More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3304 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3304  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 358 aa  698    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000642763  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3366  transcriptional regulator, LacI family  49.27 
 
 		 345 aa  293  3e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.621773  hitchhiker  0.000736287 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1359  LacI family transcription regulator  48.85 
 
 		 350 aa  290  3e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.343694 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4680  transcriptional regulator, LacI family  42.9 
 
 		 331 aa  219  6e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3846  transcriptional regulator, LacI family  38.97 
 
 		 348 aa  183  3e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00500845  normal  0.20128 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7045  LacI family transcription regulator  37.69 
 
 		 340 aa  183  4.0000000000000006e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0429  LacI family transcription regulator  39.31 
 
 		 336 aa  173  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.75563  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4611  transcriptional regulator, LacI family  36.09 
 
 		 344 aa  171  2e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0052  LacI family transcription regulator  36.16 
 
 		 364 aa  169  5e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0397  LacI family transcription regulator  37.2 
 
 		 371 aa  168  1e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2894  transcriptional regulator, LacI family  37.69 
 
 		 350 aa  163  4.0000000000000004e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3799  transcriptional regulator, LacI family  36.47 
 
 		 356 aa  163  5.0000000000000005e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7040  LacI family transcription regulator  37.1 
 
 		 353 aa  162  8.000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2898  transcriptional regulator, LacI family  37.75 
 
 		 350 aa  161  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17860  transcriptional regulator  37.82 
 
 		 339 aa  160  4e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.6068  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7053  LacI family transcription regulator  37 
 
 		 350 aa  158  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0313  transcriptional regulator, LacI family  39.18 
 
 		 334 aa  154  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3139  LacI family transcription regulator  35.8 
 
 		 370 aa  150  4e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3267  transcriptional regulator, LacI family  34.4 
 
 		 361 aa  149  8e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2373  LacI family transcription regulator  34 
 
 		 346 aa  146  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0825  transcriptional regulator, LacI family  39.43 
 
 		 347 aa  146  5e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.129888 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3715  transcriptional regulator, LacI family  32.15 
 
 		 329 aa  145  9e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000372976 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4741  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.35 
 
 		 350 aa  142  9e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00115423 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4339  LacI family transcription regulator  32.69 
 
 		 373 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0382  transcriptional regulator, LacI family  32.41 
 
 		 360 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2507  transcriptional regulator, periplasmic binding protein of LacI family protein  29.02 
 
 		 338 aa  137  4e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.445797  normal  0.20531 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2027  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.19 
 
 		 346 aa  136  7.000000000000001e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.571384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0125  LacI family response repressor  34.59 
 
 		 346 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.258556  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0006  ribose operon repressor  30.77 
 
 		 334 aa  133  3.9999999999999996e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.038565  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002664  LacI-family regulatory protein  29.75 
 
 		 341 aa  130  4.0000000000000003e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0892  LacI family transcription regulator  33.33 
 
 		 391 aa  129  6e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01581  transcriptional regulator  27.22 
 
 		 334 aa  129  7.000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1128  transcriptional regulator, LacI family  30.81 
 
 		 361 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4598  transcriptional regulator, LacI family  32.19 
 
 		 367 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1962  transcriptional regulator, LacI family  31.56 
 
 		 352 aa  126  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2195  DNA-binding transcriptional repressor PurR  30.36 
 
 		 341 aa  125  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.578042  hitchhiker  0.00000679153 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003941  transcriptional regulator LacI family protein  26.07 
 
 		 334 aa  124  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4706  transcriptional regulator, LacI family  29.5 
 
 		 339 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1873  DNA-binding transcriptional repressor PurR  31.87 
 
 		 341 aa  124  3e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000326079  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4870  transcriptional regulator, LacI family  33.02 
 
 		 336 aa  123  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.191051  normal  0.157 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0582  alanine racemase  27.06 
 
 		 337 aa  123  6e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000548778  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01629  DNA-binding transcriptional repressor, hypoxanthine-binding  32.4 
 
 		 341 aa  122  8e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.847977  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1982  transcriptional regulator, LacI family  32.4 
 
 		 341 aa  122  8e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0168569  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1857  DNA-binding transcriptional repressor PurR  32.4 
 
 		 341 aa  122  8e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000046163  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1538  DNA-binding transcriptional repressor PurR  32.4 
 
 		 341 aa  122  8e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0686294  normal  0.0781462 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1971  DNA-binding transcriptional repressor PurR  32.4 
 
 		 341 aa  122  8e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000994316 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2372  DNA-binding transcriptional repressor PurR  32.4 
 
 		 341 aa  122  8e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000002203  normal  0.181026 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01618  hypothetical protein  32.4 
 
 		 341 aa  122  8e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.850711  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1738  DNA-binding transcriptional repressor PurR  32.4 
 
 		 341 aa  122  8e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.20958e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.84 
 
 		 336 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1324  LacI family transcription regulator  27.69 
 
 		 336 aa  121  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0131249  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1862  DNA-binding transcriptional repressor PurR  29.97 
 
 		 341 aa  120  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.171232  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2572  DNA-binding transcriptional repressor PurR  29.97 
 
 		 341 aa  120  3.9999999999999996e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.407544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1755  DNA-binding transcriptional repressor PurR  29.97 
 
 		 341 aa  120  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00265778  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5743  transcriptional regulator, LacI family  28.98 
 
 		 349 aa  119  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1715  DNA-binding transcriptional repressor PurR  29.29 
 
 		 341 aa  119  7.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.117715  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3243  LacI family transcription regulator  32.18 
 
 		 344 aa  119  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  31.1 
 
 		 332 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0559  transcriptional regulator, LacI family  32.94 
 
 		 337 aa  117  3e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23020  transcriptional regulator, LacI family  26.4 
 
 		 336 aa  117  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000406909  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000337  ribose operon repressor  27.52 
 
 		 340 aa  117  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0698  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  29.38 
 
 		 330 aa  117  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1563  DNA-binding transcriptional repressor PurR  30.59 
 
 		 341 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00208837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1526  DNA-binding transcriptional repressor PurR  30.59 
 
 		 341 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580264  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2388  DNA-binding transcriptional repressor PurR  29.97 
 
 		 341 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.282493  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1913  DNA-binding transcriptional repressor PurR  30.59 
 
 		 341 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000592501  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1683  DNA-binding transcriptional repressor PurR  28.57 
 
 		 341 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0832  LacI family transcription regulator  25.8 
 
 		 346 aa  117  3.9999999999999997e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06141  hypothetical protein  29.13 
 
 		 336 aa  117  3.9999999999999997e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2672  DNA-binding transcriptional repressor PurR  29.97 
 
 		 341 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.807137  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4111  transcriptional repressor RbsR  29.48 
 
 		 333 aa  117  5e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0488485  normal  0.0159443 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1540  DNA-binding transcriptional repressor PurR  30.75 
 
 		 341 aa  116  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000065632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1744  DNA-binding transcriptional repressor PurR  30.75 
 
 		 341 aa  116  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000285436  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0477  transcriptional regulator, LacI family  29.61 
 
 		 352 aa  116  6e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  31.01 
 
 		 337 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3973  transcriptional repressor RbsR  29.25 
 
 		 338 aa  115  7.999999999999999e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000131921  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15580  transcriptional regulator, LacI family  27.91 
 
 		 336 aa  115  8.999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1032  DNA-binding transcriptional repressor PurR  25.5 
 
 		 333 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.872659  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4479  LacI family transcription regulator  33.72 
 
 		 342 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.277487  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5235  LacI family transcription regulator  31.43 
 
 		 330 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1789  DNA-binding transcriptional repressor PurR  30.15 
 
 		 341 aa  114  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0286691 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2456  LacI family transcription regulator  32.87 
 
 		 352 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4069  LacI family transcription regulator  31.13 
 
 		 367 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5165  LacI family transcription regulator  31.43 
 
 		 330 aa  114  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1367  ribose operon repressor  26.7 
 
 		 333 aa  114  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.390962  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3452  LacI family transcription regulator  31.13 
 
 		 369 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.164472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2511  LacI family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 346 aa  114  4.0000000000000004e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.743819  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0768  LacI family transcription regulator  33.03 
 
 		 332 aa  113  5e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0915061  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0418  alanine racemase  28.25 
 
 		 338 aa  113  5e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.923997  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0040  transcriptional regulator, LacI family  29.8 
 
 		 330 aa  113  6e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3401  LacI family transcription regulator  30.82 
 
 		 367 aa  113  6e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1067  transcriptional regulator, LacI family  30.84 
 
 		 349 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0326258  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2717  LacI family transcription regulator  30.82 
 
 		 330 aa  112  9e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  28.07 
 
 		 331 aa  112  9e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20880  transcriptional regulator, LacI family  26.69 
 
 		 343 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5343  transcriptional regulator, LacI family  34.77 
 
 		 346 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.629268  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4933  transcriptional regulator, LacI family  33.98 
 
 		 339 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0794709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0296  degradation activator  30.06 
 
 		 331 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4990  transcriptional regulator, LacI family  35.04 
 
 		 342 aa  111  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0202864 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  27.05 
 
 		 341 aa  111  2.0000000000000002e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>