More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0233 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0233  regulatory protein LacI  100 
 
 		 349 aa  714    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3298  LacI family transcription regulator  44.63 
 
 		 388 aa  256  6e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5743  transcriptional regulator, LacI family  37.92 
 
 		 349 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4706  transcriptional regulator, LacI family  34.82 
 
 		 339 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0397  LacI family transcription regulator  35.03 
 
 		 371 aa  196  4.0000000000000005e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7053  LacI family transcription regulator  34.1 
 
 		 350 aa  183  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3715  transcriptional regulator, LacI family  34.88 
 
 		 329 aa  183  4.0000000000000006e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000372976 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3799  transcriptional regulator, LacI family  32.79 
 
 		 356 aa  182  7e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17860  transcriptional regulator  33.9 
 
 		 339 aa  177  2e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.6068  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2894  transcriptional regulator, LacI family  33.62 
 
 		 350 aa  174  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7045  LacI family transcription regulator  33.33 
 
 		 340 aa  172  6.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0052  LacI family transcription regulator  33.14 
 
 		 364 aa  169  4e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2898  transcriptional regulator, LacI family  32.48 
 
 		 350 aa  162  8.000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0429  LacI family transcription regulator  30.97 
 
 		 336 aa  158  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.75563  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0884  transcriptional regulator, LacI family  32.47 
 
 		 330 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.45098  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0728  transcriptional regulator, LacI family  34.19 
 
 		 337 aa  157  3e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.3979  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4611  transcriptional regulator, LacI family  31.44 
 
 		 344 aa  156  4e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3846  transcriptional regulator, LacI family  33.84 
 
 		 348 aa  155  9e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00500845  normal  0.20128 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0757  LacI transcriptional regulator  32.76 
 
 		 330 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1324  LacI family transcription regulator  32.33 
 
 		 336 aa  155  1e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0131249  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2609  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.2 
 
 		 342 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3272  LacI family transcription regulator  32.42 
 
 		 352 aa  153  5e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4598  transcriptional regulator, LacI family  34.89 
 
 		 367 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1962  transcriptional regulator, LacI family  34.58 
 
 		 352 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1983  HTH-type transcriptional repressor PurR (purine nucleotide synthesis repressor)  29.53 
 
 		 333 aa  149  6e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7040  LacI family transcription regulator  31.81 
 
 		 353 aa  146  5e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4870  transcriptional regulator, LacI family  31.27 
 
 		 336 aa  146  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.191051  normal  0.157 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5702  transcriptional regulator, LacI family  28.25 
 
 		 343 aa  145  7.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.111509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01581  transcriptional regulator  29.97 
 
 		 334 aa  145  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2081  LacI family transcription regulator  30.23 
 
 		 333 aa  144  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4339  LacI family transcription regulator  33.71 
 
 		 373 aa  144  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002664  LacI-family regulatory protein  30.28 
 
 		 341 aa  142  7e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1438  transcriptional regulator, LacI family  30.75 
 
 		 337 aa  142  8e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003941  transcriptional regulator LacI family protein  29.97 
 
 		 334 aa  141  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2385  transcriptional regulator, LacI family  28.41 
 
 		 346 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.171577  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1736  transcriptional regulator, LacI family  33.43 
 
 		 333 aa  142  9.999999999999999e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000004003  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3139  LacI family transcription regulator  30.65 
 
 		 370 aa  141  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0313  transcriptional regulator, LacI family  29.57 
 
 		 334 aa  141  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1856  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.9 
 
 		 342 aa  141  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.945809  hitchhiker  0.0011577 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2507  transcriptional regulator, periplasmic binding protein of LacI family protein  31.38 
 
 		 338 aa  140  3.9999999999999997e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.445797  normal  0.20531 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0647  transcriptional regulator, LacI family  30.14 
 
 		 357 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2733  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  31.5 
 
 		 331 aa  139  6e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51820  sucrose operon repressor protein  30.9 
 
 		 332 aa  139  7.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.769791  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0631  ribose operon repressor  29.72 
 
 		 323 aa  138  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0664  ribose operon repressor  29.72 
 
 		 323 aa  138  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.566043  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03798  galactose operon repressor  31.67 
 
 		 333 aa  138  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0382  transcriptional regulator, LacI family  32.86 
 
 		 360 aa  138  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0352  transcriptional regulator, LacI family  31.1 
 
 		 347 aa  138  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00162695  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0721  ribose operon repressor  29.72 
 
 		 323 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.40772e-23 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4896  transcriptional repressor RbsR  29.31 
 
 		 333 aa  137  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000156613  hitchhiker  0.000000782419 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  31.19 
 
 		 337 aa  137  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  31.03 
 
 		 348 aa  137  3.0000000000000003e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1662  LacI family transcription regulator  31.78 
 
 		 337 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4101  DNA-binding transcriptional regulator CytR  30.99 
 
 		 342 aa  137  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00429  transcriptional repressor, LacI family protein  31.36 
 
 		 334 aa  137  4e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0115  DNA-binding transcriptional regulator CytR  30.99 
 
 		 342 aa  137  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06943  hypothetical protein  29.53 
 
 		 334 aa  137  4e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  32.08 
 
 		 368 aa  137  4e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3342  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  32.11 
 
 		 332 aa  136  5e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2718  LacI family transcription regulator  32.22 
 
 		 347 aa  136  5e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0935795  normal  0.0852564 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  29.39 
 
 		 349 aa  135  7.000000000000001e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  30.97 
 
 		 342 aa  136  7.000000000000001e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  31.76 
 
 		 353 aa  135  7.000000000000001e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3070  LacI family transcription regulator  32.63 
 
 		 338 aa  135  9e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1216  LacI family transcription regulator  32.63 
 
 		 338 aa  135  9e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.129549  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0651  LacI family transcription regulator  32.63 
 
 		 338 aa  135  9e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1420  LacI family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 338 aa  135  9e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0502  LacI family transcription regulator  32.63 
 
 		 338 aa  135  9e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0793  ribose operon repressor  29.41 
 
 		 323 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00165994  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0575  ribose operon repressor  29.41 
 
 		 323 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0574  ribose operon repressor  29.41 
 
 		 323 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1413  LacI family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 341 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.492871  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2273  LacI family transcription regulator  30.92 
 
 		 333 aa  134  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0311079  hitchhiker  0.000018406 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1118  LacI family transcription regulator  33.13 
 
 		 341 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2027  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.92 
 
 		 346 aa  134  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.571384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4344  LacI family transcription regulator  33.03 
 
 		 341 aa  134  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  30.79 
 
 		 332 aa  134  3e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1117  LacI family transcription regulator  33.43 
 
 		 341 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.972514 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4741  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.14 
 
 		 350 aa  134  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00115423 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.12 
 
 		 336 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1398  ribose operon repressor RbsR  28.96 
 
 		 334 aa  133  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0578  LacI family transcription regulator  29.41 
 
 		 323 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2153  alanine racemase  31.02 
 
 		 337 aa  133  3.9999999999999996e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.419726  normal  0.0819902 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4642  ribose operon repressor  29.1 
 
 		 323 aa  133  5e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.317022  unclonable  5.22733e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0732  ribose operon repressor  29.1 
 
 		 323 aa  133  5e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1474  transcriptional regulator, LacI family  31.9 
 
 		 345 aa  133  5e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.470047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1209  LacI family transcription regulator  33.03 
 
 		 341 aa  133  5e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1128  transcriptional regulator, LacI family  29.68 
 
 		 361 aa  133  6e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0754  LacI family transcription regulator  33.03 
 
 		 341 aa  133  6e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1235  LacI family transcription regulator  33.03 
 
 		 341 aa  133  6e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3843  transcriptional regulator  32.32 
 
 		 340 aa  132  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00298813  normal  0.0397253 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1400  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.71 
 
 		 332 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.665266  normal  0.0917942 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0698  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  30.34 
 
 		 330 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3595  sugar binding transcriptional regulator, LacI family  30.46 
 
 		 331 aa  132  7.999999999999999e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00083156 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1790  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.2 
 
 		 337 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00351385  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4506  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  31.9 
 
 		 332 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4795  catabolite control protein A  32.11 
 
 		 332 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2650  LacI family sucrose operon repressor  30.46 
 
 		 331 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3033  LacI family transcription regulator  31.14 
 
 		 351 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8123  transcriptional regulator, LacI family  30.12 
 
 		 358 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0592322  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>