More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2295 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2295  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
309 aa  627  1e-178  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.289815 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4562  AraC family transcriptional regulator  83.39 
 
 
360 aa  519  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3723  AraC family transcriptional regulator  83.39 
 
 
372 aa  520  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.497805  normal  0.164029 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3801  AraC family transcriptional regulator  83.39 
 
 
372 aa  520  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.113275 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5527  AraC family transcriptional regulator  82.65 
 
 
363 aa  486  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.658693  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4936  AraC family transcriptional regulator  75.34 
 
 
353 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.712836 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3224  AraC family transcriptional regulator  48.97 
 
 
326 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3276  AraC family transcriptional regulator  48.97 
 
 
348 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3262  AraC family transcriptional regulator  48.97 
 
 
326 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1350  AraC family transcriptional regulator  44.92 
 
 
349 aa  204  1e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.956797  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5902  AraC family transcriptional regulator  44.37 
 
 
356 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.271322  normal  0.206192 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6170  AraC family transcriptional regulator  44.19 
 
 
356 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7403  AraC family transcriptional regulator  43.05 
 
 
316 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.708436 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3868  AraC family transcriptional regulator  34.46 
 
 
330 aa  142  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0816  transcriptional regulator, AraC family  32.89 
 
 
327 aa  140  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1739  transcriptional regulator  34.32 
 
 
329 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.911829  normal  0.577621 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6251  transcriptional regulator, AraC family  49.64 
 
 
331 aa  136  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2476  AraC family transcriptional regulator  33.67 
 
 
333 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.336808 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1096  transcriptional regulator  47.48 
 
 
331 aa  132  9e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2800  AraC family transcriptional regulator  36.61 
 
 
333 aa  127  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6738  AraC family transcriptional regulator  32.11 
 
 
333 aa  125  9e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1458  transcriptional regulator, AraC family  43.71 
 
 
331 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3737  AraC family transcriptional regulator  33.9 
 
 
348 aa  124  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116286  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2983  transcriptional regulator  42.68 
 
 
331 aa  123  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00333809  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1093  AraC family transcriptional regulator  44.9 
 
 
331 aa  123  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1736  AraC family transcriptional regulator  43.54 
 
 
333 aa  120  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.409703  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2791  AraC family transcriptional regulator  35.14 
 
 
327 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1098  AraC family transcriptional regulator  33.45 
 
 
327 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6249  transcriptional regulator, AraC family  33.9 
 
 
356 aa  115  6e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6703  AraC family transcriptional regulator  37.97 
 
 
329 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6275  transcriptional regulator, AraC family  32.53 
 
 
330 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6256  transcriptional regulator, AraC family  51.46 
 
 
355 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6737  AraC family transcriptional regulator  50 
 
 
251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3734  AraC family transcriptional regulator  30.59 
 
 
345 aa  110  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252333  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2480  AraC family transcriptional regulator  31.33 
 
 
354 aa  110  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4476  AraC family transcriptional regulator  36.84 
 
 
314 aa  98.6  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.895104 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3266  AraC family transcriptional regulator  51.52 
 
 
332 aa  94.7  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5085  transcriptional regulator, AraC family  29.93 
 
 
358 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145128  normal  0.0831016 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0685  AraC family transcriptional regulator  36.31 
 
 
344 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.787747  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2455  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  35.85 
 
 
344 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0323  AraC family transcriptional regulator  35.85 
 
 
344 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0865  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  35.85 
 
 
344 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1023  AraC family transcription regulator  35.85 
 
 
345 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.243872  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4046  transcriptional regulator, AraC family  32.5 
 
 
327 aa  81.6  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.188489  normal  0.0112256 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0861  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  35.85 
 
 
344 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0069  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  35.85 
 
 
344 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0621  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  35.85 
 
 
344 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.627949  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5155  AraC family transcriptional regulator  27.42 
 
 
348 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2808  transcriptional regulator, AraC family  32.41 
 
 
330 aa  76.3  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.627946  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5267  AraC family transcriptional regulator  28.93 
 
 
320 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.589428 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1008  Fis family transcriptional regulator  32.69 
 
 
346 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.254492 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2502  transcriptional regulator, AraC family  26.5 
 
 
327 aa  73.9  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0431  transcriptional regulator, AraC family  30.43 
 
 
320 aa  74.3  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5245  AraC family transcriptional regulator  32.37 
 
 
328 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.608948  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4646  ThiJ/PfpI domain protein  28.3 
 
 
334 aa  72.8  0.000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1234  AraC family transcriptional regulator  31.37 
 
 
335 aa  72  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0513  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 
387 aa  72  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0227  AraC family transcriptional regulator  31.65 
 
 
324 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.583389 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4589  AraC family transcriptional regulator  30.72 
 
 
333 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1246  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
332 aa  70.9  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.481495  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57630  AraC family transcriptional regulator  28.67 
 
 
299 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.963773 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2640  AraC family transcriptional regulator  31.97 
 
 
329 aa  71.2  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708344  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1271  transcriptional regulator, AraC family  32.24 
 
 
317 aa  70.9  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607833  normal  0.171456 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1218  transcriptional regulator, AraC family  31.58 
 
 
323 aa  70.9  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6224  AraC family transcriptional regulator  32.73 
 
 
367 aa  70.1  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2415  AraC family transcriptional regulator  31.22 
 
 
345 aa  70.1  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3892  transcriptional regulator, AraC family  30.87 
 
 
332 aa  70.1  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.186679  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0972  AraC family transcriptional regulator  28.52 
 
 
336 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3549  transcriptional regulator, AraC family  29.68 
 
 
337 aa  69.7  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.757715  normal  0.622262 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3975  transcriptional regulator  28.57 
 
 
337 aa  69.7  0.00000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5008  putative transcriptional regulator  28 
 
 
332 aa  69.3  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250322  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2364  transcriptional regulator, AraC family  32.93 
 
 
322 aa  68.9  0.00000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000189765 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5399  transcriptional regulator  32.86 
 
 
321 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.654414  hitchhiker  0.00149287 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5829  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
338 aa  68.9  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0113  transcriptional regulator, AraC family  27.54 
 
 
354 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0747  AraC family transcriptional regulator  29.08 
 
 
321 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.46918  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1704  transcriptional regulator, AraC family  25.88 
 
 
362 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0761  AraC family transcriptional regulator  29.08 
 
 
321 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321335  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1836  transcriptional regulator  25.99 
 
 
327 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1355  transcriptional regulator, AraC family  32.65 
 
 
303 aa  68.2  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000118066  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4316  transcriptional regulator, AraC family  30.52 
 
 
320 aa  68.2  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0741  AraC family transcriptional regulator  28.9 
 
 
321 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.885746 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1034  transcriptional regulator, AraC family  27.15 
 
 
316 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0108866  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4747  AraC family transcriptional regulator  29.27 
 
 
320 aa  67.4  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000169446 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0897  transcriptional regulator  26 
 
 
335 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825741  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4725  AraC family transcriptional regulator  30.43 
 
 
332 aa  66.6  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1153  ThiJ/PfpI domain-containing protein  27.78 
 
 
338 aa  66.6  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.074608 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4748  transcriptional regulator  30.72 
 
 
326 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.760248  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5134  transcriptional regulator  30.72 
 
 
326 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.479216  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3631  transcriptional regulator, AraC family  31.33 
 
 
327 aa  66.6  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2631  transcriptional regulator  32.26 
 
 
347 aa  66.6  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0133443  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4834  transcriptional regulator  30.72 
 
 
326 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0125  transcriptional regulator  35.16 
 
 
325 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2104  transcriptional regulator, AraC family  34.12 
 
 
298 aa  66.2  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.244646 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1437  AraC family transcriptional regulator  29.41 
 
 
326 aa  66.6  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.424387 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0758  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 
299 aa  66.2  0.0000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0720  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
326 aa  66.2  0.0000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000016714 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6432  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 
332 aa  65.9  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1058  transcriptional regulator, AraC family  31.9 
 
 
322 aa  65.9  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.787566  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2747  transcriptional regulator  32.31 
 
 
338 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>