More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1962 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_1962  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 352 aa  728    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4598  transcriptional regulator, LacI family  94.52 
 
 		 367 aa  660    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2373  LacI family transcription regulator  46.9 
 
 		 346 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4339  LacI family transcription regulator  46.02 
 
 		 373 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0382  transcriptional regulator, LacI family  45.43 
 
 		 360 aa  300  2e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2027  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  44.9 
 
 		 346 aa  287  2e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.571384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3243  LacI family transcription regulator  47.52 
 
 		 344 aa  285  5.999999999999999e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4741  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  45.7 
 
 		 350 aa  283  5.000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00115423 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3715  transcriptional regulator, LacI family  42.51 
 
 		 329 aa  248  1e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000372976 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17860  transcriptional regulator  41.64 
 
 		 339 aa  241  1e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.6068  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0429  LacI family transcription regulator  38.76 
 
 		 336 aa  234  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.75563  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002664  LacI-family regulatory protein  38.19 
 
 		 341 aa  226  3e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7053  LacI family transcription regulator  39.24 
 
 		 350 aa  226  4e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3846  transcriptional regulator, LacI family  39.88 
 
 		 348 aa  214  9.999999999999999e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00500845  normal  0.20128 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0397  LacI family transcription regulator  39.19 
 
 		 371 aa  213  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2507  transcriptional regulator, periplasmic binding protein of LacI family protein  37.42 
 
 		 338 aa  211  1e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.445797  normal  0.20531 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7045  LacI family transcription regulator  36.2 
 
 		 340 aa  209  6e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3799  transcriptional regulator, LacI family  38.55 
 
 		 356 aa  207  2e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0052  LacI family transcription regulator  36.23 
 
 		 364 aa  201  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0779  LacI family transcription regulator  37.22 
 
 		 339 aa  195  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2898  transcriptional regulator, LacI family  36 
 
 		 350 aa  195  1e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0707  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  36.93 
 
 		 331 aa  190  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0313  transcriptional regulator, LacI family  37.43 
 
 		 334 aa  186  4e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3139  LacI family transcription regulator  35.99 
 
 		 370 aa  186  4e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  36.52 
 
 		 368 aa  185  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7040  LacI family transcription regulator  36.05 
 
 		 353 aa  182  7e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2894  transcriptional regulator, LacI family  34.57 
 
 		 350 aa  181  2e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1128  transcriptional regulator, LacI family  33.33 
 
 		 361 aa  178  1e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3267  transcriptional regulator, LacI family  33.7 
 
 		 361 aa  176  4e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4680  transcriptional regulator, LacI family  33.73 
 
 		 331 aa  172  6.999999999999999e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3179  transcriptional regulator, LacI family  37.04 
 
 		 355 aa  167  2e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.588941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4611  transcriptional regulator, LacI family  36.78 
 
 		 344 aa  167  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  35.39 
 
 		 339 aa  166  4e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  34.02 
 
 		 353 aa  166  4e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  32.44 
 
 		 341 aa  166  5.9999999999999996e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1481  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.99 
 
 		 348 aa  166  6.9999999999999995e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1359  LacI family transcription regulator  34.25 
 
 		 350 aa  163  4.0000000000000004e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.343694 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0559  transcriptional regulator, LacI family  32.44 
 
 		 337 aa  162  1e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  32.84 
 
 		 337 aa  162  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0233  regulatory protein LacI  34.58 
 
 		 349 aa  161  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.22 
 
 		 333 aa  160  3e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  33.22 
 
 		 333 aa  160  4e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5743  transcriptional regulator, LacI family  32.39 
 
 		 349 aa  159  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4896  transcriptional repressor RbsR  31.53 
 
 		 333 aa  158  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000156613  hitchhiker  0.000000782419 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  32.54 
 
 		 348 aa  158  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4706  transcriptional regulator, LacI family  31.9 
 
 		 339 aa  156  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3366  transcriptional regulator, LacI family  35.84 
 
 		 345 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.621773  hitchhiker  0.000736287 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1983  HTH-type transcriptional repressor PurR (purine nucleotide synthesis repressor)  29.43 
 
 		 333 aa  155  1e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  32.57 
 
 		 335 aa  154  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0907  LacI family transcription regulator  34.69 
 
 		 341 aa  154  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0352  transcriptional regulator, LacI family  32.76 
 
 		 347 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00162695  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  30.94 
 
 		 331 aa  153  4e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0600  transcriptional regulator, LacI family  34.91 
 
 		 332 aa  153  4e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06141  hypothetical protein  29.5 
 
 		 336 aa  153  4e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4233  transcriptional repressor RbsR  31.7 
 
 		 328 aa  152  7e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00129115  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3973  transcriptional repressor RbsR  31.74 
 
 		 338 aa  152  7e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000131921  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0006  ribose operon repressor  30.95 
 
 		 334 aa  152  7e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.038565  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0282  LacI family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 342 aa  152  8.999999999999999e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.727359 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4170  transcriptional repressor RbsR  31.21 
 
 		 341 aa  151  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000181496  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.75 
 
 		 336 aa  151  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2475  transcriptional regulator, LacI family  33.01 
 
 		 340 aa  150  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000232076  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06943  hypothetical protein  33.23 
 
 		 334 aa  150  5e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01670  transcriptional regulator  34.99 
 
 		 348 aa  149  6e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  31.71 
 
 		 342 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2904  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.84 
 
 		 339 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000337  ribose operon repressor  29.5 
 
 		 340 aa  148  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0418  alanine racemase  32.48 
 
 		 338 aa  149  1.0000000000000001e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.923997  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1464  transcriptional regulator, LacI family  32.27 
 
 		 340 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.780097 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00429  transcriptional repressor, LacI family protein  33.88 
 
 		 334 aa  148  1.0000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4169  transcriptional repressor RbsR  32.14 
 
 		 332 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.451515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2609  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.55 
 
 		 342 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2691  LacI family transcription regulator  33.55 
 
 		 335 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2046  LacI family transcription regulator  34.39 
 
 		 344 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4113  transcriptional repressor RbsR  32.14 
 
 		 332 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.493547  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4278  transcriptional repressor RbsR  32.14 
 
 		 332 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.134192  normal  0.933942 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3252  transcriptional regulator, LacI family  34.56 
 
 		 351 aa  147  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0477  transcriptional regulator, LacI family  32.91 
 
 		 352 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4639  transcriptional regulator, LacI family  32.82 
 
 		 357 aa  146  4.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.496087  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4098  transcriptional repressor RbsR  32.14 
 
 		 332 aa  146  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.396512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1400  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.44 
 
 		 332 aa  146  7.0000000000000006e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.665266  normal  0.0917942 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3162  transcriptional regulator, LacI family  33.44 
 
 		 342 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.19211 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3243  HTH-type transcriptional regulator AscG  32.56 
 
 		 340 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000054765 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4111  transcriptional repressor RbsR  30.82 
 
 		 333 aa  145  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0488485  normal  0.0159443 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3344  HTH-type transcriptional regulator AscG  32.55 
 
 		 339 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.718161  normal  0.0271899 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1824  transcriptional regulator, LacI family  33.43 
 
 		 347 aa  145  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.021809  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3176  transcriptional regulator, LacI family  30.32 
 
 		 334 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.143935  normal  0.494014 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0832  LacI family transcription regulator  30.22 
 
 		 346 aa  144  2e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  30.54 
 
 		 333 aa  144  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2790  LacI family transcription regulator  34.01 
 
 		 348 aa  144  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4219  transcriptional repressor RbsR  31.82 
 
 		 332 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.817954  normal  0.878921 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0525  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.8 
 
 		 356 aa  144  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0948  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.34 
 
 		 337 aa  144  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.849116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  31.83 
 
 		 355 aa  144  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3586  transcriptional regulator, LacI family  34.82 
 
 		 333 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.983736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3162  HTH-type transcriptional regulator AscG  32.27 
 
 		 340 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0825  transcriptional regulator, LacI family  32.75 
 
 		 347 aa  144  3e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.129888 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1214  LacI family transcription regulator  30.32 
 
 		 334 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.692885  normal  0.113089 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0552  transcriptional regulator for galactose, periplasmic binding protein, LacI family protein  31.23 
 
 		 334 aa  143  3e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1129  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.32 
 
 		 334 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2680  alanine racemase  32.25 
 
 		 338 aa  144  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.769144  normal  0.967228 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>