More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3623 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3623  LacI family transcription regulator  100 
 
 		 350 aa  712    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.039372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0920  LacI family transcription regulator  51.7 
 
 		 351 aa  332  4e-90  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.830745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1609  LacI family transcription regulator  49.15 
 
 		 356 aa  331  1e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3555  LacI family transcription regulator  47.81 
 
 		 352 aa  296  5e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1442  LacI family transcription regulator  42.32 
 
 		 341 aa  235  7e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3841  transcriptional regulator, LacI family  39.07 
 
 		 346 aa  206  4e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.455211 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4918  transcriptional regulator, LacI family  39.07 
 
 		 346 aa  206  4e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2445  LacI family transcription regulator  38.51 
 
 		 337 aa  206  6e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.609487  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02195  transcription regulator transcription regulator protein  37.64 
 
 		 355 aa  204  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.479594  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2371  LacI family transcription regulator  36.06 
 
 		 337 aa  203  3e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0453022  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2141  LacI family transcription regulator  40 
 
 		 340 aa  201  9.999999999999999e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0418584  normal  0.0217452 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0276  LacI family transcription regulator  38.85 
 
 		 347 aa  197  2.0000000000000003e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0755  LacI family transcription regulator  40.37 
 
 		 357 aa  195  9e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1207  alanine racemase  33.9 
 
 		 339 aa  194  3e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1662  LacI family transcription regulator  36.21 
 
 		 337 aa  192  8e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1111  LacI family transcription regulator  33.14 
 
 		 339 aa  192  8e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0121938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1096  LacI family transcription regulator  34.81 
 
 		 338 aa  191  2e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2943  LacI family transcription regulator  33.72 
 
 		 338 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.318917 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3025  LacI family transcription regulator  33.72 
 
 		 338 aa  189  4e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.824077 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3122  LacI family transcription regulator  33.72 
 
 		 338 aa  190  4e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0274  alanine racemase  35.71 
 
 		 340 aa  189  5.999999999999999e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04322  transcriptional regulator LacI family  36.83 
 
 		 355 aa  189  8e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3221  transcriptional regulator, LacI family  34.2 
 
 		 338 aa  186  5e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1135  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.1 
 
 		 338 aa  186  5e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3423  transcriptional regulator, LacI family  36.57 
 
 		 366 aa  186  6e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0558625 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1304  LacI family transcription regulator  35.22 
 
 		 340 aa  185  9e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.812523 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1170  LacI family transcription regulator  34.1 
 
 		 338 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.353815 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0197  LacI family transcription regulator  36.42 
 
 		 340 aa  185  1.0000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3042  LacI family transcription regulator  33.14 
 
 		 342 aa  184  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000688276 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1071  regulatory protein, LacI  34.8 
 
 		 338 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0937  LacI family transcription regulator  34.81 
 
 		 337 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.266523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1073  regulatory protein, LacI  33.94 
 
 		 338 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3516  LacI family transcription regulator  32.27 
 
 		 338 aa  181  1e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2709  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.44 
 
 		 347 aa  181  1e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00648208  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  33.98 
 
 		 339 aa  176  5e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0245  LacI family transcription regulator  36.52 
 
 		 339 aa  174  1.9999999999999998e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.05929  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  34.99 
 
 		 353 aa  174  1.9999999999999998e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1019  LacI family transcription regulator  31.7 
 
 		 340 aa  173  2.9999999999999996e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3033  LacI family transcription regulator  33.33 
 
 		 351 aa  171  1e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  33.04 
 
 		 368 aa  168  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2718  LacI family transcription regulator  34.37 
 
 		 347 aa  168  1e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0935795  normal  0.0852564 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0717  LacI family transcription regulator  35.03 
 
 		 358 aa  168  2e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0907  LacI family transcription regulator  35.65 
 
 		 341 aa  167  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2320  LacI family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 340 aa  166  5e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.316441  normal  0.202359 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0806  LacI family transcription regulator  34.56 
 
 		 358 aa  166  5e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1728  LacI family transcription regulator  34.38 
 
 		 348 aa  166  6.9999999999999995e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.531296  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0282  LacI family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 342 aa  165  1.0000000000000001e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.727359 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2376  LacI family transcription regulator  32.07 
 
 		 339 aa  164  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0719999  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  30.9 
 
 		 335 aa  162  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0512  LacI family transcription regulator  34.2 
 
 		 336 aa  161  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3623  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.43 
 
 		 335 aa  162  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.487296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3995  LacI family transcription regulator  34.82 
 
 		 352 aa  161  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.917064 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0768  LacI family transcription regulator  34.11 
 
 		 332 aa  160  4e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0915061  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  34.29 
 
 		 353 aa  159  9e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1755  LacI family transcription regulator  32.57 
 
 		 360 aa  158  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.998653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2268  transcriptional regulator, LacI family  33.71 
 
 		 339 aa  156  5.0000000000000005e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.580288  hitchhiker  0.000512159 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0809  transcriptional regulator, LacI family  33.13 
 
 		 344 aa  156  6e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.119427 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6831  LacI family transcription regulator  35.13 
 
 		 337 aa  155  7e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03849  sal operon transcriptional repressor  34.52 
 
 		 336 aa  154  2e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4415  transcriptional regulator, LacI family  35.07 
 
 		 342 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2046  LacI family transcription regulator  35.55 
 
 		 344 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  33.53 
 
 		 337 aa  153  5e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0459  LacI family transcription regulator  31.45 
 
 		 340 aa  152  7e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0416  LacI family transcription regulator  32.68 
 
 		 349 aa  152  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.339437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  30.61 
 
 		 342 aa  151  2e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3513  LacI family transcription regulator  34.3 
 
 		 338 aa  151  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.98216  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0297  LacI family transcription regulator  31.05 
 
 		 340 aa  150  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.68 
 
 		 330 aa  150  3e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4310  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.03 
 
 		 341 aa  149  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4426  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.03 
 
 		 341 aa  149  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4340  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.03 
 
 		 341 aa  149  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.302828  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4424  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.03 
 
 		 341 aa  149  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4494  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.03 
 
 		 341 aa  149  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0415  LacI family transcription regulator  32.76 
 
 		 335 aa  149  7e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.280412  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1125  transcriptional regulator, LacI family  33.82 
 
 		 341 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107829 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0304  degradation activator  31.79 
 
 		 332 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  31.23 
 
 		 332 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01040  transcriptional regulator  32.08 
 
 		 336 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0945  LacI family transcription regulator  33.82 
 
 		 348 aa  147  3e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000657853  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03674  transcriptional regulator LacI family  32.7 
 
 		 342 aa  147  4.0000000000000006e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  31.18 
 
 		 331 aa  146  5e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  30.89 
 
 		 348 aa  146  5e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4790  DNA-binding transcriptional regulator CytR  30.95 
 
 		 342 aa  146  6e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120208 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4790  catabolite control protein A  28.53 
 
 		 332 aa  146  6e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3973  transcriptional repressor RbsR  30.43 
 
 		 338 aa  145  7.0000000000000006e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000131921  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2401  LacI family transcription regulator  35.37 
 
 		 318 aa  146  7.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0115  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.03 
 
 		 342 aa  145  8.000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0031  transcriptional regulator, LacI family  34.38 
 
 		 351 aa  145  8.000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.532737  hitchhiker  0.0000002992 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4101  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.03 
 
 		 342 aa  145  8.000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0168  DNA-binding transcriptional regulator CytR  29.91 
 
 		 347 aa  145  9e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  31.91 
 
 		 342 aa  145  1e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4233  transcriptional repressor RbsR  31.64 
 
 		 328 aa  145  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00129115  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4811  catabolite control protein A  28.53 
 
 		 332 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2691  LacI family transcription regulator  30.34 
 
 		 335 aa  144  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3272  LacI family transcription regulator  32.67 
 
 		 352 aa  144  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0229  LacI family transcription regulator  31.97 
 
 		 358 aa  144  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.720422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0449  catabolite control protein A  28.24 
 
 		 332 aa  144  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4628  transcriptional regulator, LacI family  33.33 
 
 		 332 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.656687 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4813  catabolite control protein A  28.53 
 
 		 332 aa  144  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2062  LacI family transcription regulator  33.63 
 
 		 348 aa  144  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0513684  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>