More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1825 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1825  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 346 aa  657    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.319362  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2046  LacI family transcription regulator  56.52 
 
 		 344 aa  359  4e-98  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2320  LacI family transcriptional regulator  52.12 
 
 		 340 aa  318  7e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.316441  normal  0.202359 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2344  transcriptional regulator, LacI family  51.75 
 
 		 349 aa  302  5.000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.684667  normal  0.408649 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23440  transcriptional regulator, LacI family  52.02 
 
 		 350 aa  299  5e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.769589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1824  transcriptional regulator, LacI family  51.16 
 
 		 347 aa  298  7e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.021809  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3319  transcriptional regulator, LacI family  51.74 
 
 		 337 aa  293  2e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.419074  normal  0.0675752 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6831  LacI family transcription regulator  51.76 
 
 		 337 aa  293  4e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33130  transcriptional regulator, LacI family  49.71 
 
 		 361 aa  290  3e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.260263  normal  0.79569 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2790  LacI family transcription regulator  51.16 
 
 		 348 aa  288  7e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0366  transcriptional regulator, LacI family  51.45 
 
 		 344 aa  286  4e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1983  transcriptional regulator, LacI family  49.56 
 
 		 345 aa  285  1.0000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.597613  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3482  Alanine racemase  54.86 
 
 		 359 aa  283  3.0000000000000004e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0777863  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3001  transcriptional regulator, LacI family  48.68 
 
 		 343 aa  282  6.000000000000001e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0549  Alanine racemase  52.89 
 
 		 340 aa  281  1e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0181  transcriptional regulator, LacI family  48.83 
 
 		 341 aa  276  3e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000844091 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0971  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  50.43 
 
 		 350 aa  275  1.0000000000000001e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0355372 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3985  transcriptional regulator, LacI family  51.31 
 
 		 338 aa  267  2e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.610149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2659  transcriptional regulator, LacI family  46.88 
 
 		 339 aa  267  2e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.34431  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1620  LacI family transcription regulator  47.4 
 
 		 337 aa  261  8.999999999999999e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0461  transcriptional regulator, LacI family  45.35 
 
 		 353 aa  258  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.686839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0091  LacI family transcription regulator  46.97 
 
 		 346 aa  255  7e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0819  transcriptional regulator, LacI family  48.12 
 
 		 348 aa  246  4e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3338  transcriptional regulator, LacI family  49.43 
 
 		 341 aa  244  1.9999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.680798  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1873  LacI family response repressor  41.26 
 
 		 368 aa  243  5e-63  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.845568  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0193  transcriptional regulator, LacI family  46.36 
 
 		 340 aa  236  5.0000000000000005e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4877  transcriptional regulator, LacI family  45.86 
 
 		 346 aa  232  8.000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00304627  normal  0.857214 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3252  transcriptional regulator, LacI family  43.23 
 
 		 351 aa  223  3e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0069  transcriptional regulator, LacI family  46.44 
 
 		 342 aa  221  9.999999999999999e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4933  transcriptional regulator, LacI family  44.19 
 
 		 339 aa  213  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0794709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0113  transcriptional regulator, LacI family  44.44 
 
 		 350 aa  210  3e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11530  transcriptional regulator, LacI family  40.46 
 
 		 331 aa  209  7e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00809623 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01670  transcriptional regulator  39.6 
 
 		 348 aa  201  1.9999999999999998e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  40.23 
 
 		 353 aa  200  3.9999999999999996e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1125  transcriptional regulator, LacI family  41.62 
 
 		 341 aa  197  3e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107829 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  39.88 
 
 		 339 aa  195  8.000000000000001e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1769  LacI family transcription regulator  34.78 
 
 		 339 aa  186  6e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2403  transcriptional regulator, LacI family  40.23 
 
 		 379 aa  185  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00011763  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  35.84 
 
 		 348 aa  184  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  36.13 
 
 		 368 aa  184  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0502  transcriptional regulator, LacI family  40.34 
 
 		 344 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0979375 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2250  DNA-binding transcriptional regulator CytR  35.21 
 
 		 335 aa  183  3e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.88 
 
 		 336 aa  183  3e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30450  transcriptional regulator  44.11 
 
 		 349 aa  183  5.0000000000000004e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.158752  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0297  LacI family transcription regulator  34.97 
 
 		 340 aa  182  8.000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4415  transcriptional regulator, LacI family  40.8 
 
 		 342 aa  182  8.000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0512  LacI family transcription regulator  37.75 
 
 		 336 aa  182  8.000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3715  transcriptional regulator, LacI family  41.53 
 
 		 341 aa  181  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.335783  hitchhiker  0.00243488 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3623  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.78 
 
 		 335 aa  181  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.487296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  39.94 
 
 		 353 aa  180  4e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.03 
 
 		 339 aa  179  4e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1329  transcriptional regulator, LacI family  39.36 
 
 		 341 aa  179  5.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.315575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3470  transcriptional regulator, LacI family  40.96 
 
 		 331 aa  178  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  35.31 
 
 		 337 aa  178  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001746  transcriptional (co)regulator CytR  33.33 
 
 		 335 aa  178  1e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3586  transcriptional regulator, LacI family  40.35 
 
 		 333 aa  178  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.983736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.84 
 
 		 330 aa  177  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  32.75 
 
 		 341 aa  177  2e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0186  transcriptional regulator, LacI family  38.9 
 
 		 330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.319705  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00726  DNA-binding transcriptional regulator CytR  33.33 
 
 		 335 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4416  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.76 
 
 		 343 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.506908  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4166  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.76 
 
 		 343 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  30.75 
 
 		 335 aa  173  3.9999999999999995e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0907  LacI family transcription regulator  38.08 
 
 		 341 aa  173  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03819  DNA-binding transcriptional dual regulator  32.76 
 
 		 341 aa  173  5e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4051  transcriptional regulator, LacI family  32.76 
 
 		 341 aa  173  5e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4084  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.76 
 
 		 341 aa  173  5e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03768  hypothetical protein  32.76 
 
 		 341 aa  173  5e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4470  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.76 
 
 		 341 aa  173  5e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4376  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.76 
 
 		 341 aa  173  5e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.76111 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2311  transcriptional regulator, LacI family  28.53 
 
 		 335 aa  172  6.999999999999999e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000106518  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2720  transcriptional regulator, LacI family  37.5 
 
 		 337 aa  172  9e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.687845  normal  0.476409 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  31.61 
 
 		 386 aa  170  4e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0559  transcriptional regulator, LacI family  40.12 
 
 		 337 aa  170  4e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5391  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.37 
 
 		 330 aa  170  4e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.504328  normal  0.696689 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2742  DNA-binding transcriptional regulator CytR  30.99 
 
 		 335 aa  169  5e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0402  transcriptional regulator, LacI family  31.65 
 
 		 339 aa  169  6e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000159796  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2511  transcriptional regulator, LacI family  37.97 
 
 		 334 aa  169  6e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.155489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  32.49 
 
 		 347 aa  169  8e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3272  LacI family transcription regulator  35.36 
 
 		 352 aa  168  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4424  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.59 
 
 		 341 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4340  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.59 
 
 		 341 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.302828  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4310  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.59 
 
 		 341 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4426  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.59 
 
 		 341 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4494  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.59 
 
 		 341 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0717  LacI family transcription regulator  36.87 
 
 		 358 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1486  transcriptional regulator, LacI family  35.38 
 
 		 334 aa  166  5e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.479144 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0806  LacI family transcription regulator  36.31 
 
 		 358 aa  166  8e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0524  alanine racemase  38.31 
 
 		 339 aa  165  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0938  LacI family transcription regulator  36.6 
 
 		 340 aa  163  3e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0104625  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  30.84 
 
 		 342 aa  162  7e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4896  transcriptional repressor RbsR  32.48 
 
 		 333 aa  162  9e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000156613  hitchhiker  0.000000782419 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  30.88 
 
 		 342 aa  162  9e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2073  transcriptional regulator, LacI family  37.46 
 
 		 336 aa  161  1e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000787477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04322  transcriptional regulator LacI family  34.67 
 
 		 355 aa  162  1e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0283  LacI family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 342 aa  161  1e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.881799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  32.37 
 
 		 329 aa  161  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2691  LacI family transcription regulator  32.49 
 
 		 335 aa  161  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3423  transcriptional regulator, LacI family  34.93 
 
 		 366 aa  161  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0558625 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2858  LacI family transcription regulator  36.1 
 
 		 343 aa  160  3e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.640321  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>