aa  164  3e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.335349  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  37.1 
 
 		 347 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3304  transcriptional regulator, LacI family  37.69 
 
 		 358 aa  163  5.0000000000000005e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000642763  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0884  transcriptional regulator, LacI family  32.94 
 
 		 330 aa  162  7e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.45098  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0418  alanine racemase  30.9 
 
 		 338 aa  162  7e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.923997  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1744  transcriptional regulator, LacI family  34.48 
 
 		 336 aa  162  8.000000000000001e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  36.79 
 
 		 335 aa  161  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0131  transcriptional regulator, LacI family  36.78 
 
 		 343 aa  161  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4122  transcriptional repressor RbsR  33.33 
 
 		 330 aa  160  3e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.305602  normal  0.0911869 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3973  transcriptional repressor RbsR  33.14 
 
 		 338 aa  160  3e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000131921  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5190  transcriptional repressor RbsR  33.33 
 
 		 330 aa  160  3e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00327915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4111  transcriptional repressor RbsR  33.76 
 
 		 333 aa  160  3e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0488485  normal  0.0159443 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06943  hypothetical protein  36.18 
 
 		 334 aa  160  4e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  35.87 
 
 		 346 aa  160  4e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4479  LacI family transcription regulator  34.88 
 
 		 342 aa  160  4e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.277487  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1870  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.43 
 
 		 337 aa  160  4e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.796705  normal  0.714887 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  35.02 
 
 		 340 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  36.19 
 
 		 346 aa  160  5e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1628  LacI family transcription regulator  35.63 
 
 		 343 aa  159  6e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4270  transcriptional repressor RbsR  33.33 
 
 		 330 aa  159  6e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000205239  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1586  LacI family transcription regulator  35.36 
 
 		 343 aa  159  6e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122412  normal  0.650271 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1129  LacI family transcription regulator  35.36 
 
 		 343 aa  159  6e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1609  LacI family transcription regulator  35.36 
 
 		 343 aa  159  6e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0684889  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4165  transcriptional repressor RbsR  33.02 
 
 		 330 aa  159  6e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0172446  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4748  LacI family transcription regulator  35.74 
 
 		 343 aa  159  7e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  35.96 
 
 		 340 aa  159  8e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2672  DNA-binding transcriptional repressor PurR  34.77 
 
 		 341 aa  159  9e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.807137  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3275  transcriptional regulator, LacI family  36.93 
 
 		 333 aa  159  9e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.183529  hitchhiker  0.00604574 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2388  DNA-binding transcriptional repressor PurR  34.77 
 
 		 341 aa  158  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.282493  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2691  LacI family transcription regulator  34.69 
 
 		 335 aa  158  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1506  LacI family transcription regulator  35.63 
 
 		 343 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4241  transcriptional repressor RbsR  33.33 
 
 		 330 aa  158  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.327464  hitchhiker  0.00680444 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  35.02 
 
 		 340 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1525  LacI family transcription regulator  35.63 
 
 		 343 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  32.63 
 
 		 331 aa  157  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2022  ribose operon repressor RbsR  35.33 
 
 		 343 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.662423  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2472  ribose operon repressor RbsR  35.33 
 
 		 343 aa  158  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1857  ribose operon repressor RbsR  35.33 
 
 		 343 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1870  ribose operon repressor RbsR  35.33 
 
 		 343 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.585666  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2870  transcriptional regulator, LacI family  37.54 
 
 		 342 aa  157  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>