More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0313 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_0313  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 334 aa  663    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2894  transcriptional regulator, LacI family  68.25 
 
 		 350 aa  468  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2898  transcriptional regulator, LacI family  69.44 
 
 		 350 aa  466  9.999999999999999e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0052  LacI family transcription regulator  59.58 
 
 		 364 aa  407  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7053  LacI family transcription regulator  54.98 
 
 		 350 aa  326  4.0000000000000003e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3846  transcriptional regulator, LacI family  53.12 
 
 		 348 aa  324  1e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00500845  normal  0.20128 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3715  transcriptional regulator, LacI family  45.87 
 
 		 329 aa  269  5.9999999999999995e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000372976 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7045  LacI family transcription regulator  45.43 
 
 		 340 aa  259  3e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3799  transcriptional regulator, LacI family  46.25 
 
 		 356 aa  255  9e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0397  LacI family transcription regulator  46.27 
 
 		 371 aa  250  2e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4611  transcriptional regulator, LacI family  42.51 
 
 		 344 aa  235  9e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0429  LacI family transcription regulator  40 
 
 		 336 aa  228  1e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.75563  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7040  LacI family transcription regulator  44.35 
 
 		 353 aa  226  3e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17860  transcriptional regulator  40.36 
 
 		 339 aa  216  4e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.6068  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0125  LacI family response repressor  38.24 
 
 		 346 aa  206  6e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.258556  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1359  LacI family transcription regulator  41.35 
 
 		 350 aa  205  7e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.343694 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5743  transcriptional regulator, LacI family  37.61 
 
 		 349 aa  202  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3267  transcriptional regulator, LacI family  36.52 
 
 		 361 aa  197  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4706  transcriptional regulator, LacI family  36.69 
 
 		 339 aa  195  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1962  transcriptional regulator, LacI family  37.12 
 
 		 352 aa  192  7e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1128  transcriptional regulator, LacI family  35.06 
 
 		 361 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0382  transcriptional regulator, LacI family  37.35 
 
 		 360 aa  190  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4339  LacI family transcription regulator  37.35 
 
 		 373 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3139  LacI family transcription regulator  36.08 
 
 		 370 aa  188  1e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4598  transcriptional regulator, LacI family  36.81 
 
 		 367 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2373  LacI family transcription regulator  37.54 
 
 		 346 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2027  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  37.09 
 
 		 346 aa  183  3e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.571384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0559  transcriptional regulator, LacI family  37.8 
 
 		 337 aa  176  7e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3243  LacI family transcription regulator  35.31 
 
 		 344 aa  174  9.999999999999999e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4741  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.54 
 
 		 350 aa  175  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00115423 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  34.76 
 
 		 335 aa  171  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3366  transcriptional regulator, LacI family  39.07 
 
 		 345 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.621773  hitchhiker  0.000736287 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4870  transcriptional regulator, LacI family  39.14 
 
 		 336 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.191051  normal  0.157 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  37.35 
 
 		 353 aa  164  2.0000000000000002e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0006  ribose operon repressor  32.62 
 
 		 334 aa  163  3e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.038565  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2691  LacI family transcription regulator  36.36 
 
 		 335 aa  160  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0768  LacI family transcription regulator  37.31 
 
 		 332 aa  160  3e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0915061  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0631  ribose operon repressor  34.87 
 
 		 323 aa  159  5e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  31.63 
 
 		 342 aa  159  5e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0664  ribose operon repressor  34.87 
 
 		 323 aa  159  5e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.566043  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  34.62 
 
 		 346 aa  159  5e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  35.4 
 
 		 346 aa  159  6e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0757  LacI transcriptional regulator  33.53 
 
 		 330 aa  159  8e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2511  LacI family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 346 aa  159  8e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.743819  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4896  transcriptional repressor RbsR  34.65 
 
 		 333 aa  159  9e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000156613  hitchhiker  0.000000782419 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1367  ribose operon repressor  31.21 
 
 		 333 aa  158  1e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.390962  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0721  ribose operon repressor  34.87 
 
 		 323 aa  158  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.40772e-23 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2863  putative catabolite control protein A  33.99 
 
 		 332 aa  158  1e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  33.23 
 
 		 342 aa  158  1e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06141  hypothetical protein  31.34 
 
 		 336 aa  157  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0131  transcriptional regulator, LacI family  36.72 
 
 		 343 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2548  catabolite control protein A, putative  33.66 
 
 		 332 aa  157  2e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2281  transcriptional regulator, LacI family  36.89 
 
 		 334 aa  157  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0892  LacI family transcription regulator  36.61 
 
 		 391 aa  157  2e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3304  transcriptional regulator, LacI family  39.75 
 
 		 358 aa  157  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000642763  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0732  ribose operon repressor  34.54 
 
 		 323 aa  157  3e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000337  ribose operon repressor  31.64 
 
 		 340 aa  157  3e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04200  transcriptional regulator, LacI family  31.44 
 
 		 341 aa  157  3e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09530  transcriptional regulator, LacI family  32.34 
 
 		 340 aa  156  4e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00123183  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  36.95 
 
 		 353 aa  156  4e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0578  LacI family transcription regulator  33.88 
 
 		 323 aa  156  4e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0575  ribose operon repressor  34.54 
 
 		 323 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0574  ribose operon repressor  34.54 
 
 		 323 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1525  LacI family transcription regulator  34.23 
 
 		 343 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1506  LacI family transcription regulator  34.23 
 
 		 343 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0345  transcriptional regulator for D-ribose, periplasmic binding protein, LacI family protein  30.91 
 
 		 334 aa  156  5.0000000000000005e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0793  ribose operon repressor  34.54 
 
 		 323 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00165994  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  35.95 
 
 		 347 aa  156  6e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4642  ribose operon repressor  34.54 
 
 		 323 aa  155  6e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.317022  unclonable  5.22733e-26 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.9 
 
 		 336 aa  155  6e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  34.64 
 
 		 329 aa  156  6e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.64 
 
 		 337 aa  155  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0696  ribose operon repressor  34.21 
 
 		 323 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0345677  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0559  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.87 
 
 		 323 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000011059  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  32.72 
 
 		 333 aa  153  4e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.72 
 
 		 333 aa  153  4e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4438  transcriptional regulator, LacI family  35.22 
 
 		 342 aa  153  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0401839 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0884  transcriptional regulator, LacI family  32.54 
 
 		 330 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.45098  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  33.63 
 
 		 368 aa  152  5.9999999999999996e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1628  LacI family transcription regulator  33.73 
 
 		 343 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4680  transcriptional regulator, LacI family  35.84 
 
 		 331 aa  152  5.9999999999999996e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0219  LacI family transcription regulator  36.97 
 
 		 351 aa  152  7e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1790  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.03 
 
 		 337 aa  152  7e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00351385  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0832  LacI family transcription regulator  30.54 
 
 		 346 aa  152  8e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  37.91 
 
 		 339 aa  152  8.999999999999999e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0831  LacI family transcription regulator  34.86 
 
 		 326 aa  152  8.999999999999999e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569804  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  36.27 
 
 		 340 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4170  transcriptional repressor RbsR  32.36 
 
 		 341 aa  151  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000181496  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0728  transcriptional regulator, LacI family  32.94 
 
 		 337 aa  151  1e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.3979  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  33.44 
 
 		 355 aa  151  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0629  LacI family transcription regulator  30.33 
 
 		 339 aa  150  3e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.409769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0907  LacI family transcription regulator  36.57 
 
 		 341 aa  150  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1234  LacI family transcription regulator  33.23 
 
 		 343 aa  150  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50127  normal  0.134178 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3470  transcriptional regulator, LacI family  39.14 
 
 		 331 aa  150  4e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1129  LacI family transcription regulator  33.53 
 
 		 343 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1609  LacI family transcription regulator  33.53 
 
 		 343 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0684889  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1586  LacI family transcription regulator  33.53 
 
 		 343 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122412  normal  0.650271 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4748  LacI family transcription regulator  33.53 
 
 		 343 aa  149  8e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0040  transcriptional regulator, LacI family  34.04 
 
 		 330 aa  149  8e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4479  LacI family transcription regulator  34.23 
 
 		 342 aa  149  8e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.277487  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>