More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene pE33L466_0304 on replicon NC_007103
Organism: Bacillus cereus E33L



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007103  pE33L466_0304  degradation activator  100 
 
 
332 aa  681    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0296  degradation activator  65.55 
 
 
331 aa  456  1e-127  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2249  LacI family transcription regulator  47.75 
 
 
333 aa  330  2e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00326004  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2330  transcriptional regulator  47.75 
 
 
333 aa  330  3e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0241905  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2293  LacI family transcription regulator  47.75 
 
 
333 aa  330  3e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119214  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2509  transcriptional regulator  47.75 
 
 
333 aa  330  3e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2524  transcriptional regulator/sugar-binding domain, LacI family  47.75 
 
 
333 aa  330  3e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000304303 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0297  degradation activator  46.85 
 
 
334 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0303599  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  41.69 
 
 
335 aa  268  1e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  40.72 
 
 
336 aa  257  2e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  40.96 
 
 
353 aa  257  2e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2699  transcriptional regulator, LacI family  39.04 
 
 
339 aa  256  4e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  39.14 
 
 
330 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1234  LacI family transcription regulator  39.82 
 
 
343 aa  248  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50127  normal  0.134178 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2154  LacI transcriptional regulator  39.94 
 
 
338 aa  246  4e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0306626  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  38.48 
 
 
340 aa  245  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2000  LacI family transcription regulator  38.25 
 
 
346 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.121919  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2022  ribose operon repressor RbsR  39.27 
 
 
343 aa  243  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.662423  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1857  ribose operon repressor RbsR  39.27 
 
 
343 aa  243  3e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1870  ribose operon repressor RbsR  39.27 
 
 
343 aa  243  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.585666  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  38.51 
 
 
347 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1922  LacI family transcription regulator  39.16 
 
 
339 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.704174  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1628  LacI family transcription regulator  38.3 
 
 
343 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2260  transcriptional regulator, LacI family  38.55 
 
 
346 aa  242  7e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.167374  normal  0.588495 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1525  LacI family transcription regulator  38.3 
 
 
343 aa  242  7e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420738  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1506  LacI family transcription regulator  38.3 
 
 
343 aa  242  7e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  36.89 
 
 
332 aa  241  9e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4748  LacI family transcription regulator  37.99 
 
 
343 aa  241  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1129  LacI family transcription regulator  37.99 
 
 
343 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1586  LacI family transcription regulator  37.99 
 
 
343 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122412  normal  0.650271 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1609  LacI family transcription regulator  37.99 
 
 
343 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0684889  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2370  ribose operon repressor  39.63 
 
 
338 aa  241  2e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  36.89 
 
 
348 aa  240  2e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2472  ribose operon repressor RbsR  38.97 
 
 
343 aa  240  2e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  38.18 
 
 
340 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  38.48 
 
 
340 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39300  ribose operon repressor RbsR  37.88 
 
 
337 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00488223  normal  0.347554 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  37.72 
 
 
346 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  37.43 
 
 
346 aa  239  5e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  38.18 
 
 
340 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0559  transcriptional regulator, LacI family  36.8 
 
 
337 aa  236  3e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  39.04 
 
 
332 aa  235  7e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3343  ribose operon repressor RbsR  36.67 
 
 
337 aa  233  3e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.142594  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09530  transcriptional regulator, LacI family  36.04 
 
 
340 aa  230  3e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00123183  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.93 
 
 
337 aa  230  3e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  38.51 
 
 
342 aa  229  4e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4639  transcriptional regulator, LacI family  37.88 
 
 
357 aa  228  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.496087  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3973  transcriptional repressor RbsR  35.26 
 
 
338 aa  227  2e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000131921  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1032  DNA-binding transcriptional repressor PurR  34.74 
 
 
333 aa  226  3e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.872659  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.26 
 
 
339 aa  226  4e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  35.76 
 
 
347 aa  225  8e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  36.86 
 
 
339 aa  223  3e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  37 
 
 
329 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2281  transcriptional regulator, LacI family  35.65 
 
 
334 aa  221  9.999999999999999e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0345  transcriptional regulator for D-ribose, periplasmic binding protein, LacI family protein  35.26 
 
 
334 aa  221  9.999999999999999e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  36.64 
 
 
342 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  35.26 
 
 
331 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3342  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  34.64 
 
 
332 aa  220  3e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3623  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  38.14 
 
 
335 aa  219  3.9999999999999997e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.487296  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4410  catabolite control protein A  33.73 
 
 
332 aa  219  5e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4795  catabolite control protein A  33.73 
 
 
332 aa  219  5e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4233  transcriptional repressor RbsR  34.77 
 
 
328 aa  219  5e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00129115  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4811  catabolite control protein A  34.04 
 
 
332 aa  219  6e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4813  catabolite control protein A  34.04 
 
 
332 aa  219  6e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0698  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  34.44 
 
 
330 aa  219  6e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0449  catabolite control protein A  34.04 
 
 
332 aa  219  6e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1983  HTH-type transcriptional repressor PurR (purine nucleotide synthesis repressor)  34.14 
 
 
333 aa  219  7e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  35.24 
 
 
337 aa  218  8.999999999999998e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4575  catabolite control protein A  33.73 
 
 
332 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4929  catabolite control protein A  33.73 
 
 
332 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4506  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  33.13 
 
 
332 aa  217  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4790  catabolite control protein A  33.73 
 
 
332 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4170  transcriptional repressor RbsR  35.44 
 
 
341 aa  216  4e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000181496  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0728  transcriptional regulator, LacI family  38.37 
 
 
337 aa  216  5e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.3979  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1870  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.44 
 
 
337 aa  216  5e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.796705  normal  0.714887 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  35.74 
 
 
333 aa  215  7e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4427  catabolite control protein A  33.13 
 
 
332 aa  215  9e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0226  LacI family transcription regulator  35.54 
 
 
336 aa  214  1.9999999999999998e-54  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1367  ribose operon repressor  33.23 
 
 
333 aa  214  1.9999999999999998e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.390962  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.36 
 
 
333 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4340  DNA-binding transcriptional regulator CytR  35.93 
 
 
341 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.302828  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4424  DNA-binding transcriptional regulator CytR  35.93 
 
 
341 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4426  DNA-binding transcriptional regulator CytR  35.93 
 
 
341 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20880  transcriptional regulator, LacI family  34.74 
 
 
343 aa  213  2.9999999999999995e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  34.36 
 
 
333 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4310  DNA-binding transcriptional regulator CytR  35.93 
 
 
341 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4494  DNA-binding transcriptional regulator CytR  35.93 
 
 
341 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1715  DNA-binding transcriptional repressor PurR  35.37 
 
 
341 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.117715  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0945  LacI family transcription regulator  35.58 
 
 
348 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000657853  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2733  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  32.63 
 
 
331 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0559  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  37.88 
 
 
323 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000011059  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0578  LacI family transcription regulator  36.67 
 
 
323 aa  211  1e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4642  ribose operon repressor  37.27 
 
 
323 aa  211  1e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.317022  unclonable  5.22733e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0631  ribose operon repressor  36.97 
 
 
323 aa  211  2e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0664  ribose operon repressor  36.97 
 
 
323 aa  211  2e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.566043  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0006  ribose operon repressor  32.33 
 
 
334 aa  210  2e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.038565  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1120  regulatory protein, LacI  36.83 
 
 
324 aa  211  2e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0919  LacI family transcription regulator  36.94 
 
 
327 aa  210  3e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0721  ribose operon repressor  36.67 
 
 
323 aa  209  4e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.40772e-23 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0520  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.45 
 
 
338 aa  209  6e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  hitchhiker  0.0000174135 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>