More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0806 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0806  LacI family transcription regulator  100 
 
 		 358 aa  739    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0717  LacI family transcription regulator  97.77 
 
 		 358 aa  718    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04322  transcriptional regulator LacI family  81.92 
 
 		 355 aa  568  1e-161  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3423  transcriptional regulator, LacI family  77.39 
 
 		 366 aa  540  9.999999999999999e-153  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0558625 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1019  LacI family transcription regulator  49.13 
 
 		 340 aa  335  5e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3042  LacI family transcription regulator  47.11 
 
 		 342 aa  307  2.0000000000000002e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000688276 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2709  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  46.22 
 
 		 347 aa  296  4e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00648208  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1207  alanine racemase  44.57 
 
 		 339 aa  292  7e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0937  LacI family transcription regulator  46.49 
 
 		 337 aa  291  9e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.266523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1135  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  44.64 
 
 		 338 aa  291  1e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3221  transcriptional regulator, LacI family  44.64 
 
 		 338 aa  291  1e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1071  regulatory protein, LacI  45.16 
 
 		 338 aa  291  1e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1170  LacI family transcription regulator  44.64 
 
 		 338 aa  291  1e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.353815 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1096  LacI family transcription regulator  45.64 
 
 		 338 aa  290  3e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1073  regulatory protein, LacI  45.77 
 
 		 338 aa  287  2e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1111  LacI family transcription regulator  45.06 
 
 		 339 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0121938  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3516  LacI family transcription regulator  45.32 
 
 		 338 aa  286  4e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3025  LacI family transcription regulator  45.16 
 
 		 338 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.824077 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2943  LacI family transcription regulator  44.87 
 
 		 338 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.318917 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3122  LacI family transcription regulator  44.87 
 
 		 338 aa  282  7.000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1304  LacI family transcription regulator  43.44 
 
 		 340 aa  281  2e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.812523 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2371  LacI family transcription regulator  38.78 
 
 		 337 aa  249  5e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0453022  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2376  LacI family transcription regulator  39.18 
 
 		 339 aa  244  1.9999999999999999e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0719999  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02195  transcription regulator transcription regulator protein  40.47 
 
 		 355 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.479594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4918  transcriptional regulator, LacI family  41.56 
 
 		 346 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3841  transcriptional regulator, LacI family  41.56 
 
 		 346 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.455211 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0229  LacI family transcription regulator  40.29 
 
 		 358 aa  230  3e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.720422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1755  LacI family transcription regulator  39.77 
 
 		 360 aa  223  4.9999999999999996e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.998653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0276  LacI family transcription regulator  38.76 
 
 		 347 aa  219  6e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2445  LacI family transcription regulator  38.84 
 
 		 337 aa  212  9e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.609487  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1662  LacI family transcription regulator  37.46 
 
 		 337 aa  211  1e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3033  LacI family transcription regulator  38.95 
 
 		 351 aa  209  7e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1442  LacI family transcription regulator  40.27 
 
 		 341 aa  209  7e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3513  LacI family transcription regulator  38.05 
 
 		 338 aa  206  4e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.98216  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0274  alanine racemase  36.13 
 
 		 340 aa  203  4e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0197  LacI family transcription regulator  36.94 
 
 		 340 aa  198  1.0000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03674  transcriptional regulator LacI family  37.17 
 
 		 342 aa  196  8.000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1728  LacI family transcription regulator  38.66 
 
 		 348 aa  189  9e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.531296  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0755  LacI family transcription regulator  36.42 
 
 		 357 aa  187  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3555  LacI family transcription regulator  39.62 
 
 		 352 aa  177  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  33.72 
 
 		 335 aa  177  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.33 
 
 		 330 aa  177  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0031  transcriptional regulator, LacI family  36.81 
 
 		 351 aa  176  7e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.532737  hitchhiker  0.0000002992 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0245  LacI family transcription regulator  35.18 
 
 		 339 aa  171  2e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.05929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3995  LacI family transcription regulator  34.9 
 
 		 352 aa  170  5e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.917064 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.53 
 
 		 336 aa  167  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3623  LacI family transcription regulator  34.56 
 
 		 350 aa  166  5e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.039372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  36.36 
 
 		 337 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2141  LacI family transcription regulator  33.91 
 
 		 340 aa  166  5.9999999999999996e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0418584  normal  0.0217452 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03849  sal operon transcriptional repressor  36.16 
 
 		 336 aa  165  9e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  35.46 
 
 		 368 aa  164  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0512  LacI family transcription regulator  36.98 
 
 		 336 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3623  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.33 
 
 		 335 aa  162  6e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.487296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.99 
 
 		 339 aa  161  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1609  LacI family transcription regulator  31.91 
 
 		 356 aa  161  1e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0907  LacI family transcription regulator  34.17 
 
 		 341 aa  161  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11530  transcriptional regulator, LacI family  35.24 
 
 		 331 aa  160  3e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00809623 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20880  transcriptional regulator, LacI family  32.65 
 
 		 343 aa  159  7e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4813  catabolite control protein A  31.21 
 
 		 332 aa  159  9e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0296  degradation activator  31.87 
 
 		 331 aa  158  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2718  LacI family transcription regulator  34.92 
 
 		 347 aa  158  1e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0935795  normal  0.0852564 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4811  catabolite control protein A  31.21 
 
 		 332 aa  158  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2403  transcriptional regulator, LacI family  32.94 
 
 		 379 aa  157  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00011763  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4506  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  30.91 
 
 		 332 aa  157  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4575  catabolite control protein A  30.91 
 
 		 332 aa  157  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4410  catabolite control protein A  30.91 
 
 		 332 aa  157  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4929  catabolite control protein A  30.91 
 
 		 332 aa  157  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4795  catabolite control protein A  30.91 
 
 		 332 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  33.33 
 
 		 348 aa  156  4e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3342  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  30.61 
 
 		 332 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1769  LacI family transcription regulator  33.05 
 
 		 339 aa  156  6e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4790  catabolite control protein A  30.91 
 
 		 332 aa  156  7e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0449  catabolite control protein A  30.91 
 
 		 332 aa  155  8e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3586  transcriptional regulator, LacI family  34.29 
 
 		 333 aa  155  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.983736  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4427  catabolite control protein A  30.61 
 
 		 332 aa  154  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0805  LacI family transcription regulator  35.71 
 
 		 351 aa  154  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  33.82 
 
 		 353 aa  154  2.9999999999999998e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  31.19 
 
 		 341 aa  153  5e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4415  transcriptional regulator, LacI family  34.11 
 
 		 342 aa  152  8.999999999999999e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0297  LacI family transcription regulator  32.1 
 
 		 340 aa  151  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3985  transcriptional regulator, LacI family  32.37 
 
 		 338 aa  151  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.610149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  33.04 
 
 		 342 aa  150  3e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0283  LacI family transcriptional regulator  32.96 
 
 		 342 aa  150  3e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.881799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0948  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.24 
 
 		 337 aa  150  3e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.849116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0698  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  29.67 
 
 		 330 aa  150  4e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0768  LacI family transcription regulator  32.29 
 
 		 332 aa  150  4e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0915061  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0416  LacI family transcription regulator  32.21 
 
 		 349 aa  150  4e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.339437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0920  LacI family transcription regulator  31.36 
 
 		 351 aa  150  5e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.830745  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0819  transcriptional regulator, LacI family  33.33 
 
 		 348 aa  149  6e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04075  galactose operon repressor  30.84 
 
 		 333 aa  149  6e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15580  transcriptional regulator, LacI family  31.27 
 
 		 336 aa  149  8e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  30.29 
 
 		 332 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2311  transcriptional regulator, LacI family  33.01 
 
 		 335 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000106518  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  29.31 
 
 		 386 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2320  LacI family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 340 aa  147  3e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.316441  normal  0.202359 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0415  LacI family transcription regulator  32.16 
 
 		 335 aa  147  4.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.280412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2250  DNA-binding transcriptional regulator CytR  33.63 
 
 		 335 aa  147  4.0000000000000006e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4116  alanine racemase  32.95 
 
 		 334 aa  146  6e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2733  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  28.22 
 
 		 331 aa  146  6e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1825  transcriptional regulator, LacI family  36.31 
 
 		 346 aa  146  7.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.319362  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>