More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2074 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2074  LacI family transcription regulator  100 
 
 		 337 aa  667    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.243502  normal  0.538933 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2401  LacI family transcription regulator  60.82 
 
 		 318 aa  345  8.999999999999999e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3995  LacI family transcription regulator  45.94 
 
 		 352 aa  263  3e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.917064 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03849  sal operon transcriptional repressor  47.38 
 
 		 336 aa  257  2e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0755  LacI family transcription regulator  44.24 
 
 		 357 aa  253  3e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0276  LacI family transcription regulator  44.48 
 
 		 347 aa  227  2e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0197  LacI family transcription regulator  40 
 
 		 340 aa  205  1e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2445  LacI family transcription regulator  38.72 
 
 		 337 aa  202  5e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.609487  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1662  LacI family transcription regulator  38.08 
 
 		 337 aa  202  7e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0274  alanine racemase  38.51 
 
 		 340 aa  199  6e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2141  LacI family transcription regulator  36.28 
 
 		 340 aa  193  3e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0418584  normal  0.0217452 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1442  LacI family transcription regulator  40.94 
 
 		 341 aa  194  3e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3841  transcriptional regulator, LacI family  35.67 
 
 		 346 aa  190  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.455211 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4918  transcriptional regulator, LacI family  35.67 
 
 		 346 aa  190  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02195  transcription regulator transcription regulator protein  36 
 
 		 355 aa  187  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.479594  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1019  LacI family transcription regulator  33.64 
 
 		 340 aa  184  2.0000000000000003e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2371  LacI family transcription regulator  33.44 
 
 		 337 aa  184  2.0000000000000003e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0453022  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2376  LacI family transcription regulator  34.47 
 
 		 339 aa  178  1e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0719999  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0245  LacI family transcription regulator  37.89 
 
 		 339 aa  178  1e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.05929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  34.04 
 
 		 342 aa  177  3e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1096  LacI family transcription regulator  32.52 
 
 		 338 aa  176  7e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2943  LacI family transcription regulator  33.78 
 
 		 338 aa  175  8e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.318917 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1755  LacI family transcription regulator  36.17 
 
 		 360 aa  175  9e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.998653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3122  LacI family transcription regulator  33.78 
 
 		 338 aa  175  9e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3516  LacI family transcription regulator  33.78 
 
 		 338 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3025  LacI family transcription regulator  33.78 
 
 		 338 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.824077 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0937  LacI family transcription regulator  33.56 
 
 		 337 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.266523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3221  transcriptional regulator, LacI family  32.62 
 
 		 338 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1170  LacI family transcription regulator  32.62 
 
 		 338 aa  171  1e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.353815 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1071  regulatory protein, LacI  33.9 
 
 		 338 aa  171  1e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1207  alanine racemase  32.99 
 
 		 339 aa  171  2e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1073  regulatory protein, LacI  34.25 
 
 		 338 aa  171  2e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1135  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.62 
 
 		 338 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3513  LacI family transcription regulator  36.21 
 
 		 338 aa  170  3e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.98216  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3042  LacI family transcription regulator  34.9 
 
 		 342 aa  169  8e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000688276 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2709  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.22 
 
 		 347 aa  168  1e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00648208  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3423  transcriptional regulator, LacI family  36.12 
 
 		 366 aa  168  1e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0558625 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3033  LacI family transcription regulator  36.86 
 
 		 351 aa  167  2e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4790  catabolite control protein A  33.12 
 
 		 332 aa  166  5e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1304  LacI family transcription regulator  32.44 
 
 		 340 aa  165  8e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.812523 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4506  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  33.02 
 
 		 332 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0449  catabolite control protein A  32.81 
 
 		 332 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04322  transcriptional regulator LacI family  35.08 
 
 		 355 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4813  catabolite control protein A  33.02 
 
 		 332 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4811  catabolite control protein A  33.12 
 
 		 332 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4410  catabolite control protein A  32.81 
 
 		 332 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4427  catabolite control protein A  32.92 
 
 		 332 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4795  catabolite control protein A  32.81 
 
 		 332 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4575  catabolite control protein A  32.81 
 
 		 332 aa  162  6e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4929  catabolite control protein A  32.81 
 
 		 332 aa  162  6e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.89 
 
 		 330 aa  162  6e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3342  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  32.81 
 
 		 332 aa  161  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1111  LacI family transcription regulator  30.56 
 
 		 339 aa  160  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0121938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3623  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.91 
 
 		 335 aa  160  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.487296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0512  LacI family transcription regulator  34.76 
 
 		 336 aa  160  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.81 
 
 		 339 aa  158  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  34.15 
 
 		 353 aa  157  3e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1728  LacI family transcription regulator  35.38 
 
 		 348 aa  157  3e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.531296  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2718  LacI family transcription regulator  35.58 
 
 		 347 aa  157  3e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0935795  normal  0.0852564 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  35.69 
 
 		 339 aa  155  7e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3555  LacI family transcription regulator  36.04 
 
 		 352 aa  153  4e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0698  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  35.31 
 
 		 330 aa  151  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2062  LacI family transcription regulator  33.23 
 
 		 348 aa  150  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0513684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01670  transcriptional regulator  36.12 
 
 		 348 aa  151  2e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0283  LacI family transcriptional regulator  37.46 
 
 		 342 aa  150  3e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.881799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0282  LacI family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 342 aa  149  5e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.727359 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  34.53 
 
 		 346 aa  149  5e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0229  LacI family transcription regulator  32.1 
 
 		 358 aa  149  9e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.720422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  31.06 
 
 		 342 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03674  transcriptional regulator LacI family  33.23 
 
 		 342 aa  148  1.0000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  35.79 
 
 		 353 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  34.83 
 
 		 346 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0296  degradation activator  30.5 
 
 		 331 aa  147  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  33.96 
 
 		 340 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  29.97 
 
 		 332 aa  146  5e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20880  transcriptional regulator, LacI family  30.72 
 
 		 343 aa  146  6e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0717  LacI family transcription regulator  33.23 
 
 		 358 aa  145  7.0000000000000006e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0506  LacI family transcription regulator  31.86 
 
 		 332 aa  145  7.0000000000000006e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.549777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  33.91 
 
 		 337 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2733  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  31.86 
 
 		 331 aa  145  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  35.57 
 
 		 348 aa  145  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0806  LacI family transcription regulator  32.53 
 
 		 358 aa  144  2e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4116  alanine racemase  33.64 
 
 		 334 aa  143  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3973  transcriptional repressor RbsR  32.45 
 
 		 338 aa  142  5e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000131921  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23440  transcriptional regulator, LacI family  35.44 
 
 		 350 aa  143  5e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.769589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  27.99 
 
 		 335 aa  143  5e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.48 
 
 		 336 aa  143  5e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0031  transcriptional regulator, LacI family  34.27 
 
 		 351 aa  143  5e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.532737  hitchhiker  0.0000002992 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4896  transcriptional repressor RbsR  32.09 
 
 		 333 aa  142  6e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000156613  hitchhiker  0.000000782419 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  31.06 
 
 		 368 aa  142  8e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0008  transcriptional regulator, LacI family  29.9 
 
 		 337 aa  141  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4573  LacI family transcription regulator  33.23 
 
 		 326 aa  142  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0936264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0520  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.02 
 
 		 338 aa  141  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  hitchhiker  0.0000174135 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15580  transcriptional regulator, LacI family  30.03 
 
 		 336 aa  142  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2370  ribose operon repressor  33.54 
 
 		 338 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0938  LacI family transcription regulator  37.75 
 
 		 340 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0104625  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1922  LacI family transcription regulator  32.92 
 
 		 339 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.704174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0920  LacI family transcription regulator  32.43 
 
 		 351 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.830745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1609  LacI family transcription regulator  34.82 
 
 		 356 aa  140  3e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3965  transcriptional regulator AscG  30.95 
 
 		 350 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>