More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3985 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3985  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 338 aa  659    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.610149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2790  LacI family transcription regulator  80.76 
 
 		 348 aa  526  1e-148  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0549  Alanine racemase  68.05 
 
 		 340 aa  401  9.999999999999999e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2046  LacI family transcription regulator  54.98 
 
 		 344 aa  360  2e-98  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2320  LacI family transcriptional regulator  54.82 
 
 		 340 aa  356  2.9999999999999997e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.316441  normal  0.202359 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1620  LacI family transcription regulator  56.76 
 
 		 337 aa  349  4e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6831  LacI family transcription regulator  56.23 
 
 		 337 aa  348  9e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1824  transcriptional regulator, LacI family  55.93 
 
 		 347 aa  338  7e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.021809  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3319  transcriptional regulator, LacI family  53.05 
 
 		 337 aa  314  1.9999999999999998e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.419074  normal  0.0675752 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2344  transcriptional regulator, LacI family  53.73 
 
 		 349 aa  305  6e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.684667  normal  0.408649 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0366  transcriptional regulator, LacI family  50.15 
 
 		 344 aa  303  4.0000000000000003e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23440  transcriptional regulator, LacI family  51.04 
 
 		 350 aa  302  5.000000000000001e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.769589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2659  transcriptional regulator, LacI family  47.43 
 
 		 339 aa  280  2e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.34431  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3001  transcriptional regulator, LacI family  49.4 
 
 		 343 aa  279  4e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33130  transcriptional regulator, LacI family  50.3 
 
 		 361 aa  278  1e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.260263  normal  0.79569 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3482  Alanine racemase  50.46 
 
 		 359 aa  277  2e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0777863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1983  transcriptional regulator, LacI family  50.75 
 
 		 345 aa  276  4e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.597613  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0461  transcriptional regulator, LacI family  46.58 
 
 		 353 aa  269  4e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.686839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3338  transcriptional regulator, LacI family  49.55 
 
 		 341 aa  261  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.680798  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1825  transcriptional regulator, LacI family  51.66 
 
 		 346 aa  258  1e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.319362  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4877  transcriptional regulator, LacI family  50.76 
 
 		 346 aa  256  3e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00304627  normal  0.857214 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0971  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  45.61 
 
 		 350 aa  253  2.0000000000000002e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0355372 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0193  transcriptional regulator, LacI family  45.97 
 
 		 340 aa  248  1e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0091  LacI family transcription regulator  42.56 
 
 		 346 aa  246  4.9999999999999997e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0181  transcriptional regulator, LacI family  45.61 
 
 		 341 aa  242  7e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000844091 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1873  LacI family response repressor  40.37 
 
 		 368 aa  241  9e-63  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.845568  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01670  transcriptional regulator  41.27 
 
 		 348 aa  234  1.0000000000000001e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3252  transcriptional regulator, LacI family  43.62 
 
 		 351 aa  234  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0819  transcriptional regulator, LacI family  43.99 
 
 		 348 aa  231  1e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  43.45 
 
 		 353 aa  226  6e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  40.42 
 
 		 368 aa  224  1e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30450  transcriptional regulator  47 
 
 		 349 aa  224  2e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.158752  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0069  transcriptional regulator, LacI family  42.64 
 
 		 342 aa  223  4e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4933  transcriptional regulator, LacI family  45.15 
 
 		 339 aa  223  4e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0794709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  40.59 
 
 		 339 aa  223  4.9999999999999996e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0502  transcriptional regulator, LacI family  43.16 
 
 		 344 aa  215  9e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0979375 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3470  transcriptional regulator, LacI family  45.83 
 
 		 331 aa  213  2.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0116  DNA-binding transcriptional regulator CytR  38.14 
 
 		 356 aa  209  5e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3586  transcriptional regulator, LacI family  41.54 
 
 		 333 aa  209  7e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.983736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  35.4 
 
 		 341 aa  207  2e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0113  transcriptional regulator, LacI family  40.18 
 
 		 350 aa  206  6e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0512  LacI family transcription regulator  40.71 
 
 		 336 aa  204  1e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  33.23 
 
 		 335 aa  203  3e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4101  DNA-binding transcriptional regulator CytR  35.63 
 
 		 342 aa  202  5e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0115  DNA-binding transcriptional regulator CytR  35.63 
 
 		 342 aa  202  5e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  38.6 
 
 		 337 aa  202  7e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  36.97 
 
 		 348 aa  202  9.999999999999999e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.23 
 
 		 336 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00726  DNA-binding transcriptional regulator CytR  35.14 
 
 		 335 aa  201  9.999999999999999e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0182  DNA-binding transcriptional regulator CytR  35.74 
 
 		 347 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3623  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  39.53 
 
 		 335 aa  200  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.487296  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4813  catabolite control protein A  35.05 
 
 		 332 aa  200  3e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.94 
 
 		 339 aa  200  3e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4811  catabolite control protein A  35.05 
 
 		 332 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4427  catabolite control protein A  35.05 
 
 		 332 aa  199  5e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2733  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  34.24 
 
 		 331 aa  199  5e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4410  catabolite control protein A  34.74 
 
 		 332 aa  199  6e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4795  catabolite control protein A  34.74 
 
 		 332 aa  199  6e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0168  DNA-binding transcriptional regulator CytR  35.74 
 
 		 347 aa  199  7e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4575  catabolite control protein A  34.74 
 
 		 332 aa  198  9e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4929  catabolite control protein A  34.74 
 
 		 332 aa  198  9e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1769  LacI family transcription regulator  35.93 
 
 		 339 aa  198  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4790  catabolite control protein A  34.74 
 
 		 332 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001746  transcriptional (co)regulator CytR  34.64 
 
 		 335 aa  197  2.0000000000000003e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3795  DNA-binding transcriptional regulator CytR  36.83 
 
 		 356 aa  197  3e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0402  transcriptional regulator, LacI family  34.22 
 
 		 339 aa  196  5.000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000159796  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4506  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  34.14 
 
 		 332 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0449  catabolite control protein A  34.44 
 
 		 332 aa  195  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4415  transcriptional regulator, LacI family  40.41 
 
 		 342 aa  194  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2250  DNA-binding transcriptional regulator CytR  34.94 
 
 		 335 aa  195  1e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3342  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  34.14 
 
 		 332 aa  194  1e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  33.72 
 
 		 386 aa  194  2e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1329  transcriptional regulator, LacI family  39.82 
 
 		 341 aa  194  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.315575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.54 
 
 		 330 aa  194  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4790  DNA-binding transcriptional regulator CytR  34.73 
 
 		 342 aa  193  3e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120208 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0283  LacI family transcriptional regulator  41.87 
 
 		 342 aa  192  6e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.881799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3272  LacI family transcription regulator  35.24 
 
 		 352 aa  191  1e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2273  LacI family transcription regulator  37.72 
 
 		 333 aa  191  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0311079  hitchhiker  0.000018406 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  33.93 
 
 		 342 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0282  LacI family transcriptional regulator  39.35 
 
 		 342 aa  190  4e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.727359 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0520  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.12 
 
 		 338 aa  189  4e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  hitchhiker  0.0000174135 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1125  transcriptional regulator, LacI family  39.7 
 
 		 341 aa  189  5.999999999999999e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107829 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0907  LacI family transcription regulator  38.51 
 
 		 341 aa  189  5.999999999999999e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2742  DNA-binding transcriptional regulator CytR  33.63 
 
 		 335 aa  189  7e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11530  transcriptional regulator, LacI family  37.91 
 
 		 331 aa  188  1e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00809623 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0698  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  34.35 
 
 		 330 aa  187  3e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03819  DNA-binding transcriptional dual regulator  34.34 
 
 		 341 aa  186  7e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4051  transcriptional regulator, LacI family  34.34 
 
 		 341 aa  186  7e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03768  hypothetical protein  34.34 
 
 		 341 aa  186  7e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4084  DNA-binding transcriptional regulator CytR  34.34 
 
 		 341 aa  186  7e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4376  DNA-binding transcriptional regulator CytR  34.34 
 
 		 341 aa  186  7e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.76111 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4470  DNA-binding transcriptional regulator CytR  34.34 
 
 		 341 aa  186  7e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4416  DNA-binding transcriptional regulator CytR  34.34 
 
 		 343 aa  185  8e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.506908  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4166  DNA-binding transcriptional regulator CytR  34.34 
 
 		 343 aa  185  8e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0186  transcriptional regulator, LacI family  40.76 
 
 		 330 aa  185  9e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.319705  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5391  DNA-binding transcriptional regulator CytR  34.45 
 
 		 330 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.504328  normal  0.696689 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  33.03 
 
 		 347 aa  184  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2467  LacI family transcription regulator  36.83 
 
 		 336 aa  184  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4426  DNA-binding transcriptional regulator CytR  34.44 
 
 		 341 aa  183  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0559  transcriptional regulator, LacI family  40.24 
 
 		 337 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>