More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6738 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6738  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 333 aa  686    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2476  AraC family transcriptional regulator  59.88 
 
 		 333 aa  392  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.336808 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3868  AraC family transcriptional regulator  50 
 
 		 330 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0816  transcriptional regulator, AraC family  50.15 
 
 		 327 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1458  transcriptional regulator, AraC family  42.99 
 
 		 331 aa  233  3e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2983  transcriptional regulator  40.42 
 
 		 331 aa  228  9e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00333809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1096  transcriptional regulator  40.38 
 
 		 331 aa  221  9e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1739  transcriptional regulator  36.59 
 
 		 329 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.911829  normal  0.577621 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6275  transcriptional regulator, AraC family  40.8 
 
 		 330 aa  208  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6249  transcriptional regulator, AraC family  39.87 
 
 		 356 aa  205  9e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6251  transcriptional regulator, AraC family  37.97 
 
 		 331 aa  204  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2791  AraC family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 327 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2800  AraC family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 333 aa  197  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1736  AraC family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 333 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.409703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1098  AraC family transcriptional regulator  39.49 
 
 		 327 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1093  AraC family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 331 aa  190  4e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6703  AraC family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 329 aa  178  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2480  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 354 aa  170  4e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5902  AraC family transcriptional regulator  36.1 
 
 		 356 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.271322  normal  0.206192 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6170  AraC family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 356 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3224  AraC family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 326 aa  160  4e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3262  AraC family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 326 aa  160  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3276  AraC family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 348 aa  159  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7403  AraC family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 316 aa  159  9e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.708436 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3734  AraC family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 345 aa  157  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3737  AraC family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 348 aa  156  4e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1350  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 349 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.956797  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5527  AraC family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 363 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.658693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3266  AraC family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 332 aa  136  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3801  AraC family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 372 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.113275 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3723  AraC family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 372 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.497805  normal  0.164029 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4476  AraC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 314 aa  125  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.895104 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4562  AraC family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 360 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6256  transcriptional regulator, AraC family  30.33 
 
 		 355 aa  123  6e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4936  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 353 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.712836 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2295  AraC family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 309 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.289815 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6737  AraC family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 251 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0640  AraC family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 322 aa  93.2  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5985  transcriptional regulator  26.83 
 
 		 334 aa  91.3  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0571562 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0113  transcriptional regulator, AraC family  32.43 
 
 		 354 aa  89  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1153  ThiJ/PfpI domain-containing protein  25.51 
 
 		 338 aa  89  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.074608 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2686  AraC family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 324 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2046  AraC family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 324 aa  86.3  7e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2657  AraC family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 324 aa  86.3  7e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0449258  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1836  transcriptional regulator  23.62 
 
 		 327 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4246  AraC family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 319 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1312  transcriptional regulator, AraC family  25.9 
 
 		 338 aa  79.7  0.00000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00374343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2704  AraC family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 322 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.561895  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5246  transcriptional regulator, AraC family  31.13 
 
 		 331 aa  78.6  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.893549 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2808  transcriptional regulator, AraC family  31.33 
 
 		 330 aa  79  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.627946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0128  transcriptional regulator, AraC family  25.8 
 
 		 314 aa  78.2  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  24.03 
 
 		 338 aa  77.8  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2043  transcriptional regulator, AraC family  27.14 
 
 		 330 aa  76.6  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.437  normal  0.109712 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4716  transcriptional regulator, AraC family  29.61 
 
 		 341 aa  76.6  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1704  transcriptional regulator, AraC family  31.33 
 
 		 362 aa  75.9  0.0000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2605  transcriptional regulator  32.24 
 
 		 319 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548413  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5675  transcriptional regulator, AraC family  26.3 
 
 		 320 aa  75.5  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0125  transcriptional regulator, AraC family  35.71 
 
 		 300 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0513  AraC family transcriptional regulator  25.08 
 
 		 387 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2518  transcriptional regulator, AraC family  25.86 
 
 		 336 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.179818 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3892  transcriptional regulator, AraC family  32.65 
 
 		 332 aa  75.5  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.186679  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5085  transcriptional regulator, AraC family  25.17 
 
 		 358 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145128  normal  0.0831016 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4339  transcriptional regulator, AraC family  31.47 
 
 		 334 aa  74.3  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.400268 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3465  transcriptional regulator  24.51 
 
 		 341 aa  74.3  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0897  transcriptional regulator  26.97 
 
 		 335 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2578  AraC family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 322 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1958  response regulator receiver protein  30.25 
 
 		 530 aa  73.2  0.000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471781  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3465  transcriptional regulator, AraC family  31.17 
 
 		 327 aa  73.2  0.000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6279  AraC family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 338 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.147886  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5069  AraC family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 316 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3160  AraC family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 316 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5208  AraC family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 316 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0566116 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4046  transcriptional regulator, AraC family  38.04 
 
 		 327 aa  72.4  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.188489  normal  0.0112256 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2453  transcriptional regulator  32.69 
 
 		 339 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6224  AraC family transcriptional regulator  38 
 
 		 367 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6612  transcriptional regulator  26.95 
 
 		 341 aa  72  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1058  transcriptional regulator, AraC family  39 
 
 		 322 aa  72.4  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.787566  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0972  AraC family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 336 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6685  AraC family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 321 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal  0.261527 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5842  AraC family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 321 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.770334  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6209  AraC family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 321 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00677646 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5330  AraC family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 325 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0697804 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2212  AraC family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 302 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1034  transcriptional regulator, AraC family  25.81 
 
 		 316 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0108866  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4536  AraC family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 334 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3129  transcriptional regulator, AraC family  34.01 
 
 		 328 aa  70.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.554919  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1844  transcriptional regulator, AraC family  31.51 
 
 		 326 aa  70.9  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0923  AraC family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 331 aa  70.9  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3120  AraC family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 324 aa  70.9  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6979  transcriptional regulator, AraC family  24.11 
 
 		 319 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1165  AraC family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 278 aa  70.5  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1219  transcriptional regulator  32.43 
 
 		 329 aa  70.5  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4121  helix-turn-helix, AraC type  26.02 
 
 		 334 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1956  transcriptional regulator  24.11 
 
 		 316 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1617  transcriptional regulator  24.33 
 
 		 344 aa  69.7  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2121  transcriptional regulator, AraC family  35.64 
 
 		 341 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2455  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  26.06 
 
 		 344 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0069  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  26.06 
 
 		 344 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5155  AraC family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 348 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5267  AraC family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 320 aa  69.7  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.589428 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>