More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6170 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_5902  AraC family transcriptional regulator  98.6 
 
 		 356 aa  714    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.271322  normal  0.206192 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6170  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 356 aa  725    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7403  AraC family transcriptional regulator  90.82 
 
 		 316 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.708436 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3276  AraC family transcriptional regulator  46.29 
 
 		 348 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3224  AraC family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 326 aa  251  1e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3262  AraC family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 326 aa  251  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1350  AraC family transcriptional regulator  45.02 
 
 		 349 aa  247  3e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.956797  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1739  transcriptional regulator  40.45 
 
 		 329 aa  205  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.911829  normal  0.577621 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6251  transcriptional regulator, AraC family  38.76 
 
 		 331 aa  200  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5527  AraC family transcriptional regulator  44 
 
 		 363 aa  199  5e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.658693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2800  AraC family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 333 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1096  transcriptional regulator  38.73 
 
 		 331 aa  193  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3723  AraC family transcriptional regulator  44.65 
 
 		 372 aa  193  4e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.497805  normal  0.164029 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3801  AraC family transcriptional regulator  44.65 
 
 		 372 aa  193  4e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.113275 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2476  AraC family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 333 aa  189  8e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.336808 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4562  AraC family transcriptional regulator  45.02 
 
 		 360 aa  189  9e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2791  AraC family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 327 aa  186  5e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6249  transcriptional regulator, AraC family  37.38 
 
 		 356 aa  185  9e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4936  AraC family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 353 aa  181  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.712836 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1098  AraC family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 327 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2295  AraC family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 309 aa  177  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.289815 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1458  transcriptional regulator, AraC family  36.16 
 
 		 331 aa  177  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0816  transcriptional regulator, AraC family  36.16 
 
 		 327 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1093  AraC family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 331 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6275  transcriptional regulator, AraC family  36.21 
 
 		 330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1736  AraC family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 333 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.409703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3868  AraC family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 330 aa  172  5e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6738  AraC family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 333 aa  173  5e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2983  transcriptional regulator  36.07 
 
 		 331 aa  168  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00333809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2480  AraC family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 354 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6703  AraC family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 329 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3734  AraC family transcriptional regulator  32.25 
 
 		 345 aa  139  7e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3266  AraC family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 332 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3737  AraC family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 348 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6256  transcriptional regulator, AraC family  29.87 
 
 		 355 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6737  AraC family transcriptional regulator  50 
 
 		 251 aa  122  7e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4476  AraC family transcriptional regulator  32.15 
 
 		 314 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.895104 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1956  transcriptional regulator  27.13 
 
 		 316 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0685  AraC family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 344 aa  90.5  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.787747  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1153  ThiJ/PfpI domain-containing protein  28.71 
 
 		 338 aa  89.7  6e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.074608 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2808  transcriptional regulator, AraC family  34.93 
 
 		 330 aa  89  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.627946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0431  transcriptional regulator, AraC family  27.25 
 
 		 320 aa  88.2  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2046  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 324 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2657  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 324 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0449258  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2686  AraC family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 324 aa  87  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4229  transcriptional regulator  28.17 
 
 		 312 aa  87  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5675  transcriptional regulator, AraC family  29.62 
 
 		 320 aa  86.3  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0865  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  28.79 
 
 		 344 aa  86.3  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0861  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  28.79 
 
 		 344 aa  86.3  8e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2704  AraC family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 322 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.561895  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 338 aa  85.9  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0323  AraC family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 344 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0621  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  28.79 
 
 		 344 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.627949  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0640  AraC family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 322 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0069  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  28.79 
 
 		 344 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2455  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  28.79 
 
 		 344 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3583  transcriptional regulator, AraC family  30.34 
 
 		 314 aa  84.3  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.612075  normal  0.105088 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2453  transcriptional regulator  28.23 
 
 		 339 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4716  transcriptional regulator, AraC family  28.04 
 
 		 341 aa  83.6  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2043  transcriptional regulator, AraC family  27.11 
 
 		 330 aa  84  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.437  normal  0.109712 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1772  AraC family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 321 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0687  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  26.17 
 
 		 321 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1023  AraC family transcription regulator  28.84 
 
 		 345 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.243872  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0762  AraC family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 321 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2061  AraC family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 321 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.284962  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1055  AraC family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 321 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0741  AraC family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 321 aa  83.2  0.000000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.885746 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1295  AraC family transcriptional regulator  28.53 
 
 		 317 aa  82.8  0.000000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5985  transcriptional regulator  26.33 
 
 		 334 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0571562 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4646  ThiJ/PfpI domain protein  25.95 
 
 		 334 aa  82.4  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2695  transcriptional regulator, AraC family  23.39 
 
 		 344 aa  82.4  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.448661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0776  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  25.86 
 
 		 321 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5187  AraC family transcriptional regulator  28.53 
 
 		 317 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2415  AraC family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 345 aa  81.6  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3263  transcriptional regulator  29.94 
 
 		 322 aa  81.6  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5075  AraC family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 326 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0747  AraC family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 321 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.46918  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0761  AraC family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 321 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321335  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2375  AraC family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 351 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.229949  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2502  transcriptional regulator, AraC family  28.82 
 
 		 327 aa  79.7  0.00000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1481  transcriptional regulator, AraC family  27.81 
 
 		 321 aa  79.7  0.00000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4316  transcriptional regulator, AraC family  34.01 
 
 		 320 aa  79.7  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0972  AraC family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 336 aa  79.7  0.00000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3465  transcriptional regulator  32.26 
 
 		 341 aa  79  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2631  transcriptional regulator  27.84 
 
 		 347 aa  79  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0133443  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4201  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 312 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1058  transcriptional regulator, AraC family  34.19 
 
 		 322 aa  78.6  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.787566  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1704  transcriptional regulator, AraC family  26.2 
 
 		 362 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1312  transcriptional regulator, AraC family  27.79 
 
 		 338 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00374343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2640  AraC family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 329 aa  77  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0128  transcriptional regulator, AraC family  28.79 
 
 		 314 aa  77  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3160  AraC family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 316 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5069  AraC family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 316 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5208  AraC family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 316 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0566116 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5976  transcriptional regulator  28.13 
 
 		 325 aa  77  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.557743  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4246  AraC family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 319 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5267  AraC family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 320 aa  77  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.589428 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3892  transcriptional regulator, AraC family  25.67 
 
 		 332 aa  76.6  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.186679  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0152  transcriptional regulator, AraC family  30.31 
 
 		 318 aa  76.6  0.0000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.143566 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0113  transcriptional regulator, AraC family  29.93 
 
 		 354 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>