More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I1350 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007651  BTH_I1350  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 349 aa  701    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.956797  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3276  AraC family transcriptional regulator  93.98 
 
 		 348 aa  633  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3224  AraC family transcriptional regulator  93.27 
 
 		 326 aa  587  1e-166  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3262  AraC family transcriptional regulator  93.27 
 
 		 326 aa  587  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6170  AraC family transcriptional regulator  45.32 
 
 		 356 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5902  AraC family transcriptional regulator  44.22 
 
 		 356 aa  241  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.271322  normal  0.206192 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7403  AraC family transcriptional regulator  45.96 
 
 		 316 aa  229  5e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.708436 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3723  AraC family transcriptional regulator  46.89 
 
 		 372 aa  229  6e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.497805  normal  0.164029 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3801  AraC family transcriptional regulator  46.89 
 
 		 372 aa  229  6e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.113275 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4562  AraC family transcriptional regulator  48.14 
 
 		 360 aa  225  7e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5527  AraC family transcriptional regulator  46.56 
 
 		 363 aa  222  8e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.658693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4936  AraC family transcriptional regulator  46.71 
 
 		 353 aa  219  7e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.712836 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2295  AraC family transcriptional regulator  47.26 
 
 		 309 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.289815 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1739  transcriptional regulator  40.63 
 
 		 329 aa  192  5e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.911829  normal  0.577621 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6251  transcriptional regulator, AraC family  42.21 
 
 		 331 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2476  AraC family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 333 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.336808 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1096  transcriptional regulator  39.12 
 
 		 331 aa  179  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1736  AraC family transcriptional regulator  37.26 
 
 		 333 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.409703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6249  transcriptional regulator, AraC family  40.19 
 
 		 356 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6275  transcriptional regulator, AraC family  38.76 
 
 		 330 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2791  AraC family transcriptional regulator  39.27 
 
 		 327 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0816  transcriptional regulator, AraC family  40.58 
 
 		 327 aa  171  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1458  transcriptional regulator, AraC family  38.76 
 
 		 331 aa  171  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3868  AraC family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 330 aa  170  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2983  transcriptional regulator  38.44 
 
 		 331 aa  169  7e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00333809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1098  AraC family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 327 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1093  AraC family transcriptional regulator  38.63 
 
 		 331 aa  166  5e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2800  AraC family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 333 aa  165  9e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6703  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 329 aa  162  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6738  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 333 aa  157  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2480  AraC family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 354 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3734  AraC family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 345 aa  149  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3737  AraC family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 348 aa  146  6e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3266  AraC family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 332 aa  139  6e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4476  AraC family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 314 aa  124  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.895104 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6737  AraC family transcriptional regulator  52.78 
 
 		 251 aa  124  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6256  transcriptional regulator, AraC family  51.96 
 
 		 355 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0685  AraC family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 344 aa  101  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.787747  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1704  transcriptional regulator, AraC family  27.3 
 
 		 362 aa  100  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1023  AraC family transcription regulator  28.35 
 
 		 345 aa  100  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.243872  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0861  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  28.35 
 
 		 344 aa  99.8  6e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0865  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  28.35 
 
 		 344 aa  99.8  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0323  AraC family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 344 aa  99.4  8e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2455  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  28.35 
 
 		 344 aa  99.4  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0069  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  28.35 
 
 		 344 aa  99.4  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0621  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  28.35 
 
 		 344 aa  99.4  8e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.627949  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5155  AraC family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 348 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2518  transcriptional regulator, AraC family  25.85 
 
 		 336 aa  97.4  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.179818 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5245  AraC family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 328 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.608948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2640  AraC family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 329 aa  94.4  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1956  transcriptional regulator  25.32 
 
 		 316 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2605  transcriptional regulator  27.81 
 
 		 319 aa  94  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548413  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2043  transcriptional regulator, AraC family  28.79 
 
 		 330 aa  92.4  9e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.437  normal  0.109712 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5085  transcriptional regulator, AraC family  28.53 
 
 		 358 aa  92  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145128  normal  0.0831016 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2747  transcriptional regulator  27.47 
 
 		 338 aa  89.7  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5246  transcriptional regulator, AraC family  27.55 
 
 		 331 aa  88.6  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.893549 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2453  transcriptional regulator  27.78 
 
 		 339 aa  89  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1153  ThiJ/PfpI domain-containing protein  27.85 
 
 		 338 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.074608 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3120  AraC family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 324 aa  87.8  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0747  AraC family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 321 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.46918  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4046  transcriptional regulator, AraC family  27.3 
 
 		 327 aa  87.8  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.188489  normal  0.0112256 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0113  transcriptional regulator, AraC family  26.61 
 
 		 354 aa  88.2  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0761  AraC family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 321 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321335  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4095  AraC family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 336 aa  86.7  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4745  AraC family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 336 aa  86.7  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3422  AraC family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 336 aa  86.7  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5267  AraC family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 320 aa  86.3  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.589428 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5187  AraC family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 317 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2415  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 345 aa  85.1  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1008  Fis family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 346 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.254492 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4201  AraC family transcriptional regulator  29.18 
 
 		 312 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6979  transcriptional regulator, AraC family  26.67 
 
 		 319 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2375  AraC family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 351 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.229949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4646  ThiJ/PfpI domain protein  32.53 
 
 		 334 aa  84  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1844  transcriptional regulator, AraC family  30.77 
 
 		 326 aa  83.6  0.000000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5819  transcriptional regulator  28.4 
 
 		 338 aa  84  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.321081  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2502  transcriptional regulator, AraC family  29.37 
 
 		 327 aa  83.6  0.000000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5829  AraC family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 338 aa  83.2  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1219  transcriptional regulator  28.27 
 
 		 329 aa  83.2  0.000000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3465  transcriptional regulator, AraC family  28.97 
 
 		 327 aa  83.2  0.000000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0741  AraC family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 321 aa  83.2  0.000000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.885746 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4246  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 319 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2808  transcriptional regulator, AraC family  32.68 
 
 		 330 aa  82  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.627946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4365  AraC family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 324 aa  82  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1856  transcriptional regulator, AraC family  34.44 
 
 		 320 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.922042  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3004  transcriptional regulator  27.22 
 
 		 319 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000291789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1312  transcriptional regulator, AraC family  28.8 
 
 		 338 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00374343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3529  AraC family transcriptional regulator  26.33 
 
 		 336 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3129  transcriptional regulator, AraC family  26.09 
 
 		 328 aa  80.9  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.554919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4319  AraC family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 324 aa  80.9  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5514  transcriptional regulator, AraC family  33.12 
 
 		 334 aa  80.9  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.75242  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1234  AraC family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 335 aa  80.5  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1088  transcriptional regulator, AraC family  26.79 
 
 		 332 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2157  AraC family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 346 aa  79.7  0.00000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.256833  hitchhiker  0.00609835 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0972  AraC family transcriptional regulator  29.54 
 
 		 336 aa  79.7  0.00000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2990  transcriptional regulator  26.27 
 
 		 320 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5796  transcriptional regulator, AraC family  28.21 
 
 		 317 aa  79  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0227  AraC family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 324 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.583389 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3892  transcriptional regulator, AraC family  34.48 
 
 		 332 aa  78.2  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.186679  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3567  AraC family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 311 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.138362 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>