More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1869 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1869  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 393 aa  828    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.713108 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0064  transcriptional regulator, AraC family  58.44 
 
 		 409 aa  487  1e-136  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0102  AraC family transcriptional regulator  56.52 
 
 		 392 aa  486  1e-136  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0060  AraC family transcriptional regulator  55.53 
 
 		 397 aa  483  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4098  xylose operon regulatory protein  55.53 
 
 		 397 aa  483  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4155  xylose operon regulatory protein  55.53 
 
 		 397 aa  483  1e-135  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.664411  normal  0.0516528 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4432  transcriptional regulator, AraC family  57.4 
 
 		 392 aa  480  1e-134  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3724  AraC family transcriptional regulator  55.99 
 
 		 390 aa  477  1e-133  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4151  transcriptional regulator, AraC family  57.14 
 
 		 392 aa  477  1e-133  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0152  AraC family transcriptional regulator  54.95 
 
 		 392 aa  471  1.0000000000000001e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03421  DNA-binding transcriptional activator, xylose-binding  54.69 
 
 		 392 aa  465  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.684991  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0141  transcriptional regulator, AraC family  54.69 
 
 		 392 aa  465  9.999999999999999e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3772  xylose operon regulatory protein  54.69 
 
 		 392 aa  465  9.999999999999999e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0145  AraC family transcriptional regulator  54.69 
 
 		 392 aa  465  9.999999999999999e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3953  xylose operon regulatory protein  54.69 
 
 		 392 aa  465  9.999999999999999e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4945  xylose operon regulatory protein  54.69 
 
 		 392 aa  465  9.999999999999999e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.462654  normal  0.028978 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3892  xylose operon regulatory protein  54.69 
 
 		 392 aa  465  9.999999999999999e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03372  hypothetical protein  54.69 
 
 		 392 aa  465  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.716193  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4065  xylose operon regulatory protein  54.69 
 
 		 392 aa  465  9.999999999999999e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0082  transcriptional regulator, AraC family  55.32 
 
 		 395 aa  456  1e-127  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.719713  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4045  xylose operon regulatory protein  53.65 
 
 		 392 aa  451  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.654241  normal  0.387961 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3859  xylose operon regulatory protein  53.65 
 
 		 392 aa  451  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.897217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3985  xylose operon regulatory protein  53.65 
 
 		 392 aa  451  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3876  xylose operon regulatory protein  53.65 
 
 		 392 aa  451  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3940  xylose operon regulatory protein  53.65 
 
 		 392 aa  451  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.688005 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0794  AraC family transcriptional regulator  52.62 
 
 		 387 aa  436  1e-121  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2343  AraC family transcriptional regulator  49.35 
 
 		 414 aa  396  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.152678 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3001  xylose operon regluatory protein  47.76 
 
 		 395 aa  385  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.282498  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2882  helix-turn-helix, AraC type:periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  47.63 
 
 		 399 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.677365  normal  0.592102 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2304  AraC family transcriptional regulator  47.4 
 
 		 391 aa  387  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0753369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2337  xylose operon regluatory protein  48.68 
 
 		 397 aa  378  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.247833  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4206  AraC family transcriptional regulator  48.16 
 
 		 397 aa  378  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4073  transcriptional regulator, AraC family  47.66 
 
 		 407 aa  374  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6507  AraC family transcriptional regulator  47.63 
 
 		 397 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4185  transcriptional regulator, AraC family  47.66 
 
 		 407 aa  374  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0750406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6330  AraC family transcriptional regulator  47.89 
 
 		 397 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.768767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6741  AraC family transcriptional regulator  47.63 
 
 		 397 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.15092  normal  0.533175 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2623  AraC family transcriptional regulator  47.33 
 
 		 405 aa  371  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.242365 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6634  transcriptional regulator, AraC family  47.53 
 
 		 405 aa  370  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.903716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6331  AraC family transcriptional regulator  47.89 
 
 		 397 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6031  AraC family transcriptional regulator  48.16 
 
 		 397 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0774  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  34.77 
 
 		 384 aa  238  2e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0800  transcriptional regulator, AraC family  30.67 
 
 		 401 aa  205  1e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00315678 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0156  AraC family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 386 aa  204  3e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2801  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  31.61 
 
 		 386 aa  200  3e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.749326  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3765  AraC family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 385 aa  191  2e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0713818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4330  transcriptional regulator, AraC family  27.74 
 
 		 386 aa  171  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.547416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1793  AraC family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 445 aa  168  1e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6583  transcriptional regulator, AraC family  27.23 
 
 		 387 aa  167  2.9999999999999998e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2316  AraC family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 380 aa  166  5e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0587517  normal  0.0445967 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3906  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  27.06 
 
 		 409 aa  158  2e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3035  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  26.36 
 
 		 380 aa  154  2.9999999999999998e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3229  AraC family transcriptional regulator  28.53 
 
 		 411 aa  141  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.108494  normal  0.0104866 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0911  transcriptional regulator, LacI family  30.35 
 
 		 332 aa  82.8  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1736  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 333 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.409703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6737  AraC family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 251 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1093  AraC family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 331 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1120  regulatory protein, LacI  28.38 
 
 		 324 aa  69.3  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1725  transcriptional regulator, LacI family  25.9 
 
 		 338 aa  69.3  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8999  transcriptional regulator  26.92 
 
 		 361 aa  68.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.450526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.07 
 
 		 337 aa  67.8  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1375  AraC family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 305 aa  67.8  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0970899 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7403  AraC family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 316 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.708436 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6170  AraC family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 356 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08380  transcriptional regulator  30.23 
 
 		 351 aa  66.2  0.0000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.689367  normal  0.241125 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3734  AraC family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 345 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2245  LacI family transcription regulator  24.65 
 
 		 338 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.115687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4936  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 353 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.712836 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2480  AraC family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 354 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3868  AraC family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 330 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5527  AraC family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 363 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.658693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5149  transcriptional regulator, LacI family  28.45 
 
 		 346 aa  63.5  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5902  AraC family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 356 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.271322  normal  0.206192 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4476  AraC family transcriptional regulator  35 
 
 		 314 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.895104 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0816  transcriptional regulator, AraC family  27.03 
 
 		 327 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0765  AraC family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 279 aa  62.8  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.448457  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0749  lactose operon transcriptional activator  31.31 
 
 		 279 aa  62.8  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0693788  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  22.94 
 
 		 353 aa  62  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6251  transcriptional regulator, AraC family  34 
 
 		 331 aa  62  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3224  AraC family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 326 aa  62  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3262  AraC family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 326 aa  62  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1515  transcriptional regulator, LacI family  27.31 
 
 		 339 aa  61.6  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3276  AraC family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 348 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1350  AraC family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 349 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.956797  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9341  AraC-type DNA-binding domain-containing protein- like protein  32.71 
 
 		 309 aa  61.2  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.455721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6278  transcriptional regulator, LacI family  26.39 
 
 		 338 aa  61.2  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1739  transcriptional regulator  31.96 
 
 		 329 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.911829  normal  0.577621 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1790  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.87 
 
 		 337 aa  60.5  0.00000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00351385  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0559  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.51 
 
 		 323 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000011059  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1609  LacI family transcription regulator  24.14 
 
 		 356 aa  60.5  0.00000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0961  transcriptional regulator, LacI family  22.99 
 
 		 359 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  24.59 
 
 		 355 aa  60.1  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3723  AraC family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 372 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.497805  normal  0.164029 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3801  AraC family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 372 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.113275 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3737  AraC family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 348 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2281  transcriptional regulator, LacI family  32.89 
 
 		 334 aa  59.3  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2295  AraC family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 309 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.289815 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4562  AraC family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 360 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4610  transcriptional regulator, LacI family  29.35 
 
 		 351 aa  59.3  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1458  transcriptional regulator, AraC family  29.81 
 
 		 331 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>