More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7403 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7403  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
316 aa  645    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.708436 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6170  AraC family transcriptional regulator  90.82 
 
 
356 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5902  AraC family transcriptional regulator  90.19 
 
 
356 aa  557  1e-157  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.271322  normal  0.206192 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3276  AraC family transcriptional regulator  46.89 
 
 
348 aa  237  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3262  AraC family transcriptional regulator  46.89 
 
 
326 aa  237  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3224  AraC family transcriptional regulator  46.89 
 
 
326 aa  237  2e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1350  AraC family transcriptional regulator  45.65 
 
 
349 aa  232  6e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.956797  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1739  transcriptional regulator  40.8 
 
 
329 aa  195  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.911829  normal  0.577621 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5527  AraC family transcriptional regulator  42.52 
 
 
363 aa  189  5e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.658693  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6251  transcriptional regulator, AraC family  39.01 
 
 
331 aa  189  5e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1096  transcriptional regulator  42.01 
 
 
331 aa  188  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4562  AraC family transcriptional regulator  44.93 
 
 
360 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3723  AraC family transcriptional regulator  44.93 
 
 
372 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.497805  normal  0.164029 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3801  AraC family transcriptional regulator  44.93 
 
 
372 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.113275 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4936  AraC family transcriptional regulator  40.13 
 
 
353 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.712836 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2476  AraC family transcriptional regulator  37.04 
 
 
333 aa  181  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.336808 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6249  transcriptional regulator, AraC family  36.46 
 
 
356 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2295  AraC family transcriptional regulator  43.34 
 
 
309 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.289815 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2791  AraC family transcriptional regulator  38.52 
 
 
327 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1098  AraC family transcriptional regulator  36.46 
 
 
327 aa  175  9e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2800  AraC family transcriptional regulator  38.38 
 
 
333 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3868  AraC family transcriptional regulator  37.46 
 
 
330 aa  171  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1736  AraC family transcriptional regulator  38.41 
 
 
333 aa  171  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.409703  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6275  transcriptional regulator, AraC family  36.77 
 
 
330 aa  172  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0816  transcriptional regulator, AraC family  37.54 
 
 
327 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6738  AraC family transcriptional regulator  34.93 
 
 
333 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1458  transcriptional regulator, AraC family  36.09 
 
 
331 aa  162  7e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2983  transcriptional regulator  34.83 
 
 
331 aa  159  7e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00333809  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1093  AraC family transcriptional regulator  34.8 
 
 
331 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2480  AraC family transcriptional regulator  36.84 
 
 
354 aa  157  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6703  AraC family transcriptional regulator  34.34 
 
 
329 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3734  AraC family transcriptional regulator  33.45 
 
 
345 aa  132  6e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252333  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3266  AraC family transcriptional regulator  31.8 
 
 
332 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6737  AraC family transcriptional regulator  50 
 
 
251 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3737  AraC family transcriptional regulator  31.17 
 
 
348 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116286  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6256  transcriptional regulator, AraC family  53.85 
 
 
355 aa  117  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4476  AraC family transcriptional regulator  44.9 
 
 
314 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.895104 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2808  transcriptional regulator, AraC family  27.87 
 
 
330 aa  89.4  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.627946  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1956  transcriptional regulator  27.46 
 
 
316 aa  89  9e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3465  transcriptional regulator  29.3 
 
 
341 aa  88.6  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4716  transcriptional regulator, AraC family  26.58 
 
 
341 aa  89  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5267  AraC family transcriptional regulator  31.45 
 
 
320 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.589428 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0431  transcriptional regulator, AraC family  29.39 
 
 
320 aa  88.2  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1153  ThiJ/PfpI domain-containing protein  28.57 
 
 
338 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.074608 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1772  AraC family transcriptional regulator  28.9 
 
 
321 aa  86.7  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2061  AraC family transcriptional regulator  28.9 
 
 
321 aa  86.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.284962  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1055  AraC family transcriptional regulator  28.9 
 
 
321 aa  86.7  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0687  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  28.9 
 
 
321 aa  86.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0762  AraC family transcriptional regulator  28.9 
 
 
321 aa  86.7  4e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2453  transcriptional regulator  30.91 
 
 
339 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0776  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 
321 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0972  AraC family transcriptional regulator  31.21 
 
 
336 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2415  AraC family transcriptional regulator  28.16 
 
 
345 aa  85.1  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0640  AraC family transcriptional regulator  27.89 
 
 
322 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1481  transcriptional regulator, AraC family  28.87 
 
 
321 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  28 
 
 
338 aa  83.6  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0685  AraC family transcriptional regulator  30.79 
 
 
344 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.787747  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0741  AraC family transcriptional regulator  27.88 
 
 
321 aa  83.2  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.885746 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0128  transcriptional regulator, AraC family  29.61 
 
 
314 aa  81.6  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2046  AraC family transcriptional regulator  28.43 
 
 
324 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2657  AraC family transcriptional regulator  28.43 
 
 
324 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0449258  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4646  ThiJ/PfpI domain protein  25.25 
 
 
334 aa  81.6  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2043  transcriptional regulator, AraC family  27.42 
 
 
330 aa  81.3  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.437  normal  0.109712 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0747  AraC family transcriptional regulator  27.89 
 
 
321 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.46918  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2686  AraC family transcriptional regulator  28.43 
 
 
324 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0761  AraC family transcriptional regulator  27.89 
 
 
321 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321335  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3120  AraC family transcriptional regulator  27.54 
 
 
324 aa  80.9  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2695  transcriptional regulator, AraC family  23.9 
 
 
344 aa  80.5  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.448661  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2502  transcriptional regulator, AraC family  27.4 
 
 
327 aa  80.9  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4316  transcriptional regulator, AraC family  34.01 
 
 
320 aa  79.7  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5675  transcriptional regulator, AraC family  29.96 
 
 
320 aa  79.7  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0861  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  29.67 
 
 
344 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0865  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  29.67 
 
 
344 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1023  AraC family transcription regulator  29.67 
 
 
345 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.243872  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2455  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  38.1 
 
 
344 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1844  transcriptional regulator, AraC family  26.78 
 
 
326 aa  78.6  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0323  AraC family transcriptional regulator  38.1 
 
 
344 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5187  AraC family transcriptional regulator  27.67 
 
 
317 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0069  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  38.1 
 
 
344 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5985  transcriptional regulator  28 
 
 
334 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0571562 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5075  AraC family transcriptional regulator  29.11 
 
 
326 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3166  AraC family transcriptional regulator  29.11 
 
 
312 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2375  AraC family transcriptional regulator  29.23 
 
 
351 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.229949  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5202  AraC family transcriptional regulator  29.11 
 
 
312 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0605893 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1058  transcriptional regulator, AraC family  34.19 
 
 
322 aa  78.6  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.787566  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0621  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  38.1 
 
 
344 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.627949  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2640  AraC family transcriptional regulator  26.33 
 
 
329 aa  77.8  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708344  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5399  transcriptional regulator  28.01 
 
 
321 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.654414  hitchhiker  0.00149287 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2704  AraC family transcriptional regulator  26.6 
 
 
322 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.561895  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5155  AraC family transcriptional regulator  30.82 
 
 
348 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0113  transcriptional regulator, AraC family  29.93 
 
 
354 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5796  transcriptional regulator, AraC family  29.18 
 
 
317 aa  75.9  0.0000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1008  Fis family transcriptional regulator  32.74 
 
 
346 aa  75.9  0.0000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.254492 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5330  AraC family transcriptional regulator  28.25 
 
 
325 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0697804 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5069  AraC family transcriptional regulator  29.75 
 
 
316 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3129  transcriptional regulator, AraC family  28.76 
 
 
328 aa  75.5  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.554919  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3160  AraC family transcriptional regulator  29.75 
 
 
316 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5208  AraC family transcriptional regulator  29.75 
 
 
316 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0566116 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4827  transcriptional regulator, AraC family  27.69 
 
 
319 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3593  AraC family transcriptional regulator  26.13 
 
 
342 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>