More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4476 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4476  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 314 aa  638    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.895104 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3737  AraC family transcriptional regulator  44.48 
 
 		 348 aa  224  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2476  AraC family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 333 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.336808 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6703  AraC family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 329 aa  163  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3868  AraC family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 330 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0816  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 327 aa  150  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1458  transcriptional regulator, AraC family  36.25 
 
 		 331 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2983  transcriptional regulator  35.83 
 
 		 331 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00333809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1736  AraC family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 333 aa  139  7e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.409703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1093  AraC family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 331 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6738  AraC family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 333 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1739  transcriptional regulator  30.03 
 
 		 329 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.911829  normal  0.577621 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2800  AraC family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 333 aa  127  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6251  transcriptional regulator, AraC family  31.05 
 
 		 331 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1096  transcriptional regulator  28.71 
 
 		 331 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1350  AraC family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 349 aa  122  8e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.956797  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3224  AraC family transcriptional regulator  34.77 
 
 		 326 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3262  AraC family transcriptional regulator  34.77 
 
 		 326 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3266  AraC family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 332 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3276  AraC family transcriptional regulator  34.77 
 
 		 348 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2791  AraC family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 327 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1098  AraC family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 327 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6170  AraC family transcriptional regulator  31.83 
 
 		 356 aa  116  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5902  AraC family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 356 aa  116  6e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.271322  normal  0.206192 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4936  AraC family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 353 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.712836 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6249  transcriptional regulator, AraC family  29.15 
 
 		 356 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3734  AraC family transcriptional regulator  50 
 
 		 345 aa  114  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6275  transcriptional regulator, AraC family  29.08 
 
 		 330 aa  114  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6256  transcriptional regulator, AraC family  29.5 
 
 		 355 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5527  AraC family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 363 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.658693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2480  AraC family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 354 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7403  AraC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 316 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.708436 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6737  AraC family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 251 aa  104  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3801  AraC family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 372 aa  99  9e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.113275 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3723  AraC family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 372 aa  99  9e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.497805  normal  0.164029 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4562  AraC family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 360 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2295  AraC family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 309 aa  93.6  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.289815 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0879  AraC/XylS family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 299 aa  80.1  0.00000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000031891  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2003  AraC family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 342 aa  79.3  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0125  transcriptional regulator, AraC family  36.08 
 
 		 300 aa  77  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2221  transcriptional regulator  41.05 
 
 		 330 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5407  transcriptional regulator, AraC family  35.19 
 
 		 313 aa  75.9  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.439375  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3394  transcriptional regulator  36.96 
 
 		 320 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.482598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3383  transcriptional regulator  36.96 
 
 		 320 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.690138  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3445  transcriptional regulator  36.96 
 
 		 320 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.68449 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6692  transcriptional regulator, AraC family  30.3 
 
 		 313 aa  74.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.178977 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 338 aa  74.3  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4046  transcriptional regulator, AraC family  30.63 
 
 		 327 aa  73.6  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.188489  normal  0.0112256 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2578  AraC family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 322 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0640  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 322 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2415  AraC family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 345 aa  72.8  0.000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0936  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 289 aa  72.8  0.000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.352467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2704  AraC family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 322 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.561895  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2856  AraC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 314 aa  70.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1219  transcriptional regulator  30.43 
 
 		 329 aa  71.6  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2808  transcriptional regulator, AraC family  22.15 
 
 		 330 aa  71.2  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.627946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1836  transcriptional regulator  30.18 
 
 		 327 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2046  AraC family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 324 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2657  AraC family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 324 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0449258  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5819  transcriptional regulator  23.89 
 
 		 338 aa  70.1  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.321081  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2157  AraC family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 346 aa  70.5  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.256833  hitchhiker  0.00609835 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2686  AraC family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 324 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1088  transcriptional regulator, AraC family  37.63 
 
 		 332 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4788  AraC family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 344 aa  69.3  0.00000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.139915  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0600  two component transcriptional regulator, AraC family  29.92 
 
 		 546 aa  69.3  0.00000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2062  transcriptional activator FtrA  32.91 
 
 		 329 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1958  response regulator receiver protein  31.58 
 
 		 530 aa  68.6  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471781  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1705  helix-turn-helix domain-containing protein  23.01 
 
 		 320 aa  68.9  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.29723  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5985  transcriptional regulator  39.13 
 
 		 334 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0571562 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3467  AraC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 323 aa  68.6  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1602  transcriptional regulator  31.91 
 
 		 330 aa  68.6  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5085  transcriptional regulator, AraC family  26.25 
 
 		 358 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145128  normal  0.0831016 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2043  transcriptional regulator, AraC family  25.23 
 
 		 330 aa  67.8  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.437  normal  0.109712 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1856  transcriptional regulator, AraC family  29.94 
 
 		 320 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.922042  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3170  transcriptional regulator, AraC family  30.53 
 
 		 332 aa  68.2  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.777646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2990  transcriptional regulator  30.52 
 
 		 320 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1165  AraC family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 278 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0113  transcriptional regulator, AraC family  27.95 
 
 		 354 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2212  AraC family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 302 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5179  transcriptional regulator, AraC family  36.79 
 
 		 352 aa  68.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0937  transcriptional regulator, AraC family  30.61 
 
 		 291 aa  67.8  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.440102  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3506  AraC family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 330 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.939341  normal  0.0589755 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2418  transcriptional regulator, AraC family  34.31 
 
 		 338 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0685  AraC family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 344 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.787747  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1008  Fis family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 346 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.254492 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4194  AraC family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 335 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0109567  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2695  transcriptional regulator, AraC family  33.7 
 
 		 344 aa  67  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.448661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1394  two component AraC family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 523 aa  67  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0042226  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2139  transcriptional regulator, AraC family  34.69 
 
 		 282 aa  67  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.669919  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3318  AraC family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 345 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4316  transcriptional regulator, AraC family  32.93 
 
 		 320 aa  66.6  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3975  transcriptional regulator  39.02 
 
 		 337 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2824  transcriptional regulator, AraC family  34.31 
 
 		 338 aa  66.2  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.60964 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4484  transcriptional regulator  33.68 
 
 		 361 aa  66.2  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3751  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  32.65 
 
 		 198 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000128468 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2197  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 314 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3778  AraC family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 329 aa  66.2  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1355  transcriptional regulator, AraC family  29.22 
 
 		 303 aa  66.2  0.0000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000118066  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0513  AraC family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 387 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1312  AraC family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 309 aa  66.2  0.0000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>