More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3267 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3267  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 361 aa  724    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3139  LacI family transcription regulator  82.35 
 
 		 370 aa  587  1e-167  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0825  transcriptional regulator, LacI family  43.45 
 
 		 347 aa  234  2.0000000000000002e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.129888 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0052  LacI family transcription regulator  37.57 
 
 		 364 aa  223  4.9999999999999996e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2894  transcriptional regulator, LacI family  36.41 
 
 		 350 aa  216  4e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0397  LacI family transcription regulator  39.69 
 
 		 371 aa  215  9e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3799  transcriptional regulator, LacI family  38.24 
 
 		 356 aa  209  7e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3846  transcriptional regulator, LacI family  36.34 
 
 		 348 aa  202  7e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00500845  normal  0.20128 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2898  transcriptional regulator, LacI family  37.08 
 
 		 350 aa  202  9e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3715  transcriptional regulator, LacI family  36.99 
 
 		 329 aa  202  9e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000372976 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7045  LacI family transcription regulator  38.11 
 
 		 340 aa  201  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7053  LacI family transcription regulator  34.92 
 
 		 350 aa  196  5.000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1359  LacI family transcription regulator  37.28 
 
 		 350 aa  193  3e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.343694 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0313  transcriptional regulator, LacI family  36.52 
 
 		 334 aa  191  2e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7040  LacI family transcription regulator  37.29 
 
 		 353 aa  186  7e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3366  transcriptional regulator, LacI family  36.44 
 
 		 345 aa  182  7e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.621773  hitchhiker  0.000736287 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4611  transcriptional regulator, LacI family  36.9 
 
 		 344 aa  182  8.000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17860  transcriptional regulator  35.26 
 
 		 339 aa  181  2e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.6068  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  36.84 
 
 		 331 aa  179  9e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  35.77 
 
 		 337 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0382  transcriptional regulator, LacI family  35.91 
 
 		 360 aa  176  4e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4233  transcriptional repressor RbsR  37.3 
 
 		 328 aa  176  5e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00129115  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4741  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.14 
 
 		 350 aa  175  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00115423 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2373  LacI family transcription regulator  35.26 
 
 		 346 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3973  transcriptional repressor RbsR  34.93 
 
 		 338 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000131921  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.48 
 
 		 333 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4680  transcriptional regulator, LacI family  34.94 
 
 		 331 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  34.48 
 
 		 333 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4170  transcriptional repressor RbsR  33.89 
 
 		 341 aa  172  5.999999999999999e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000181496  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4339  LacI family transcription regulator  33.33 
 
 		 373 aa  172  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  35.51 
 
 		 348 aa  171  2e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4598  transcriptional regulator, LacI family  34.53 
 
 		 367 aa  170  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0006  ribose operon repressor  33.13 
 
 		 334 aa  170  3e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.038565  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3272  LacI family transcription regulator  31.84 
 
 		 352 aa  169  8e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0429  LacI family transcription regulator  36.01 
 
 		 336 aa  169  8e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.75563  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06141  hypothetical protein  33.55 
 
 		 336 aa  167  4e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4896  transcriptional repressor RbsR  36.06 
 
 		 333 aa  166  5e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000156613  hitchhiker  0.000000782419 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1962  transcriptional regulator, LacI family  33.7 
 
 		 352 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4111  transcriptional repressor RbsR  35.2 
 
 		 333 aa  165  9e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0488485  normal  0.0159443 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4113  transcriptional repressor RbsR  35.17 
 
 		 332 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.493547  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000337  ribose operon repressor  32.61 
 
 		 340 aa  165  1.0000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4169  transcriptional repressor RbsR  35.17 
 
 		 332 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.451515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4278  transcriptional repressor RbsR  35.17 
 
 		 332 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.134192  normal  0.933942 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4098  transcriptional repressor RbsR  35.17 
 
 		 332 aa  163  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.396512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4219  transcriptional repressor RbsR  34.86 
 
 		 332 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.817954  normal  0.878921 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  34.66 
 
 		 332 aa  160  3e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4270  transcriptional repressor RbsR  34.67 
 
 		 330 aa  160  4e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000205239  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3243  LacI family transcription regulator  34.74 
 
 		 344 aa  160  4e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5190  transcriptional repressor RbsR  34.67 
 
 		 330 aa  160  5e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00327915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2250  DNA-binding transcriptional regulator CytR  33.52 
 
 		 335 aa  159  5e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4122  transcriptional repressor RbsR  34.67 
 
 		 330 aa  160  5e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.305602  normal  0.0911869 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4165  transcriptional repressor RbsR  34.37 
 
 		 330 aa  159  8e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0172446  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4241  transcriptional repressor RbsR  34.67 
 
 		 330 aa  158  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.327464  hitchhiker  0.00680444 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0226  LacI family transcription regulator  30.06 
 
 		 336 aa  157  2e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1128  transcriptional regulator, LacI family  32.03 
 
 		 361 aa  157  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03639  DNA-binding transcriptional repressor of ribose metabolism  34.67 
 
 		 330 aa  157  4e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00237415  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  32.1 
 
 		 347 aa  157  4e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03584  hypothetical protein  34.67 
 
 		 330 aa  157  4e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00148852  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00726  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.49 
 
 		 335 aa  156  4e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0728  transcriptional regulator, LacI family  31.64 
 
 		 337 aa  156  7e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.3979  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2511  LacI family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 346 aa  156  7e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.743819  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  30.92 
 
 		 340 aa  155  9e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2170  LacI family transcription regulator  33.12 
 
 		 366 aa  155  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.626121  normal  0.28501 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  30.92 
 
 		 340 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  30.73 
 
 		 340 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0125  LacI family response repressor  33.23 
 
 		 346 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.258556  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.09 
 
 		 336 aa  153  4e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1756  LacI family transcription regulator  33.83 
 
 		 370 aa  153  4e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4790  catabolite control protein A  29.06 
 
 		 332 aa  153  5e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4506  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  29.06 
 
 		 332 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04200  transcriptional regulator, LacI family  31.93 
 
 		 341 aa  152  5.9999999999999996e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2507  transcriptional regulator, periplasmic binding protein of LacI family protein  31.48 
 
 		 338 aa  152  7e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.445797  normal  0.20531 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  31.56 
 
 		 340 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4813  catabolite control protein A  29.34 
 
 		 332 aa  152  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  32.01 
 
 		 346 aa  151  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4811  catabolite control protein A  29.06 
 
 		 332 aa  151  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.01 
 
 		 339 aa  152  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4410  catabolite control protein A  28.77 
 
 		 332 aa  151  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0449  catabolite control protein A  28.77 
 
 		 332 aa  150  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002664  LacI-family regulatory protein  29.91 
 
 		 341 aa  151  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4795  catabolite control protein A  28.77 
 
 		 332 aa  151  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0352  transcriptional regulator, LacI family  34.17 
 
 		 347 aa  150  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00162695  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4427  catabolite control protein A  29.06 
 
 		 332 aa  150  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001746  transcriptional (co)regulator CytR  32.11 
 
 		 335 aa  150  3e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4790  DNA-binding transcriptional regulator CytR  30.89 
 
 		 342 aa  150  4e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120208 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4575  catabolite control protein A  28.77 
 
 		 332 aa  150  4e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4929  catabolite control protein A  28.77 
 
 		 332 aa  150  4e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39300  ribose operon repressor RbsR  32.31 
 
 		 337 aa  150  4e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00488223  normal  0.347554 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0892  LacI family transcription regulator  34.44 
 
 		 391 aa  150  4e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0296  degradation activator  29.6 
 
 		 331 aa  149  7e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  29.48 
 
 		 355 aa  149  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0418  alanine racemase  28.93 
 
 		 338 aa  149  1.0000000000000001e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.923997  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3304  transcriptional regulator, LacI family  35.29 
 
 		 358 aa  148  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000642763  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3383  LacI family transcription regulator  31.34 
 
 		 342 aa  148  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2245  LacI family transcription regulator  33.53 
 
 		 338 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.115687  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  31.16 
 
 		 346 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5743  transcriptional regulator, LacI family  29.1 
 
 		 349 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01581  transcriptional regulator  32.59 
 
 		 334 aa  148  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2742  DNA-binding transcriptional regulator CytR  30.99 
 
 		 335 aa  147  3e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0115  DNA-binding transcriptional regulator CytR  28.9 
 
 		 342 aa  147  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>